Ključna razlika između LAMP i PCR testa je u tome što se LAMP provodi na konstantnoj temperaturi (60-650C) kako bi se proizvele kopije DNK putem amplifikacije, dok se PCR provodi korištenjem niza promjena temperature za proizvodnju kopija DNK putem amplifikacije.
LAMP i PCR su tehnike in vitro pojačanja koje se koriste za proizvodnju tisuća kopija DNK. Količina DNK proizvedena u LAMP-u puno je veća od količine proizvedene u PCR tehnikama kao što je RT-PCR. LAMP je novija tehnika u odnosu na PCR tehniku. Ali to je tehnički jednostavno i za školovanog znanstvenika lako izvesti u laboratorijskim uvjetima. To ga čini potencijalno korisnom tehnikom za otkrivanje COVID-19. Međutim, RT-PCR je trenutni standardni test za COVID-19. Ove tehnike, iako su dobro poznate istraživačima i kliničarima s iskustvom u amplificiranju DNK, još uvijek mogu biti relativno nepoznate široj zajednici.
Što je LAMP test?
Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) za testove na COVID-19 započinju prikupljanjem uzoraka iz nosa ili grla pomoću brisa. Uzorci se također mogu prikupiti drugim metodama kao što je sluz iz teškog kašlja. Poput PCR tehnike kao što je RT-PCR, virusna RNA u uzorku prvo se pretvara u DNA, što omogućuje njezino kopiranje. LAMP reakcija se provodi na konstantnoj temperaturi (60-650C).
Umnožavanje virusne DNK koja uključuje LAMP tehnologiju i reagense može se otkriti kada se reakcijska smjesa zamuti zbog proizvodnje "magnezijevog pirofosfata". Ova naoblaka omogućuje znanstvenicima i kliničarima laku dijagnozu COVID-19. Točnost rezultata ispitivanja može se poboljšati korištenjem posebnih fluorescentnih boja ili boja koje mijenjaju boju u reakcijskoj smjesi. Ove boje stupaju u interakciju s virusnom DNK, a intenzitet svjetla ili promjena boje može se izmjeriti kako bi se dobio broj virusnih RNK molekula približno onom koji je bio u početku u uzorku.
Što je PCR test?
PCR je vrlo uobičajena znanstvena tehnika koja se široko koristi u istraživanju i medicini već 20-30 godina za otkrivanje DNK. PCR testovi se koriste izravno za otkrivanje antigena otkrivanjem virusne RNA. Općenito, virusna RNA prisutna je u tijelu prije otkrivanja protutijela ili prije pojave simptoma bolesti. Stoga PCR test može rano otkriti ima li netko virus ili ne. Trenutno je PCR standardni test za otkrivanje COVID-19. Postoje različite vrste PCR tehnika kao što su PCR u stvarnom vremenu, ugniježđeni PCR, multipleksni PCR, vrući startni PCR i PCR dugog dometa, itd. PCR koristi niz temperaturnih promjena za proizvodnju kopija DNK putem umnožavanja.
RT-PCR je posebna verzija PCR tehnike. Koristi se kada se otkriva RNA. Sada se koristi za testiranje na COVID-19. RT-PCR je prilično osjetljiva i pouzdana tehnika. U RT-PCR-u, kada se uzorak prikupi, kemikalije se koriste za uklanjanje neželjenih proteina, masti i drugih molekula, ostavljajući RNA iza sebe. Enzimi kompleta za testiranje najprije pretvaraju RNK u DNK, koja zatim pojačava virusnu DNK kako bi otkrila virus. Fluorescentne boje obično se koriste za vezanje na pojačanu DNK i proizvodnju svjetla. Stroj to može pročitati kako bi proizveo rezultat testa.
Koje su sličnosti između LAMP i PCR testa?
- To su tehnike pojačanja.
- Oboje proizvode kopiranu DNK.
- One su vrlo osjetljive i pouzdane tehnike od imunoloških tehnika poput detekcije antitijela.
- Oboje se koriste za testiranje na COVID-19.
Koja je razlika između LAMP i PCR testa?
Ključna razlika između LAMP i PCR testova je u tome što se u LAMP-u amplifikacija postiže korištenjem konstantne temperature (60-650C), dok se u PCR-u ciklično mijenjanje potrebna je temperatura. Trenutno je dostupno nekoliko vrsta LAMP tehnika. Ali najvažnije za detekciju COVID-19 su izotermna tehnika posredovana petljom reverzne transkripcije (RT-LAMP) i pojačanje posredovano transkriptom (TMA). Nadalje, različite vrste PCR tehnika također su trenutačno dostupne u kliničkoj praksi za dijagnozu bolesti kao što su PCR u stvarnom vremenu, RT-PCR, ugniježđeni PCR, multipleks PCR, hot-start PCR, dugotrajni PCR, itd.
Infografika ispod navodi razlike između LAMP i PCR testa u tabelarnom obliku.
Sažetak – LAMP vs PCR test
Izotermna amplifikacija posredovana petljom je sličan proces PCR testovima kao što je RT-PCR, ali proizvodi više kopija virusne DNK na konstantnoj temperaturi. Test lančane reakcije polimerazom trenutno je najčešći i standardni oblik testiranja u svijetu za dijagnostiku bolesti, poput dijagnoze COVID-19. Smatra se prilično pouzdanim. PCR koristi niz temperaturnih promjena za proizvodnju kopija DNK putem umnožavanja. Dakle, ovo sažima razliku između LAMP i PCR testa.
