Ključna razlika između 1D i 2D gel elektroforeze su svojstva koja se koriste za odvajanje proteina na gel elektroforezi. 1D gel elektroforeza razdvaja proteine samo na temelju molekularne težine, dok 2D gel elektroforeza razdvaja proteine na temelju njihove izoelektrične točke i molekularne težine.
Odvajanje proteina elektroforezom u gelu važna je tehnika za karakterizaciju proteina. Proteini imaju različita svojstva; stoga je odvajanje složenije u usporedbi s odvajanjem DNK elektroforezom u agaroznom gelu.
Što je 1D gel elektroforeza?
1D gel elektroforeza, poznata i kao jednodimenzionalna gel elektroforeza, metoda je odvajanja proteina na temelju molekularne težine. Razdvajanje proteina uglavnom se odvija pomoću elektroforeze u poliakrilamidnom gelu. Na temelju koncepta gel elektroforeze, molekule se odvajaju na temelju svojstava molekularne težine i naboja.
Stoga, kako bi se proteinima dao ujednačen naboj, tretman natrijevim dodecil sulfatom (SDS) provodi se prije elektroforeze u gelu. SDS denaturira proteine i osigurava ravnomjerni negativni naboj na proteinu; kada dođe do primjene električnog polja, proteini migriraju do pozitivnog terminala na temelju njihove molekularne težine. Dakle, u razdvajanju se razmatra samo jedno svojstvo. Zbog toga se ova metoda naziva 1D gel elektroforeza.
Slika 01: 1D gel elektroforeza
Tijekom 1D gel elektroforeze, proteini se odvajaju na temelju njihove molekularne težine. U tom smislu, molekule manje težine migriraju brže u gelu u usporedbi s proteinima velike molekularne težine. Dakle, proteini velike težine ostaju blizu jažica.
Što je 2D gel elektroforeza?
2D gel elektroforeza ili dvodimenzionalna gel elektroforeza razdvaja proteine na temelju dva svojstva. Dva svojstva su izoelektrična točka proteina i molekularna težina. Ova metoda odvajanja proteina povećava rezoluciju odvajanja proteina. Izoelektrična točka proteina ovisi o pH pri kojem je protein neutralan.
Slika 02: 2D gel elektroforeza
Dakle, u 2D gel elektroforezi, proteinu je dopušteno da radi na fiksnom pH gradijentu u prvoj dimenziji. U drugoj dimenziji, proteini se odvajaju pomoću vertikalne ili horizontalne elektroforeze u poliakrilamidnom gelu. Dakle, proteini se odvajaju prema njihovoj molekularnoj težini u drugoj dimenziji.
Osim toga, ova metoda gel elektroforeze povećava rezoluciju razdvajanja proteina. Stoga su izdvojeni proteini čišći. Međutim, cijena tehnike puno je veća od jednodimenzionalne gel elektroforeze.
Koje su sličnosti između 1D i 2D gel elektroforeze?
- Obje tehnike razdvajaju proteine.
- Stoga su važni u karakterizaciji proteina.
Koja je razlika između 1D i 2D gel elektroforeze?
Ključna razlika između 1D i 2D gel elektroforeze je u tome što 1D gel elektroforeza razdvaja proteine samo na temelju molekularne težine, dok 2D gel elektroforeza razdvaja proteine na temelju izoelektrične točke i molekularne težine. Zbog ove osnovne razlike između 1D i 2D gel elektroforeze, razlučivost odvajanja proteina i cijena dviju tehnika također se razlikuju.2D gel elektroforeza pokazuje veću rezoluciju od 1D gel elektroforeze. Međutim, 2D gel elektroforeza je skuplja od 1D gel elektroforeze.
U nastavku infografika sažima razliku između 1D i 2D gel elektroforeze.
Sažetak – 1D naspram 2D gel elektroforeze
Razdvajanje proteina ovisi o mnogim čimbenicima. 1D gel elektroforeza razdvaja proteine samo na temelju molekularne težine. Međutim, dvodimenzionalna ili 2D gel elektroforeza povećava razlučivost odvajanja proteina. Nadalje, 2D gel elektroforeza razdvaja proteine na temelju izoelektrične točke i molekularne težine. Stoga su ovi podaci važni za daljnju obradu proteina iu području proteomike. Dakle, ovo je sažetak razlike između 1D i 2D gel elektroforeze.
