Ključna razlika između gena kandidata i GWAS-a je u tome što pristup gena kandidata istražuje genetsku varijaciju unutar malog broja unaprijed specificiranih gena od interesa, dok GWAS istražuje cijeli genom u potrazi za zajedničkom genetskom varijacijom koja stoji iza određene bolesti.
Genski pristup kandidatu i genomske studije povezanosti (GWAS) dvije su metode koje su važne za otkrivanje genetske osjetljivosti na bolesti. Pristup genima kandidata temelji se na unaprijed određenom malom broju gena dok se GWAS temelji na testiranju cijelog genoma. Stoga pristup genima kandidata zahtijeva prethodno poznavanje gena koji su relevantni za bolest, za razliku od GWAS-a.
Što je gen kandidat?
Pristup genima kandidata jedna je od tehnika koja istražuje povezanost između genetske varijacije unutar unaprijed određenih gena od interesa i fenotipova ili bolesnih stanja. U ovom pristupu, potrebno je imati prethodno znanje o biološkom funkcionalnom utjecaju gena na dotičnu osobinu ili bolest. Na temelju ovog znanja odabire se mali broj gena i analizira ih na genetske varijacije.
Slika 01: Pristup genima kandidata
Odabir gena se vrši na temelju biološke, fiziološke i funkcionalne važnosti za dotičnu bolest u ovom pristupu. Ovaj pristup često je osmišljen kao studija kontrole slučaja.
Što je GWAS?
GWAS je kratica za Genome-Wide Association Study. Također se odnosi na studije povezanosti cijelog genoma. Te su studije uglavnom usmjerene na opservacijske studije. Oni analiziraju genetske varijante različitih jedinki koje se obično povezuju s određenom osobinom. Cijeli genom je važan za GWAS analizu.
GWAS je važan alat u analizi polimorfizama jednog nukleotida povezanih s različitim bolesnim stanjima. To je komparativna studija različitih polimorfizama jednog nukleotida u širokoj populaciji. Studijski uzorak GWAS-a je vrlo visok; stoga također ima format presječne kohortne studije.
Slika 02: GWAS
Prva GWAS studija provedena je u vezi s infarktom miokarda i analizom gena povezanih s infarktom miokarda. Trenutno GWAS igra važnu ulogu u određivanju genetske pozadine složenih bolesti nepoznate etiologije.
Koje su sličnosti između gena kandidata i GWAS-a?
- I pristup genu kandidata i GWAS su tehnike koje analiziraju genetsku povezanost između genotipa i fenotipa bolesti.
- Oba pristupa pomažu u razumijevanju genetske osnove osjetljivosti na bolesti.
Koja je razlika između gena kandidata i GWAS-a?
Pristup genima kandidata temelji se na genima kandidatima ili unaprijed određenim genima, dok se GWAS temelji na cijelom genomu. Dakle, ovo je ključna razlika između gena kandidata i GWAS-a. Također, u pristupu genima kandidata, odabir gena je neophodan, dok nije potreban u GWAS.
Štoviše, genski pristup kandidatu zahtijeva prethodno znanje o genima relevantnim za bolest, dok nije neophodan za GWAS.
Donja infografika pruža detaljniju usporedbu koja se odnosi na razliku između gena kandidata i GWAS-a.
Sažetak – gen kandidata protiv GWAS
Gen kandidata i GWAS dvije su studije povezanosti gena. Pristup gena kandidata usredotočuje se na genetske varijacije povezane s bolešću unutar malog broja unaprijed određenih gena. Nasuprot tome, GWAS istražuje genetske varijacije povezane s bolešću unutar cijelog genoma. Dakle, ovo je ključna razlika između gena kandidata i GWAS-a. Obje su metode važne za razumijevanje genetske osnove osjetljivosti na bolesti.
