Ključna razlika između Rho ovisne i Rho neovisne terminacije je da se kod Rho ovisne terminacije Rho faktor veže s transkriptom i prekida transkripciju kidanjem vodikovih veza između predloška i transkripta, dok Rho neovisna terminacija prekida transkripciju stvarajući strukturu petlje ukosnice, a zatim regiju bogatu U u prijepisu.
Transkripcija je jedna od dvije faze ekspresije gena. To je proces koji proizvodi sekvencu mRNA iz genetske informacije skrivene u sekvenci DNK gena. Transkripcija se odvija kroz tri koraka: inicijaciju, elongaciju i terminaciju. Enzim RNA polimeraza veže se na promotorsku sekvencu gena i počinje katalizirati sintezu RNA lanca. Dok se ne pronađe sekvenca terminatora, RNK polimeraza dodaje nukleotide i gradi RNK lanac. U prokariota, terminacija se događa kroz dvije glavne strategije terminacije: Rho ovisna terminacija i Rho neovisna terminacija. Rho faktor je protein koji ima aktivnost helikaze.
Što je Rho ovisan raskid?
Rho ovisna terminacija jedna je od dvije vrste strategije terminacije transkripcije koja se javlja kod prokariota. Rho faktor je protein koji ima aktivnost helikaze.
Slika 01: Rho ovisni završetak
Rho protein veže se s RNA transkriptom i kreće duž RNA polimeraze u smjeru 5’-3’, potičući disocijaciju vodikovih veza između DNA predloška i RNA transkripta. Kada Rho faktor dođe do transkripcijskog mjehurića, on razdvaja DNA/RNA hibrid i oslobađa transkript iz transkripcijskog mjehurića. Kada se to dogodi, prekida se transkripcija.
Što je Rho neovisni prekid?
Rho nezavisna terminacija je druga strategija koja prekida prokariotsku transkripciju. Obično regija terminatora ima obrnutu ponovljenu sekvencu. Neposredno nakon obrnute ponovljene sekvence nalazi se regija bogata adeninom (AAAA). Kada se RNA polimeraza kreće naprijed, ona proizvodi mRNA sekvencu. Budući da su dvije regije komplementarne u regiji obrnutog ponovljenog slijeda, ona formira strukturu petlje ukosnice zbog vodikove veze. Sljedeća regija bit će U bogata regija. Struktura ukosnice prekida aktivnost RNA polimeraze.
Slika 02: Rho neovisni završetak
Štoviše, u regijama bogatim U, postoje slabe interakcije između U baza prijepisa i A baza predloška. Ove slabe adenin-uracilne veze destabiliziraju predložak DNK i transkript RNK i međusobno se razdvajaju. Na kraju, transkript se oslobađa od mjesta transkripcije.
Koje su sličnosti između Rho ovisnog i Rho neovisnog prekida?
- Rho ovisna i Rho neovisna terminacija dvije su glavne strategije terminacije koje se nalaze u prokariota.
- Oba oblika otpuštaju transkript iz DNK predloška da prekinu transkripciju.
Koja je razlika između Rho ovisnog i Rho neovisnog raskida?
Rho ovisni završetak posredovan je Rho proteinom, dok se Rho neovisni završetak događa stvaranjem strukture petlje ukosnice. Dakle, ovo je ključna razlika između Rho ovisnog i Rho neovisnog završetka. Nadalje, Rho protein koristi ATP energiju dok Rho neovisno prekidanje ne uključuje Rho protein i ne koristi ATP energiju. Stoga, ovo je također značajna razlika između Rho ovisnog i Rho neovisnog završetka.
Infografika u nastavku prikazuje više usporedbi povezanih s razlikom između Rho ovisnog i Rho neovisnog završetka.
Sažetak – Rho ovisni naspram Rho neovisni raskid
Rho ovisna i Rho neovisna terminacija su dva glavna mehanizma transkripcije terminacije koja se javljaju kod prokariota. Rho protein je odgovoran za završetak transkripcije kod Rho ovisnog završetka. Nasuprot tome, Rho neovisno prekidanje događa se stvaranjem strukture petlje ukosnice. Dakle, ovo je ključna razlika između Rho ovisnog i Rho neovisnog završetka.
