Ključna razlika između NAAT i PCR je u tome što je NAAT metoda koja umnožava genetski materijal na nekoliko načina, uključujući lančanu reakciju polimerazom, premještanje niti ili umnožavanje posredovano transkripcijom, dok je PCR metoda koja umnožava genetski materijal koristeći samo toplinski ciklus.
Patogeni se uglavnom identificiraju amplifikacijom njihovog genetskog materijala. Većina tehnika u ovom području usmjerena je na otkrivanje genetskog materijala patogena pojačavanjem specifičnih sekvenci u stvarnom vremenu. Zbog toga se rezultati dobivaju vrlo brzo u dijagnostičkom kontekstu. NAAT, PCR, biosenzor i LCR nekoliko je tehnika koje se koriste u laboratorijima za pojačavanje genetskog materijala patogena.
Što je NAAT?
Test pojačanja nukleinske kiseline (NAAT) je metoda u molekularnoj biologiji koja pojačava genetski materijal korištenjem nekoliko načina kao što su lančana reakcija polimeraze, pojačanje pomakom lanca ili pojačanje posredovano transkripcijom. Umnožavanje genetskog materijala također se može izvesti tehnikama poput lančane reakcije ligacije i reakcije razgranate DNK (kvantipleks b DNK) u postupku NAAT. NAAT koristi specifičnost Watson-Crickovog sparivanja baza. U postupku NAAT, jednolančana sonda ili molekula početnice se hibridizira s ciljnom molekulom DNA ili RNA. Stoga je dizajn lanca sonde vrlo važan za poboljšanje osjetljivosti i specifičnosti detekcije. Zatim, sljedeći korak NAAT-a pojačava genetski materijal stvaranjem mnogih kopija za otkrivanje.
Slika 01: NAAT
NAAT se trenutno primjenjuje za detekciju nekoliko patogena kao što su Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis i SARS-COV2. Štoviše, NAAT test je razvijen da skrati razdoblje prozora. Period prozora je vremenski period između kada je pacijent zaražen i kada se testovi na antitijela pokažu kao pozitivni. Nadalje, NAAT metodu probira prvi je put odobrila FDA 1999. godine. NAAT ima mnoge prednosti uključujući detekciju niskih razina DNA ili RNA, visoku osjetljivost i visoku specifičnost.
Što je PCR?
PCR je metoda u molekularnoj biologiji koja umnožava genetski materijal koristeći samo termalni ciklus. PCR je kratica za lančanu reakciju polimerazom. To je test za otkrivanje genetskog materijala iz određenog organizma kao što su bakterije, gljivice i virusi. U dijagnozi bolesti, PCR detektira prisutnost patogena ako osoba ima patogen u vrijeme testa. U dijagnostici bolesti, PCR protokol ima nekoliko koraka, uključujući prikupljanje uzorka, ekstrakciju DNK, PCR i sekvenciranje. U testiranju patogena, prikupljeni uzorak se koristi za izdvajanje genetskog materijala (DNA ili RNA). PCR postupak zahtijeva posebne kemikalije, početnice i enzime kako bi se proizveli milijuni kopija genetskog materijala unutar PCR stroja koji se naziva termalni cikler. Nakon umnožavanja iz PCR produkta, patogen se može otkriti. Znanstvenici koriste poseban softver za tumačenje rezultata.
Slika 02: PCR
Nadalje, postoje različite vrste PCR-a koji se trenutno koriste u istraživanju. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD i Nested PCR nekoliko je među njima. PCR je posebno koristan u otkrivanju faringitisa (Streptococcl pharyngitis), atipične upale pluća (Chlymydia pneumoniae), ospica (Morbillivirus), hepatitisa (HBV) i ulcerativne urogenitalne infekcije (Haemophilus ducreyi).
Koje su sličnosti između NAAT i PCR?
- NAAT i PCR su dvije važne molekularne biološke metode koje se koriste za umnožavanje genetskog materijala.
- Nukleinske kiseline (DNA ili RNA) umnožavaju se objema tehnikama.
- To su brze i brze tehnike.
- Obje tehnike se trenutno koriste za dijagnozu bolesti.
- Skupi su od konvencionalnih metoda.
Koja je razlika između NAAT i PCR?
NAAT je metoda u molekularnoj biologiji koja umnožava genetski materijal korištenjem nekoliko metoda, dok je PCR metoda u molekularnoj biologiji koja umnožava genetski materijal koristeći samo termalni ciklus. NAAT koristi različite tehnike umnožavanja genetskog materijala kao što je lančana reakcija polimerazom, umnažanje pomicanjem niti, umnažanje posredovano transkripcijom, lančana reakcija ligacije i reakcija razgranate DNA (quantiplex b DNA). S druge strane, PCR koristi različite tehnike pojačanja genetskog materijala kao što je RT-PCR. Multiplex PCR, RAPD, ugniježđeni PCR. Dakle, ovo je ključna razlika između NAAT i PCR.
Infografija u nastavku prikazuje razlike između NAAT i PCR u obliku tablice za usporedbu.
Sažetak – NAAT vs PCR
Postoje različiti molekularni biološki alati koji se koriste u laboratorijima za pojačavanje genetskog materijala. NAAT, PCR, biosenzor i LCR su nekoliko takvih tehnika. NAAT je molekularna biološka tehnika koja pojačava genetski materijal koristeći nekoliko načina kao što su lančana reakcija polimeraze, premještanje niti ili pojačanje posredovano transkripcijom. PCR je metoda u molekularnoj biologiji koja umnožava genetski materijal pomoću toplinskog ciklusa. Dakle, ovo je ključna razlika između NAAT i PCR.
