Ključna razlika između sigma faktora i rho faktora je u tome što je sigma faktor protein potreban za početak transkripcije u bakterijama, dok je rho faktor protein potreban za završetak transkripcije u bakterijama.
Sigma faktor i rho faktor dva su važna faktora za bakterijsku transkripciju. Bakterijska transkripcija je proces u kojem se dio bakterijske DNA kopira u novonastali lanac mRNA (glasnička RNA). Ovaj proces katalizira enzim poznat kao RNA polimeraza. Bakterije se uvelike oslanjaju na transkripciju i translaciju kako bi ispravno odgovorile na svoju okolinu. Bakterijska RNA polimeraza sastoji se od jezgre i holoenzimske strukture. Jezgra sadrži podjedinice β, β′, α i 2ω dok holoenzim sadrži sigma faktor. Štoviše, pomoćni faktor RNA polimeraze poznat kao rho faktor također je vrlo važan za bakterijsku transkripciju.
Što je Sigma faktor?
Sigma faktor ili faktor specifičnosti je protein potreban za inicijaciju transkripcije u bakterijama. To je faktor inicijacije bakterijske transkripcije. Ovaj čimbenik omogućuje vezanje enzima RNA polimeraze na specifično područje DNA koje se naziva promotorsko područje tijekom transkripcije. Sigma faktor je normalno homologan arhealnom transkripcijskom faktoru B i eukariotskom transkripcijskom faktoru TF11B. Štoviše, specifični sigma faktor određenog gena varira ovisno o genu i okolišnim signalima. Promotore odabire RNA polimeraza ovisno o sigma faktoru koji je s njim povezan.
Slika 01: Sigma faktor
Sigma faktor se također može naći u kloroplastu biljaka kao dio polimeraze kodirane plastidom (PEP). Sigma faktor i RNA polimeraza zajedno poznati su kao holoenzim RNA polimeraze. Molekularna težina sigma faktora je oko 70 kDa. Nakon inicijacije transkripcije, sigma faktor se odvaja od kompleksa. Zatim RNA polimeraza nastavlja elongaciju dok transkripcija ne završi.
Što je Rho faktor?
Rho faktor je prokariotski protein uključen u terminaciju transkripcije. Rho faktor obično se veže na mjesto pauze terminatora transkripcije. Ovo mjesto je izložena regija jednolančane RNK u blizini otvorenog okvira za čitanje kod sekvenci bogatih citozinom i siromašnih gvaninom. To je esencijalni transkripcijski protein kod prokariota. U Escherichia coli, rho faktor je približno 274,6 kDa heksamer identičnih podjedinica. Svaka podjedinica ima RNK veznu domenu i ATP hidroliznu domenu. Štoviše, funkcija rho faktora je aktivnost helikaze.
Slika 02: Rho faktor
Rho faktor veže se za molekulu RNA i zatim koristi svoju aktivnost ATPaze da osigura energiju za translociranje molekula RNA. Rho faktor provodi translokaciju dok ne dosegne RNA-DNA spiralno područje, gdje odmotava hibridnu (RNA-DNA) dupleksnu strukturu. Ovaj proces pauzira RNA polimerazu na terminacijskom mjestu prekidajući proces transkripcije.
Koje su sličnosti između Sigma faktora i Rho faktora?
- Sigma faktor i rho faktor dva su važna faktora za bakterijsku transkripciju.
- Oboje je prisutno samo kod prokariota.
- Oni su proteini koji se sastoje od aminokiselina.
- Oba su proteini koji vežu nukleinske kiseline.
- Prokarioti se uvelike oslanjaju na ove čimbenike za generiranje mRNA koja može stvarati osebujne proteine i pomoći im da specifično reagiraju na okolinu.
Koja je razlika između Sigma faktora i Rho faktora?
Sigma faktor je protein potreban za početak transkripcije u bakterijama, dok je rho faktor protein potreban za završetak transkripcije u bakterijama. Dakle, ovo je ključna razlika između sigma faktora i rho faktora. Nadalje, sigma faktor je DNA vezni protein, dok je rho faktor RNA vezni protein.
Infografika u nastavku predstavlja razlike između sigma faktora i rho faktora u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – Sigma faktor naspram Rho faktora
Transkripcija je proces u kojem se informacije u DNK kopiraju u novu molekulu zvanu mRNA (glasnička RNA). Ova m-RNA je u konačnici uključena u proizvodnju specifičnog proteina. Sigma faktor i rho faktor su dva važna faktora za bakterijsku transkripciju. Oni su proteini. Sigma faktor sudjeluje u inicijaciji transkripcije kod bakterija. Rho faktor je odgovoran za prekid transkripcije kod bakterija. Dakle, ovo je sažetak razlike između sigma faktora i rho faktora.
