Ključna razlika – sekvenciranje gena nasuprot DNK otisku prsta
Sekvenciranje DNK važna je tehnika u molekularnoj genetici kojom se određuje sekvenca nukleotida određene sekvence DNK ili cijelog genoma organizma. To omogućuje istraživaču ili dijagnostičaru da odredi mutacije sekvenci DNK i da razlikuje jedan organizam od drugog na temelju njihovog genetskog sastava. Sekvenciranje gena je postupak sekvenciranja gena ili fragmenta DNK putem Sanger sekvenciranja ili sekvenciranja sljedeće generacije. DNK otisak prsta uključuje tehniku poznatu kao polimorfizam duljine restrikcijskog fragmenta (RFLP), gdje se uzorci DNK dva ili više subjekata fragmentiraju i analiziraju kako bi se utvrdio identitet osobe. Ovo je ključna razlika između sekvenciranja gena i DNK otiska.
Što je sekvenciranje gena?
Sekvenciranje gena provodi se kako bi se odredio slijed nukleotida određenog gena. Ako je cijeli genom sekvenciran, to se naziva sekvenciranje cijelog genoma. U početku se sekvenciranje gena provodilo kemijskim metodama koje su koristile štetne kemikalije poput piridina; ta je tehnika ubrzo prekinuta zbog toksične prirode eksperimenta. Trenutačno se sekvenciranje gena uglavnom provodi pomoću metode poznate kao Sanger sekvenciranje, koja koristi korak prekidanja lanca pomoću deoksiribonukleinskih kiselina. Reakcija se provodi u četiri odvojene epruvete gdje je u svakoj epruveti početnica označena pomoću fluorescentnog markera koji će konačno odrediti sekvencu pojedinog fragmenta. Automatizirano Sangerovo sekvenciranje koristi detektor za otkrivanje signala fluorescencije i isporuku rezultata.
Slika 01: Sekvenciranje DNK
Sljedeća generacija sekvenciranja je najnoviji razvoj metoda sekvenciranja i tehnika je visoke propusnosti koja je ekvivalentna izvođenju 1000 Sangerovih reakcija sekvenciranja odjednom. Glavne značajke sljedeće generacije sekvenciranja su;
- Vrlo paralelno – mnoge reakcije sekvenciranja odvijaju se u isto vrijeme.
- Mikrorazmjerno – reakcije su sićušne i mnoge se mogu izvesti odjednom na čipu.
- Brzo – budući da se reakcije odvijaju paralelno, rezultati su spremni mnogo brže.
- Kraća duljina – očitavanja se obično kreću od 505050 -700700700 nukleotida u duljinu.
Sekvenciranje gena se uglavnom koristi za određivanje sekvence novog gena ili za analizu mutacija gena prisutnih u bolesnim stanjima i za potvrdu genetske osnove bolesti. Također se primjenjuje u području poljoprivredne biotehnologije za određivanje novih sorti biljnih vrsta i za identifikaciju biljnih gena odgovornih za korisna agronomska svojstva kao što su otpornost na štetočine, otpornost na bolesti i otpornost na sušu.
Što je DNK otisak prsta?
DNK otisak prsta je tehnika koja se uglavnom koristi u forenzičkim studijama za potvrdu identiteta osobe uključene u forenzičku istragu. U ranim danima, DNK otisci su rađeni tehnikom hibridizacije korištenjem fluorescentnih ili radio obilježenih markera. Trenutno se DNK otisak prsta radi tehnikom RFLP. Ova tehnika koristi restrikcijske enzime, koji su enzimi sposobni sjeckati DNK na određene sekvence. Kada se dva uzorka donesu na analizu, oba se uzorka probavljaju s istim restrikcijskim enzimima kako bi se dobili fragmenti. Ako su dva uzorka slična, slika gela elektroforeze trebala bi biti identična za oba uzorka. Ako nije sličan, slike gela neće biti identične. Stoga se ovom tehnikom može potvrditi identitet osobe.
DNK otisak prsta najčešće se koristi u pronalaženju pravog osumnjičenika na mjestu zločina analizom dostupnih bioloških uzoraka na mjestu zločina. DNK se izdvaja iz ovih dostupnih uzoraka (kosa/sjeme/pljuvačka/krv) i analizira s DNK uzorcima osumnjičenih kako bi se odredio pravi krivac.
Koje su sličnosti između sekvenciranja gena i DNK otiska?
- U oba slučaja, analizirani uzorak je uzorak DNK.
- Elektroforeza se koristi za određivanje rezultata u obje tehnike.
Koja je razlika između sekvenciranja gena i DNK otiska?
Sekvenciranje gena u odnosu na DNK otiske |
|
| Sekvenciranje gena je proces koji određuje sekvencu nukleotida određenog gena ili cijelog genoma. | DNK otisak prsta uključuje tehniku u kojoj se uzorci DNK dva ili više subjekata fragmentiraju i analiziraju kako bi se utvrdio identitet osobe. |
| Osnova tehnologije | |
| Metode sekvenciranja kao što su Sanger sekvenciranje ili sekvenciranje sljedeće generacije koriste se u sekvencioniranju gena. | Polimorfizam duljine restrikcijskog fragmenta koristi se za analizu dvaju uzoraka subjekata u DNK otiscima. |
| Aplikacije | |
| Sekvenciranje gena se uglavnom koristi u genetskim studijama za analizu novih gena, identificiranje mutacija i razvoj zaključaka temeljenih na genetskoj dijagnostici. | DNK otisak prsta koristi se u forenzičkim istragama za izvođenje zaključaka o identitetu osumnjičenika. |
Sažetak – Sekvenciranje gena nasuprot DNK otisku prsta
Sekvenciranje gena i DNK otisak prsta postali su dva popularna testa koji se izvode za karakterizaciju određenog gena ili za identifikaciju određene osobe pomoću genetskog otiska prsta te osobe. Ove su tehnike točne i brze i izvodi ih kvalificirano osoblje kako bi se dobili potvrđeni rezultati. Razlika između sekvenciranja gena i DNK otiska je u tome što je sekvenciranje gena usmjereno na pronalaženje točnog nukleotidnog reda gena, dok je DNK otiska usmjereno na potvrdu identiteta pojedinaca u forenzičkim studijama.
Preuzmi PDF verziju sekvenciranja gena u odnosu na DNK otiske
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti ga za izvanmrežne svrhe prema napomeni o citatu. PDF verziju preuzmite ovdje Razlika između sekvenciranja gena i DNK otiska
