Ključna razlika između izoshizomera i neoshizomera je u tome što su izoshizomeri restrikcijski enzimi koji imaju istu sekvencu prepoznavanja i cijepaju DNK na istim pozicijama, dok su neoshizomeri restrikcijski enzimi koji imaju istu sekvencu prepoznavanja, ali cijepaju DNK na različitim pozicijama.
Restrikcijski enzimi ili restrikcijske endonukleaze su enzimi koji cijepaju DNA u fragmente na ili u blizini specifičnih mjesta prepoznavanja. Režu DNK na restrikcijskim mjestima. Restrikcijski enzimi obično se klasificiraju u pet skupina na temelju strukture, režu li svoj DNA supstrat na mjestu prepoznavanja i jesu li mjesta prepoznavanja i cijepanja odvojena jedno od drugog. Već je identificirano više od 3600 restrikcijskih endonukleaza. Otprilike 800 restrikcijskih enzima dostupno je na tržištu. Izoshizomeri i neoshizomeri dvije su vrste restrikcijskih enzima temeljene na specifičnosti mjesta prepoznavanja i cijepanja.
Što su izoshizomeri?
Izoshizomeri su restrikcijski enzimi koji imaju istu sekvencu prepoznavanja i cijepaju DNK na istim pozicijama. Ovi restrikcijski enzimi imaju istu specifičnost. Prvi otkriveni restrikcijski enzim koji prepoznaje određenu sekvencu poznat je kao prototip, dok se svi kasnije identificirani restrikcijski enzimi koji prepoznaju tu istu sekvencu nazivaju izoshizomeri. Međutim, izoshizomeri se mogu razlikovati u preferencijama mjesta, uvjetima reakcije, osjetljivosti na metilaciju i aktivnosti zvijezde. Izoshizomeri su izolirani iz različitih sojeva bakterija. Stoga mogu zahtijevati različite reakcijske uvjete. U nekim slučajevima samo jedan od para izoshizomera može prepoznati i metilirane i nemetilirane oblike restrikcijskih mjesta. S druge strane, drugi restrikcijski enzim može prepoznati samo nemetilirani oblik restrikcijskog mjesta. Ova posebna značajka izoshizomera pomaže u identifikaciji stanja metilacije restrikcijskog mjesta dok ga izolira od bakterijskog stanja.
Na primjer, AgeI i BshT1 prepoznaju i cijepaju 5’-A↓CCGGT u istom uzorku. HpaII i MSPI su drugi parovi izoshizomera. Obojica prepoznaju sekvencu 5’-C↓CGG-3’ kada je nemetilirana. Ali kada je drugi C niza metiliran, samo MSPI može prepoznati ovaj niz dok ga HpaII ne može prepoznati.
Što su neoshizomeri?
Neoshizomeri su restrikcijski enzimi koji imaju isti slijed prepoznavanja, ali cijepaju DNK na različitim pozicijama. U nekim posebnim molekularno-biološkim primjenama, ovo je vrlo korisna značajka. Neoshizomeri su podskup izoshizomera. Dobro poznati primjeri neoshizomera su SmaI (5’-CCC↓GGG-3’) i XmaI (5’-C↓CCGGG-3’); oba prepoznaju 5’-CCCGGG-3’ sekvencu, ali ih cijepaju na drugom položaju. Stoga ova dva restrikcijska enzima stvaraju različite vrste završetaka. U ovom slučaju, SmaI proizvodi tupe krajeve, a XmaI proizvodi 5' stršeće krajeve.
Slika 01: Neoshizomeri
Još jedan primjer je par restrikcijskih enzima MaeII i Tail. Prototip MaeII (A↓CGT) proizvodi fragmente DNA s 2-baznim nastavkom 5', a neoschizomer Tail (ACGT↓) proizvodi DNA fragmente s 4-baznim nastavkom3'.
Koje su sličnosti između izoshizomera i neoshizomera?
- Izoshizomeri i neoshizomeri dvije su vrste restrikcijskih enzima.
- Nalaze se uglavnom u prokariotima.
- Oni su dio sustava restrikcije-modifikacije (RM) koji se nalazi u bakterijama i arhejama.
- Oboje su proteinske molekule.
- Oboje cijepaju DNK na fragmente.
Koja je razlika između izoshizomera i neoshizomera?
Izoshizomeri su restrikcijski enzimi koji imaju isti slijed za prepoznavanje i cijepaju DNK na istim pozicijama, dok su neoshizomeri restrikcijski enzimi koji imaju isti slijed za prepoznavanje, ali cijepaju DNK na različitim pozicijama. Dakle, ovo je ključna razlika između izoshizomera i neoshizomera. Nadalje, izoshizomeri imaju iste specifičnosti dok neoshizomeri imaju različite specifičnosti.
Sljedeća infografika navodi razlike između izoshizomera i neoshizomera u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – Isoshizomers vs Neoschizomers
Restrikcijski enzimi su enzimi koji režu DNK. Također se nazivaju i molekularne škare. Postoje različite vrste restrikcijskih enzima. Na temelju mjesta prepoznavanja i specifičnosti cijepanja, restrikcijski enzimi su dvije vrste kao izoshizomeri i neoshizomeri. Izoshizomeri imaju istu sekvencu prepoznavanja i cijepaju DNK na istim pozicijama, dok neoshizomeri imaju istu sekvencu prepoznavanja, ali cijepaju DNK na različitim pozicijama. Dakle, ovo je ključna razlika između izoshizomera i neoshizomera.
