siRNA vs miRNA
RNK su vrlo važne molekule koje pomažu u izgradnji života organizama. Nedavno su znanstvenici otkrili male RNA zvane RNA interferencija ili RNAi, koje djeluju nakon transkripcije kako bi kontrolirale ekspresiju gena. Dva glavna tipa malih RNA su mikro RNA ili miRNA i mala interferirajuća RNA ili siRNA. Ove molekule u osnovi reguliraju ekspresiju gena potiskivanjem ciljnog gena. I miRNA i siRNA imaju vrlo slične puteve biogeneze, iako među njima postoje neke razlike. Porijeklo miRNA i siRNA je iz molekula dsRNA. Zrele miRNA su strukturno slične molekulama siRNA.
miRNA
Mikro RNA ili miRNA male su RNA molekule koje posreduju u konačnoj provjeri translacijske regulacije gena. Deregulacija miRNA može dovesti do razvoja raka i drugih bolesti. Stoga je pravilna regulacija informacija kodiranih u nekodirajućoj regiji miRNA vrlo kritična u mnogim temeljnim staničnim procesima.
siRNA
siRNA se također nazivaju kratkom interferirajućom ili utišavajućom RNA i sastoje se od dvolančane RNA s 20 do 25 parova baza. Glavna uloga siRNA je ometanje ekspresije specifičnih gena s komplementarnim nukleotidnim sekvencama. siRNA se sastoji od kratke dvolančane RNA s fosforiliranim 5’ krajevima i hidroksiliranim 3’ krajevima s dva nukleotida koji se nadvijaju.
Koja je razlika između siRNA i miRNA?
• miRNA izvedena iz specifičnih genomskih lokusa, dok je siRNA izvedena iz mRNA, transpozona, virusa ili heterokromatske DNA.
• Sinteza miRNA obrađuje se iz dužih prekursora ukosnih transkripata (primarni nuklearni slijed miRNA pomoću RNaze III endonukleaze), dok se sinteza miRNA obrađuje iz dugih bimolekularnih dupleksa RNA.
• Svaka molekula prekursora miRNA ukosnice proizvodi jedan dupleks miRNA, dok svaka molekula prekursora siRNA proizvodi više dupleksa siRNA.
• siRNA sekvence rijetko su očuvane, dok su miRNA sekvence dobro očuvane.
• Sve baze unutar siRNA doprinose njezinoj ciljanoj specifičnosti, dok samo 5’ polovica miRNA doprinosi njezinoj ciljanoj specifičnosti.
• miRNA se često veže za 3' neprevedenu regiju ciljnih transkripata, dok siRNA formiraju komplementarni dupleks bilo gdje duž ciljne mRNA.
• miRNA specificira 'hetero- utišavanje' dok se siRNA koristi za 'automatsko utišavanje'.
• miRNA djeluje kao signal za sprječavanje prijevoda, dok siRNA fizički sprječava prijevod.
