Polipeptid protiv proteina
Aminokiselina je jednostavna molekula formirana s C, H, O, N i može biti S. Ima sljedeću opću strukturu.
Postoji oko 20 uobičajenih aminokiselina. Sve aminokiseline imaju –COOH, -NH2 skupine i –H vezane na ugljik. Ugljik je kiralni ugljik, a alfa aminokiseline su najvažnije u biološkom svijetu. R grupa se razlikuje od aminokiseline do aminokiseline. Najjednostavnija aminokiselina s R skupinom H je glicin. Prema R skupini, aminokiseline se mogu kategorizirati u alifatske, aromatske, nepolarne, polarne, pozitivno nabijene, negativno nabijene ili polarne bez naboja itd. Aminokiseline prisutne kao zwitter ioni u fiziološkom pH 7,4. Aminokiseline su građevni blokovi proteina. Kada se dvije aminokiseline spoje u dipeptid, kombinacija se odvija u -NH2 skupini jedne aminokiseline s –COOH skupinom druge aminokiseline. Molekula vode se uklanja, a formirana veza poznata je kao peptidna veza.
Polipeptid
Lanac koji nastaje kada se veliki broj aminokiselina spoji zajedno poznat je kao polipeptid. Proteini se sastoje od jednog ili više ovih polipeptidnih lanaca. Primarna struktura proteina poznata je kao polipeptid. Od dva kraja polipeptidnog lanca, N-kraj je tamo gdje je amino skupina slobodna, a c-kraj je mjesto gdje je karboksilna skupina slobodna. Polipeptidi se sintetiziraju na ribosomima. Slijed aminokiselina u polipeptidnom lancu određen je kodonima u mRNA.
Protein
Proteini su jedna od najvažnijih vrsta makromolekula u živim organizmima. Proteini se mogu kategorizirati kao primarni, sekundarni, tercijarni i kvarternarni proteini ovisno o njihovoj strukturi. Slijed aminokiselina (polipeptida) u proteinu naziva se primarna struktura. Kada se polipeptidne strukture sklope u nasumične rasporede, poznate su kao sekundarni proteini. U tercijarnim strukturama proteini imaju trodimenzionalnu strukturu. Kada se nekoliko trodimenzionalnih proteinskih dijelova veže zajedno, oni tvore kvaternarne proteine. Trodimenzionalna struktura proteina ovisi o vodikovim vezama, disulfidnim vezama, ionskim vezama, hidrofobnim interakcijama i svim drugim međumolekularnim interakcijama unutar aminokiselina. Proteini igraju nekoliko uloga u živim sustavima. Oni sudjeluju u formiranju strukture. Na primjer, mišići imaju proteinska vlakna poput kolagena i elastina. Također se nalaze u tvrdim i krutim strukturnim dijelovima kao što su nokti, kosa, kopita, perje, itd. Ostali proteini se nalaze u vezivnim tkivima poput hrskavice. Osim strukturalne funkcije, proteini imaju i zaštitnu funkciju. Antitijela su proteini i štite naše tijelo od stranih infekcija. Svi enzimi su proteini. Enzimi su glavne molekule koje kontroliraju sve metaboličke aktivnosti. Nadalje, proteini sudjeluju u staničnoj signalizaciji. Proteini se proizvode na ribosomima. Signal za proizvodnju proteina prenosi se na ribosom iz gena u DNK. Potrebne aminokiseline mogu biti iz prehrane ili se mogu sintetizirati unutar stanice. Denaturacija proteina rezultira razmotavanjem i dezorganizacijom sekundarne i tercijarne strukture proteina. To može biti zbog topline, organskih otapala, jakih kiselina i baza, deterdženata, mehaničkih sila itd.
Koja je razlika između polipeptida i proteina?
• Polipeptidi su slijed aminokiselina, dok su proteini napravljeni od jednog ili više polipeptidnih lanaca.
• Proteini imaju veću molekularnu težinu od polipeptida.
• Proteini imaju vodikove veze, disulfidne veze i druge elektrostatske interakcije, što upravlja njihovom trodimenzionalnom strukturom za razliku od polipeptida.
