Ključna razlika između proteomike i metabolomike je u tome što je proteomika proučavanje svih proteina u organizmu, dok je metabolomika proučavanje svih metabolita u organizmu.
Genomika je proučavanje genetske strukture organizma. Proteomika i metabolomika dvije su omične znanosti povezane s genomikom. Proteom se odnosi na sve proteine u stanici ili organizmu. Metabolom se, s druge strane, odnosi na sve metabolite organizma. Dakle, proučavanje proteoma je proteomika, dok je proučavanje metaboloma metabolomika. I proteomika i metabolomika važni su u dijagnostici bolesti te u karakterizaciji i probiru organizama. Štoviše, oba su povezana u mnogim aspektima stanične biologije, posebno u staničnoj signalizaciji, razgradnji i stvaranju proteina i posttranslacijskoj modifikaciji.
Što je proteomika?
Proteom je ukupni proteinski komplement u stanici, tkivu ili organizmu. Stoga je proteomika proučavanje proteoma organizma. U proteomici se analiziraju različite karakteristike proteina. Stoga se proteomika uglavnom usredotočuje na strukturu, orijentaciju, funkcije, interakcije proteina, modifikacije, primjene i važnost proteina. Zbog toga se trenutno provode mnogi istraživački projekti u području proteomike.
Prve proteomske studije napravljene su kako bi se identificirao sadržaj proteina u Escherichia coli. Mapiranje ukupnog sadržaja proteina učinjeno je pomoću dvodimenzionalnih (2D) gelova. Nakon uspjeha ovog projekta, znanstvenici su prešli na karakterizaciju ukupnog sadržaja proteina u životinja kao što su zamorci i miševi. Trenutačno se mapiranje ljudskih proteina provodi pomoću 2D gel elektroforeze.
Postoje mnoge prednosti proučavanja proteomike budući da su proteini vodeće molekule većine aktivnosti zbog svojstva katalizatora proteina. Stoga proučavanje cjelovitih proteina može pružiti informacije o zdravstvenom statusu organizma. Štoviše, proteomika ima mnoge primjene u označavanju genoma, identifikaciji i dijagnostici bolesti, provođenju studija ekspresije proteina tijekom eksperimentiranja i studija modifikacija proteina i interakcija, itd.
Slika 01: Proteomika
Postoje različite tehnike uključene u proteomiku, uključujući ekstrakciju ukupnog proteina, njihovo odvajanje pomoću 2D gel elektroforeze, sekvenciranje ekstrahiranih proteina korištenjem metoda kao što je Edmundova metoda sekvenciranja ili spektrometrija mase i analiza strukturnih i funkcionalnih svojstva proteina korištenjem računalnog softvera i bioinformatičkih alata.
Što je metabolomika?
Metabolomika je proučavanje svih metabolita u stanici, tkivu ili organizmu. Uključuje identifikaciju i kvantifikaciju staničnih metabolita korištenjem različitih naprednih analitičkih i statističkih alata. Metabolomika je važna studija jer otkriva informacije o metabolizmu organizma.
Slika 02: Metabolomika
Za proučavanje supstrata i proizvoda metaboličkih reakcija, metabolomika koristi spektrometriju mase kao analitičku platformu. Masena spektrometrija daje metabolite i njihove koncentracije, odražavajući stvarno biokemijsko stanje stanica ili tkiva. Stoga se metabolomika može smatrati najboljim prikazom molekularnog fenotipa organizma. Osim ovih, metabolomika se može smatrati proširenjem proteomike jer većina metabolita nastaje uslijed aktivnosti enzima koji su proteini.
Koje su sličnosti između proteomike i metabolomike?
- Proteomika i metabolomika dvije su omične znanosti povezane s genomikom.
- Metabolomika se može smatrati proširenjem proteomike.
- Proteom i metabolom usko su isprepleteni s mnogim studijama.
Koja je razlika između proteomike i metabolomike?
Proteomika je opsežno proučavanje proteina, uključujući njihovu strukturu i funkciju, unutar stanice ili organizma. U međuvremenu, metabolomika je proučavanje profila metabolita u stanici, tkivu ili organizmu pod određenim skupom uvjeta. Dakle, ovo je ključna razlika između proteomike i metabolomike. Osim toga, proteomika se uglavnom bavi kompletnim skupom proteina, dok se metabolomika uglavnom bavi kompletnim skupom metabolita, uključujući raznolik niz malih molekula kao što su peptidi, ugljikohidrati, lipidi, nukleozidi i katabolički produkti egzogenih spojeva, itd. Dakle, ovo je još jedna razlika između proteomike i metabolomike.
Donja infografika sažima razliku između proteomike i metabolomike.
Sažetak – Proteomika protiv metabolomike
Živi organizmi mogu se proučavati pomoću njihovog genoma, proteina i metabolita. Genomika, proteomika i metabolomika su tri područja koja proučavaju genetski sastav, proteine i metabolite stanice odnosno organizma. Proteomika je važna jer je dinamički odraz i gena i okoliša. Metabolomika je vrlo važna jer izravno odražava trenutni status biokemijske reakcije stanica ili metabolički status organizma. Dakle, ovo sažima razliku između proteomike i metabolomike.
