Ključna razlika između transkripcijskog i posttranskripcijskog utišavanja gena je u tome što je transkripcijsko utišavanje gena regulacija ekspresije gena na transkripcijskoj razini kako bi se smanjila sinteza RNK utišavanjem promotora, dok je posttranskripcijsko utišavanje gena regulacija ekspresije gena pri translaciji razina degradacijom RNK specifične za sekvencu.
Utišavanje gena je proces regulacije ekspresije gena prekidanjem ili potiskivanjem ekspresije gena. Isključuje određene vrste gena. Stoga sprječava proizvodnju proteina iz odgovarajućeg gena. Utišavanje gena može se dogoditi tijekom transkripcije ili translacije. Dakle, postoje dvije vrste utišavanja gena kao transkripcijsko utišavanje gena i posttranskripcijsko utišavanje gena. Transkripcijsko utišavanje gena smanjuje sintezu RNA, dok posttranskripcijsko utišavanje gena degradira mRNA. Štoviše, transkripcijsko utišavanje gena odvija se u jezgri, dok se posttranskripcijsko utišavanje gena odvija u citoplazmi.
Što je utišavanje transkripcijskih gena?
Transkripcijsko utišavanje gena je utišavanje gena koje djeluje kroz smanjenu sintezu RNK. To je rezultat modifikacije histona, stvarajući okruženje koje je nedostupno transkripcijskim strojevima. To se događa u jezgrama stanica. Metilacija DNA vrlo je važna za utišavanje transkripcijskog gena jer se metilacija sekvence promotora događa tijekom utišavanja transkripcijskog gena. Metilacija kodirajuće sekvence ne utječe na transkripciju. No, metilacija sekvenci promotora rezultira inaktivacijom promotora zbog deacetilacije histona i kondenzacije kromatina. Jednom kada se promotori utišaju, to utječe na transkripciju gena. Stoga, kod transkripcijskog utišavanja gena, promotori su utišani kako bi regulirali ekspresiju gena na transkripcijskoj razini.
Slika 01: Utišavanje gena
Što je posttranskripcijsko utišavanje gena?
Posttranskripcijsko utišavanje gena, također poznato kao utišavanje RNK ili interferencija RNK, vrsta je utišavanja gena koje djeluje putem degradacije RNK specifične za sekvencu. Iako transkripcija gena nije pogođena, sinteza proteina iz mRNA prestaje zbog nestabilne ili nedostupne mRNA. Posttranskripcijsko utišavanje gena izazvano je namjernom proizvodnjom dvolančane RNA. Dvolančana RNA pokreće cijepanje homologne mRNA. Male interferirajuće RNA koje imaju homologne sekvence transkribiranim regijama gena vode degradaciju mRNA specifičnu za sekvencu. RNAi se veže na komplementarni dio ciljne mRNA i označava je za razgradnju.
Slika 02: Posttranskripcijsko utišavanje gena
Posttranskripcijsko utišavanje gena ima nekoliko primjena, uključujući gensku terapiju i liječenje raka. Posttranskripcijsko utišavanje gena jedan je od prirodnih obrambenih mehanizama u biljkama protiv invazije RNA virusa. Stoga su biljke koje su defektne u posttranskripcijskom utišavanju gena osjetljivije na infekcije RNA virusima.
Koje su sličnosti između transkripcijskog i posttranskripcijskog utišavanja gena?
- To su dva različita fenomena utišavanja gena.
- Oba fenomena može izazvati dsRNA.
- Za obje vrste utišavanja pronađene su male vrste RNA za koje se smatra da su proizvodi raspada dsRNA.
- Mehanistički su povezani.
Koja je razlika između transkripcijskog i posttranskripcijskog utišavanja gena?
Transkripcijsko utišavanje gena je fenomen utišavanja gena koji djeluje na razini transkripcije putem smanjene sinteze RNA. S druge strane, posttranskripcijsko utišavanje gena je fenomen utišavanja gena koji se događa na razini translacije putem degradacije mRNA specifične za sekvencu. Dakle, ovo je ključna razlika između transkripcijskog i posttranskripcijskog utišavanja gena.
Štoviše, transkripcijsko utišavanje gena događa se u jezgri, dok se posttranskripcijsko utišavanje gena događa u citoplazmi. Osim toga, promotori su inaktivirani u utišavanju transkripcijskih gena, dok su promotori aktivni u utišavanju gena nakon transkripcije.
U nastavku infografika prikazuje više razlika između transkripcijskog i posttranskripcijskog utišavanja gena.
Sažetak – Transkripcijsko nasuprot posttranskripcijskom utišavanju gena
Geni su regulirani na transkripcijskoj ili posttranskripcijskoj razini. Utišavanje transkripcijskog gena događa se u jezgrama putem metilacije sekvence promotora i modifikacije histona. Kao rezultat toga, sinteza RNK se smanjuje. Posttranskripcijsko utišavanje gena događa se u citoplazmi cijepanjem mRNA i inhibicijom translacije. Oba fenomena inducira dsRNA i ovise o malim interferirajućim RNA. Dakle, ovo sažima razliku između transkripcijskog i posttranskripcijskog utišavanja gena.
