Ključna razlika između početnice i promotora je u tome što je početnica komercijalno sintetizirana kratka DNK sekvenca koja se koristi u PCR-u za umnožavanje ciljane DNK sekvence dok je promotor specifična DNK sekvenca koja osigurava sigurno početno mjesto vezivanja za RNK polimeraza i faktori transkripcije kako bi se pokrenula transkripcija.
Primer i promotor dvije su vrste DNA sekvenci. Primer je mali fragment DNK potreban za lančanu reakciju polimerazom (PCR). Ima kratke nukleotidne sekvence komplementarne bočnom kraju DNA lanca. Postoje dvije vrste početnica i one djeluju kao početne točke za sintezu novih DNK lanaca. Nasuprot tome, promotor je specifična sekvenca DNA smještena uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije gena. Izravno djeluje s komponentama transkripcijskog mehanizma kao što su RNA polimeraza i transkripcijski faktori kako bi kontrolirali transkripciju DNA. Stoga se RNA polimeraza i drugi faktori transkripcije vežu za sekvencu promotora i započinju transkripciju.
Što je Primer?
Primeri su kratke sekvence DNA dizajnirane za umnožavanje ciljnih sekvenci DNA. Strukturno, posjeduju kratke nukleotidne sekvence komplementarne bočnim krajevima dvostrukih lanaca DNA. Obično su dugi oko 20 nukleotida. Tijekom PCR-a, Taq polimeraza katalizira dodavanje nukleotida u već postojeći slijed nukleotida. Stoga, primeri služe kao početne točke za sintezu novih niti. Taq polimeraza djeluje samo u smjeru od 5’ do 3’. Dakle, sinteza DNK također se odvija u istom smjeru od 5’ do 3’. Budući da je DNA dvolančana, u PCR-u su potrebne dvije vrste početnica. Oni su poznati kao prednji početni i obrnuti početni, temeljeni na smjeru elongacije početnice tijekom sinteze DNK.
Slika 01: Primeri
Forward primer spaja se s antisens DNA lancem i pokreće sintezu + lanca gena u smjeru od 5’ do 3’. Ima kratku nukleotidnu sekvencu koja je komplementarna 3’ bočnom kraju antisense lanca. Reverzni primer spaja se sa osjetilnim lancem i inicira sintezu komplementarnog lanca kodirajućeg lanca, što je - lanac gena u smjeru od 5' do 3'. Stoga je reverzni primer dizajniran komplementaran 3' kraju kodirajućeg lanca. I reverzni i prednji početnici važni su za proizvodnju milijuna do milijardi kopija određenih regija DNK koje su ciljane ili zainteresirane.
Što je promotor?
Promotor je sekvenca DNA smještena uzvodno ili na 5' kraju mjesta inicijacije transkripcije gena. Osigurava vezno mjesto za RNA polimerazu i određene regulatorne elemente kako bi se pokrenula transkripcija gena. To je regulatorni niz potreban za uključivanje ili isključivanje gena. U promotoru postoji specifična nukleotidna sekvenca. Može imati 100-1000 parova baza. Promotor pokazuje smjer transkripcije. Štoviše, označava smisaoni niz koji treba transkribirati.
Slika 02: Promotor gena
Postoje tri vrste promotorskih elemenata kao jezgreni promotor, proksimalni promotor i distalni promotor. Glavni promotor je minimalni dio promotora koji je potreban za pokretanje transkripcije. Nalazi se najbliže početnom kodonu. TATA kutija je očuvana regija koja se nalazi u mnogim promotorima jezgre eukariota. Nalazi se 25 do 35 parova baza uzvodno od mjesta početka transkripcije. Proksimalni promotor se nalazi više uzvodno od jezgrenog promotora. Općenito, nalazi se 250 parova baza uzvodno od početnog kodona i sadrži primarne regulatorne elemente. Distalni promotor nalazi se uzvodno od proksimalnog promotora i sadrži dodatne regulatorne elemente. Bakterijski promotori imaju dva elementa kratke sekvence u svojim promotorima. TATAAT je konsenzusna sekvenca smještena na -10 bakterijskog promotora dok je TTGACA konsenzusna sekvenca na -35. Poznati su kao element -10 i element -35.
Koje su sličnosti između Primera i Promotera?
- Primer i promotor dvije su vrste DNK sekvenci.
- Sastoje se od sekvenci nukleotida.
- I početnica i promotor važni su za ekspresiju gena.
Koja je razlika između Primera i Promotera?
Primer je kratki nukleotidni niz dizajniran za umnožavanje ciljne DNA. Nasuprot tome, promotor je specifična regulatorna sekvenca DNA koja se nalazi uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije gena. Dakle, ovo je ključna razlika između primera i promotora. Primeri su dugački oko 20 parova baza dok promotor može imati 100 -1000 parova baza. Funkcionalno, početnice služe kao početne sekvence za sintezu novog lanca, dok promotori kontroliraju transkripciju gena osiguravanjem veznih mjesta za RNA polimerazu i druge faktore transkripcije.
Štoviše, promotor je definiran kao smjer transkripcije i označava smisleni lanac gena. Strukturno, početnica je kratka, jednolančana sekvenca DNA dok je promotor dugačka dvolančana sekvenca DNA.
Sljedeća info-grafika prikazuje više usporedbi povezanih s razlikom između primera i promotora.
Sažetak – Primer vs Promotor
Primeri su kratke nukleotidne sekvence komplementarne bočnim krajevima dvolančane ciljne DNA. U PCR-u se koriste dvije vrste početnica. Oni služe kao početne sekvence za sintezu novih niti. Primeri su komercijalno dizajnirani i temperaturno su stabilni. S druge strane, promotor je regulatorna sekvenca gena smještena uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije. Promotori kontroliraju transkripciju gena. Oni osiguravaju mjesta vezanja za RNA polimerazu i transkripcijske faktore za iniciranje transkripcije. Dakle, ovo je sažetak razlike između primera i promotora.
