Ključna razlika između cis i trans spajanja je u tome što je cis spajanje intramolekularni mehanizam koji uklanja introne i spaja egzone koji se nalaze unutar istog RNA transkripta, dok je trans-spajanje intermolekularni mehanizam koji uklanja introne ili outrone i spaja egzone koji nisu unutar istog RNA transkripta.
Spajanje RNA je oblik obrade RNA prije sinteze proteina. U ovom procesu, novostvoreni prijepis RNK prije glasnika transformira se u zrelu RNK glasnika. Zrela glasnička RNA pomaže u proizvodnji proteinske molekule. Tijekom spajanja RNA, introni (nekodirajuća područja) se uklanjaju, a egzoni (kodirajuća područja) se spajaju kako bi nastala zrela mRNA. Cis i trans spajanje dvije su vrste mehanizama spajanja RNA.
Što je Cis spajanje?
Cis spajanje je intramolekularni mehanizam koji uklanja introne i spaja egzone koji su unutar istog RNA transkripta. Normalno cis spajanje obrađuje jednu molekulu RNA. Cis spajanje je tipičan proces spajanja pre mRNA koji provode spliceosomi. U intronu, donorsko mjesto (5' kraj introna), mjesto grananja (blizu 3' kraja introna) i akceptorsko mjesto (3' kraj introna) vrlo su bitni za spajanje. Donorsko mjesto spajanja uključuje nepromjenjivu sekvencu GU na 5’ kraju introna. Akceptorsko mjesto spajanja na 3’ kraju introna ima nepromjenjivu AG sekvencu. Uzvodno od AG sekvence, postoji regija koja se naziva pirimidinska regija (polipirimidinski trakt). Dalje uzvodno od polipirimidinskog trakta, postoji točka grananja koja uključuje adenozin nukleotid. Ovaj nukleotid je uključen u stvaranje larijata.
Slika 01: Cis i trans spajanje
Glavni spliceosomi su U1, U2, U4, U5 i U6. Među njima su vrlo važni U1 i U2. U cis spajanju, U1 se veže za 5' mjesto spajanja, a U2 se veže za točku grananja blizu 3' mjesta spajanja. U5/U4/U6 veže egzone na 5’ mjestu, a U6 se veže na U2. Kasnije izlazi U1. U5 prelazi iz egzona u intron, a U6 se veže na 5’ mjestu spajanja. Nadalje, U4 je također objavljen. U6/U2 katalizira transesterifikaciju, čineći 5’ kraj introna vezanim za A nukleotid na intronu. To izaziva stvaranje larijata. U formiranju larijata, U5 veže egzon na 3' mjestu spajanja, a 5' mjesto se cijepa. U završnoj fazi spajanja, U2/U5/U6 ostaju vezani za larijat, a 3’ mjesto se cijepa. Uz to, eksoni su ligirani korištenjem ATP hidrolize u ovoj fazi.
Što je trans spajanje?
Trans spajanje je intermolekularni mehanizam koji uklanja introne ili outrone i spaja egzone koji nisu unutar istog RNA transkripta. U trans-spajanju, ne postoji 5’ mjesto spajanja na molekuli pre mRNA za vezanje proteina U1. Umjesto toga, capped splice leader (SL) RNA je trans-spojen na sekvencu u outronu.
Slika 02: Trans spajanje
Outron je regija pre mRNA između 5’ kape i mjesta trans spajanja. Međutim, U2 protein se obično veže za 3’ mjesto spajanja. Nakon uklanjanja outrona, spojni vodeći (SL) egzon se spaja s prvim egzonom na pre mRNA. Nadalje, trans-spajanje je mehanizam koji se opaža kod određenih mikroorganizama kao što su protisti klase Kinetoplastae za ekspresiju gena.
Koje su sličnosti između Cis i Trans spajanja?
- Cis i trans spajanje dvije su vrste mehanizama spajanja RNA.
- U oba mehanizma, introni su uklonjeni.
- Također, u oba mehanizma, egzoni se spajaju kako bi formirali zrelu mRNA.
- Oba mehanizma nalaze se kod eukariota.
- Ovi mehanizmi nedostaju kod prokariota.
Koja je razlika između Cis i Trans spajanja?
Cis splajsing je intramolekularni mehanizam koji uklanja introne i spaja egzone koji se nalaze unutar istog RNA transkripta, dok je trans-splajzing intermolekularni mehanizam koji uklanja introne ili outrone i spaja egzone koji nisu unutar iste RNA prijepis. Dakle, ovo je ključna razlika između cis i trans spajanja. Nadalje, u cis spajanju, introni se uklanjaju kako bi se formirala zrela mRNA. S druge strane, u trans spajanju introni ili outroni se uklanjaju kako bi se formirala zrela mRNA.
Sljedeća infografika navodi razlike između cis i trans spajanja u tabelarnom obliku za usporedbu.
Sažetak – Cis vs Trans spajanje
Spajanje RNA je oblik obrade RNA prije procesa sinteze proteina. Cis i trans spajanje dvije su vrste mehanizama spajanja RNA koji se nalaze u eukariota. Cis splajsing je intramolekularni mehanizam koji uklanja introne i spaja egzone koji se nalaze unutar istog RNA transkripta, dok je trans-splajzing intermolekularni mehanizam koji uklanja introne ili outrone i spaja egzone koji nisu unutar istog RNA transkripta. Dakle, ovo zaključuje raspravu o razlici između cis i trans spajanja.
