Ključna razlika između ciljane i neciljane proteomike je u tome što ciljana proteomika ima za cilj mjerenje obilja određenog proteina, dok neciljana proteomika ne cilja specifični protein.
Proteomika je opsežno proučavanje proteina, njihovih struktura i funkcija. Proučava cjelokupni proteinski komplement u stanici, tkivu ili organizmu pod određenim uvjetima. Postoje dvije vrste proteomike kao ciljana proteomika i neciljana proteomika.
Što je ciljana proteomika?
Kao što joj ime kaže, ciljana proteomika cilja na određeni protein ili peptid u složenoj mješavini proteina za analizu. Zatim analizira prisutnost i količinu tog prethodno odabranog specifičnog proteina. Ova metoda je moguća samo za jedan uzorak ili za više uzoraka. Ova metoda je prikladna čak i za određenu skupinu proteina. To rezultira preciznijim, kvantitativnim i osjetljivijim podacima. Štoviše, masena spektrometrija u kombinaciji s ciljanom proteomikom proizvodi preciznija i pouzdana mjerenja. Ova metoda za analizu koristi trostruki kvadrupolni maseni spektrometar (QQQ).
Slika 01: Proteomika
Ciljana proteomika prikladna je metoda ako želite provjeriti je li knockdown meta stvarno srušena ili kada želite kvantificirati određeni protein/peptid u krvnom serumu, cerebralnoj tekućini ili staničnom lizatu itd. Također možete koristite ga ako želite provjeriti je li određeni protein različito izražen u uzorcima ili tijekom eksperimenta s vremenskim tijekovima.
Što je neciljana proteomika?
Neciljana proteomika, kao što naziv spominje, ne cilja određeni protein ili peptid za svoju analizu. Proteomika otkrića je drugi naziv za neciljanu proteomiku. Zapravo, to je više 'globalna' analiza. Općenito, izvođenje neciljane proteomike je odgovor na pitanje "koji se protein ili proteini nalaze u ovom uzorku ili više uzoraka?". Ova metoda nije osjetljiva kao ciljana proteomika. Ali može identificirati i mjeriti mnoge proteine uključujući nove proteine. Neciljana proteomika može proizvesti i kvantitativna i kvalitativna mjerenja.
Koje su sličnosti između ciljane i neciljane proteomike?
- I ciljana i neciljana proteomika mjere proteine u uzorcima.
- Važni su u analizi proteoma.
- Ove metode koriste masenu spektrometriju.
Koja je razlika između ciljane i neciljane proteomike?
Prvo, ciljana proteomika je određivanje prisutnosti i količine određenog proteina ili peptida u složenoj mješavini proteina. Nasuprot tome, neciljana proteomika je kvantitativna i kvalitativna studija proteina prisutnih u uzorku ili uzorcima bez ciljanja na određeni protein. Ciljana proteomika izvodi se s prethodno odabranim ili ciljanim proteinima, dok se neciljana proteomika izvodi kako bi se otkrile vrste proteina u ovom uzorku. Štoviše, ciljana proteomika je osjetljivija od neciljane proteomike.
Sažetak – ciljana naspram neciljane proteomike
Ukratko, ciljana i neciljana proteomika dvije su vrste studija proteina. Kao što njihova imena sugeriraju, ciljana proteomika cilja na određeni protein, dok neciljana proteomika ne cilja na određeni protein. Ovo je razlika između ciljane i neciljane proteomike.
