Ključna razlika – genomika naspram proteomike
Genomika i proteomika dvije su važne grane molekularne biologije. Genom je genetski materijal organizma. Sadrži gene ispisane genetskim informacijama organizama (genetski kodovi). Studije koje se provode kako bi se pronašle informacije o genomu poznate su kao genomika. Nukleotidna sekvenca gena određuje sekvencu aminokiselina proteina putem genetskog koda. Geni se prepisuju u mRNA, a mRNA se prevode kako bi proizveli potrebne proteine. Proteom predstavlja ukupno izražene proteine organizma. Studije koje se provode kako bi se pronašle karakteristike, strukture, funkcije i ekspresije cjelokupnog skupa proteina u stanici poznate su kao proteomika. Dakle, ključna razlika između genomike i proteomike je u tome što je genomika grana molekularne biologije koja proučava gene organizma, dok je proteomika grana molekularne biologije koja proučava ukupne proteine u stanici. Genomske studije važne su za razumijevanje strukture, funkcije, položaja, regulacije gena organizma. Studije proteomike su korisnije jer su proteini stvarne funkcionalne molekule u stanicama i predstavljaju stvarna fiziološka stanja.
Što je genomika?
Genomika je proučavanje cjelokupnog genoma organizma. To je važna grana molekularne biologije koja se bavi tehnologijom rekombinantne DNK, sekvenciranjem DNK i bioinformatikom za istraživanje strukture i funkcije genoma (kompletnog skupa DNK organizma). DNK se sastoji od četiri baze, a genetske informacije unutar gena zapisane su na četiri osnovna jezika koji su potrebni za stvaranje organizma. Geni su odgovorni za stvaranje proteina, a oni su jedinice DNK koje nose upute za stvaranje određenog proteina ili skupa proteina u stanici. Stoga su studije koje se provode o genima doista važne za razumijevanje složenih bolesti, genetskih poremećaja, mutacija, važnih genskih regulacija, interakcija između gena i čimbenika okoliša, dijagnoze bolesti, razvoja tretmana i terapija itd. Stoga su genomske studije vrlo važno jer se bavi svim genima i njihovim međudjelovanjima i ponašanjima.
Slika 01: Upotreba genomike
Što je proteomika?
Proteini su bitne makromolekule koje se nalaze u stanicama. Oni su važni za mnoge fiziološke funkcije koje se odvijaju u organizmu. Gotovo sve biokemijske reakcije kataliziraju proteini prisutni u stanicama. Geni su pohranjeni s genetskim uputama za proizvodnju proteina. Genetski kod se transformira u sekvencu aminokiselina koja određuje određeni protein. Ovaj proces je poznata ekspresija gena. Kada je potrebno, geni se izražavaju i sintetiziraju kao proteini. Cijeli skup proteina stanice poznat je kao proteom. Proučavanje proteoma stanice poznato je kao proteomika. Strukture, karakteristike, interakcije i funkcije proteina proučavaju se pod proteomikom kako bi se istražilo kako proteini utječu na stanične procese.
Organizmi sadrže tisuće različitih proteina koji služe različitim funkcijama u stanicama. Genomske studije daju ključne informacije za provođenje proteomskih studija budući da geni kodiraju za molekule mRNA, a mRNA kodiraju za proteine. Studije proteomike važne su u mnogim područjima; ovo je posebno korisno u biologiji raka, gdje se može koristiti za otkrivanje abnormalnih proteina koji dovode do raka.
Slika 02: Sinteza proteina
Koja je razlika između genomike i proteomike?
Genomika protiv proteomike |
|
| Genomika je proučavanje genoma organizma. Geni se proučavaju pod genomikom. | Proteomika je proučavanje cjelokupnih proteina stanice. Proteini se proučavaju pod proteomikom. |
| Područja učenja | |
| Genomika pokriva područje mapiranja genoma, sekvenciranja, analize ekspresije, analize strukture gena itd. | Proteomika pokriva karakterizaciju proteina, proučavanje strukture i funkcije proteina, itd. |
| Klasifikacija | |
| Dvije glavne vrste nazvane strukturna genomika i funkcionalna genomika. | Tri glavne kategorije nazvane strukturna proteomika, funkcionalna proteomika i proteomika ekspresije. |
| Priroda materijala za učenje | |
| Genom je konstantan. Svaka stanica organizma ima isti set gena. | Proteom je dinamičan i varira. Skup proteina proizvedenih u različitim tkivima varira ovisno o ekspresiji gena. |
Sažetak – Genomika protiv proteomike
Genomika je proučavanje kompletnog genoma organizma. Proteomika je grana molekularne biologije koja proučava kompletan skup proteina izraženih u stanici kako bi se razumjela struktura i funkcija proteina i kako proteini utječu na stanične procese. Genomika ne može objasniti stvarna stanja stanica zbog posttranslacijskih modifikacija do kojih je došlo tijekom sinteze proteina. Stoga je proteomika važna za razumijevanje stvarnih uvjeta i funkcija stanica. Ovo je razlika između genomike i proteomike.
