Ključna razlika između izoshizomera i izokaudomera je u tome što izoshizomeri prepoznaju i cijepaju isto mjesto restrikcije ili prepoznavanja dok izokaudomeri prepoznaju malo drugačija restrikcijska mjesta i cijepaju na istom mjestu.
Restrikcijski enzimi ili restrikcijske endonukleaze vrsta su nukleaza koje cijepaju dvolančanu DNA. Oni su u stanju prepoznati specifične sekvence koje se nazivaju restrikcijskim mjestima, a koje su palindromskog porijekla. Bakterije proizvode restrikcijske enzime protiv stranih patogena, osobito protiv virusa. To je oblik obrambenog mehanizma koji pokazuju bakterije. Ovisno o strukturi enzima i prirodi rezova, postoje tri vrste restrikcijskih enzima kao restrikcijski enzimi tipa I, restrikcijski enzimi tipa II i restrikcijski enzimi tipa II. Štoviše, ovisno o biokemijskoj aktivnosti i izvoru izolacije, postoje tri vrste restrikcijskih enzima kao izoshizomeri, neoshizomeri i izokaudomeri.
Što su izoshizomeri?
Izoshizomeri su vrsta restrikcijskih enzima koji dolaze iz različitih izvora, ali prepoznaju i cijepaju isto restrikcijsko mjesto u DNK. Prema tome, dva izoshizomera imaju isto mjesto prepoznavanja. Oni se cijepaju na istom mjestu, tako da su specifični za istu sekvencu prepoznavanja. Na primjer, restrikcijski enzimi SphI i BbuI dva su izoshizomera koji prepoznaju i cijepaju na CGTAC/G.
Slika 01: Restrikcijski enzim
Još jedan par izoshizomera je HpaII i MspI. Obojica prepoznaju sekvencu 5'-CCGG-3' i cijepaju DNK. Štoviše, Bsp EI i Acc III također su izoshizomeri koji potječu iz vrste Bacillus odnosno Acinetobacter calcoaceticus. Izolacija izoshizomera može se izvesti iz različitih bakterija. Budući da potječu od različitih bakterija, njihovi se uvjeti ograničenja mogu međusobno razlikovati.
Što su izokaudomeri?
Izokaudomeri su vrsta restrikcijskih enzima koji prepoznaju nešto drugačije sekvence, ali cijepaju se na istom mjestu da bi proizveli iste krajeve. Izokaudomeri također dolaze iz različitih bakterija. Sau3a i BamHI su par izokaudomera. Oni proizvode 5’-GATC-3’ ljepljivi kraj nakon cijepanja istog mjesta. Drugi par izokaudomera je NcoI iz Nocardia corallina i PagI iz Pseudomonas alcaligenes. Ova dva enzima također se vežu na različite sekvence prepoznavanja, ali režu na istom mjestu i proizvode iste ljepljive krajeve. Stoga su rezni krajevi koji se proizvode međusobno kompatibilni i mogu se povezivati jedan s drugim. XhoI, PspXI i SalI također su izokaudomeri.
Koje su sličnosti između izoshizomera i izokaudomera?
- Izoshizomeri i izokaudomeri dvije su vrste restrikcijskih enzima.
- Dva izoshizomera imaju isto mjesto probave, slično dvama izokaudomerima koji imaju isto mjesto probave.
- Prokariotski su porijeklom.
- Oboje imaju mjesto za prepoznavanje ograničenja kao i mjesto za probavu.
- Proizvode krajeve koji su međusobno kompatibilni.
- Osim toga, ovi enzimi su korisni alati u tehnologiji rekombinantne DNA.
Koja je razlika između izoshizomera i izokaudomera?
Izoshizomeri su restrikcijski enzimi koji prepoznaju isti slijed DNA i cijepaju se na istom restrikcijskom mjestu, dok su izokaudomeri restrikcijski enzimi koji prepoznaju malo drugačije slijedove DNA, ali proizvode iste ljepljive krajeve rezanjem na istom mjestu. Dakle, ovo je ključna razlika između izoshizomera i izokaudomera.
Infografika u nastavku tabelarno prikazuje razliku između izoshizomera i izokaudomera.
Sažetak – Isoschizomers vs Isocaudomers
Izoshizomeri su restrikcijski enzimi koji prepoznaju isti slijed DNK i cijepaju se na istom mjestu. S druge strane, izokaudomeri su restrikcijski enzimi koji prepoznaju nešto drugačije sekvence i cijepaju se na istom mjestu stvarajući iste krajeve. Dakle, ovo je ključna razlika između izoshizomera i izokaudomera. SphI, BbuI, HpaII i MspI nekoliko su primjera izoshizomera, dok su Sau3a i BamHI dva primjera izokaudomera. I izoshizomere i izokaudomere prirodno proizvode bakterije.
