Ključna razlika između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidroklorida je u tome što je gvanidin tiocijanat jači denaturant proteina koji se češće koristi u izolaciji RNK, dok je gvanidin hidroklorid slabiji denaturant proteina koji se rjeđe koristi u izolaciji RNK.
Denaturacija je proces u kojem proteini gube svoju kvaternarnu strukturu, tercijarnu strukturu i sekundarnu strukturu koja je normalno prisutna u njihovom prirodnom stanju. To se može učiniti primjenom nekog vanjskog stresa ili spojeva kao što su jaka kiselina ili baza, koncentrirana anorganska sol, organsko otapalo (alkohol, kloroform), miješanjem, zračenjem ili toplinom. Gvanidin tiocijanat i gvanidin hidroklorid dvije su različite vrste proteinskih denaturansa.
Što je gvanidin tiocijanat?
Gvanidin tiocijanat (GTC) je jače sredstvo za denaturaciju proteina koje se češće koristi u izolaciji RNK. Također je poznat kao gvanidinijev izotiocijanat (GITC). Budući da je kaotropno sredstvo, to je kemijski spoj koji se rutinski koristi kao opći proteinski denaturant. Kaotropno sredstvo je molekula u vodenoj otopini koja može poremetiti mrežu vodikovih veza između molekula vode. To ima učinak na stabilnost prirodnog stanja drugih molekula u otopini, kao što su makromolekule poput proteina i nukleinskih kiselina, slabljenjem hidrofobnog učinka. Kaotropni agensi poput gvanidin tiocijanata smanjuju količinu reda u strukturi proteina koju formiraju molekule vode u masi i hidratacijskim ljuskama oko hidrofobnih aminokiselina. To može uzrokovati denaturaciju proteina.
Gvanidin tiocijanat se može koristiti za deaktiviranje virusa poput gripe koji uzrokuju bolesti poput španjolske gripe 1918. Stoga se može koristiti u medicinskim ili bolničkim ustanovama. Nadalje, gvanidin tiocijanat se također koristi za lizu stanica i virusnih čestica u ekstrakcijama RNK i DNK. Ovdje je funkcija gvanidin tiocijanata da pomogne djelovanje lizira i da denaturacijom spriječi aktivnost enzima RNaze i enzima DNaze. Ti bi enzimi inače oštetili ekstrakt (RNA ili DNA).
Što je gvanidin hidroklorid?
Gvanidin hidroklorid (GdnHCl) je slabiji denaturant proteina koji se rjeđe koristi u izolaciji RNK. Također je poznat kao gvanidinijev klorid (GdmCl). To je hidrokloridna sol gvanidina. Gvanidin hidroklorid je kaotropan i jedan je od denaturansa koji se koristi u fizikalno-kemijskim studijama savijanja proteina.
Slika 01: Gvanidin hidroklorid
Gvanidin hidroklorid također ima sposobnost smanjiti aktivnost enzima i povećati topljivost hidrofobnih molekula. Normalno, pri višim koncentracijama gvanidin hidroklorida, proteini gube svoju uređenu strukturu. Proteini imaju tendenciju da se nasumično uvijaju pri ovoj koncentraciji gvanidin hidroklorida. U medicinskim ili bolničkim uvjetima, gvanidin hidroklorid je indiciran za smanjenje simptoma slabosti mišića i lakog umora povezanih s bolešću Eaton-Lambertov sindrom. Nadalje, nuspojave korištenja gvanidin hidroklorida mogu uključivati perist altiku, proljev i fatalnu supresiju koštane srži.
Koje su sličnosti između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidroklorida?
- Gvanidin tiocijanat i gvanidin hidroklorid dvije su različite vrste denaturansa proteina.
- Oba denaturanta imaju gvanidin u svojim strukturama.
- Oni su kaotropni agenti.
- Oba denaturanta mogu se koristiti za izolaciju RNK.
- Oboje se koriste u medicinskim ili bolničkim postavama.
Koja je razlika između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidroklorida?
Gvanidin tiocijanat je jači denaturant proteina koji se češće koristi u izolaciji RNK, dok je gvanidin hidroklorid slabiji denaturant proteina koji se rjeđe koristi u izolaciji RNK. Dakle, ovo je ključna razlika između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidroklorida. Nadalje, kemijska formula gvanidintiocijanata je C2H6N4S, dok je kemijska formula gvanidin hidroklorida je CH5N3HCl.
Infografija u nastavku predstavlja razlike između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidroklorida u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – gvanidin tiocijanat u odnosu na gvanidin hidroklorid
Gvanidin tiocijanat i gvanidin hidroklorid dvije su različite vrste proteinskih denaturansa. Oba denaturanta su kaotropi. Gvanidin tiocijanat je jači denaturant proteina koji se češće koristi u izolaciji RNA, dok je gvanidin hidroklorid slabiji denaturant proteina koji se rjeđe koristi u izolaciji RNA. Dakle, ovo sažima razliku između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidroklorida.
