Koja je razlika između jezgre RNA polimeraze i holoenzima

2024 Autor: Alex Aldridge | [email protected]. Zadnja promjena: 2023-12-17 13:40

Ključna razlika između jezgre RNA polimeraze i holoenzima je u tome što je jezgra RNA polimeraze enzim koji nema sigma faktor, dok je holoenzim RNA polimeraze enzim koji se sastoji od sigma faktora.

Transkripcija kod bakterija je proces u kojem se segment bakterijske DNA kopira u novosintetizirani mRNA lanac uz pomoć enzima RNA polimeraze. Ovaj se proces odvija u tri glavna koraka: inicijacija, elongacija i završetak. Bakterijska RNA polimeraza sastoji se od 6 podjedinica. Jezgra RNA polimeraze sastoji se od β, β′, α2 i ω podjedinica. Ova jezgra RNA polimeraze transformira se u holoenzim kada se σ (sigma) faktor veže na enzim jezgre. Jezgra RNA polimeraze i holoenzim dva su oblika enzima bakterijske RNA polimeraze.

Što je jezgra RNA polimeraze?

Jezgra RNA polimeraze je enzim uključen u bakterijsku transkripciju koji je slobodan od sigma faktora. Sastoji se od 5 podjedinica označenih kao β, β′, α2 i ω. Ovaj enzim ne pokreće specifičnu transkripciju s promotora DNA bakterija i faga. To je zato što ne prepoznaje nikakve specifične DNA promotore bakterija ili faga. Međutim, ovaj enzim zadržava sposobnost transkripcije RNA iz nespecifičnih inicijacijskih sekvenci. Štoviše, dodavanje sigma faktora ovom enzimu omogućuje enzimu da pokrene sintezu RNA iz specifičnih bakterijskih i fagnih promotora. Molekularna težina enzima jezgre RNA polimeraze je približno 400 kDa.

Slika 01: Jezgra RNA polimeraze

Jezgreni enzim sadrži katalitička svojstva RNA polimeraze. α podjedinica je homodimer veličine 36,5 kDa. Kodiran je genom rpoA. Funkcije ove podjedinice su sklapanje RNAP-a, interakcije s DNA i faktori transkripcije za regulaciju transkripcije. Β podjedinica je veličine 150,4 kDa. Kodiran je genom rpoB. Funkcije ove podjedinice su vezanje DNA i RNA, sinteza RNA, vezanje NTP, mjesto vezivanja RMP i vezanje faktora σ. β' podjedinica je veličine 155 kDa, a kodirana je genom rpoC. Funkcije ove podjedinice su vezanje DNA, sinteza RNA, katalitička Mg^{2+ koordinacija, ppGpp mjesto vezivanja 1 i vezanje faktora σ. Nadalje, faktor ω je veličine 10,2 kDa i kodiran je genom rpoZ. Funkcija ω faktora je RNAP savijanje i ppGpp mjesto vezivanja 1.}

Što je RNA polimeraza holoenzim?

holoenzim RNA polimeraze sastoji se od specifične komponente poznate kao sigma faktor osim β, β', α2 i ω podjedinica. Zbog sigma faktora holoenzim RNA polimeraze može prepoznati promotore. Faktor sigma također pomaže u pravilnom postavljanju holoenzima RNA polimeraze i odmotavanju na početnom mjestu. Nakon što sigma faktor izvrši svoju potrebnu i specifičnu funkciju, on se odvaja od holoenzima RNA polimeraze, dok katalitički dio (β, β', α2 i ω) RNA polimeraze ostaje u DNA i nastavlja s transkripcijom.

Slika 02: RNA polimeraza holoenzim

Broj sigma faktora varira između vrsta bakterija. E. coli ima sedam sigma faktora. Štoviše, sigma faktori se razlikuju po svojim karakterističnim molekulskim težinama. Na primjer, σ⁷⁰ je sigma faktor s molekularnom težinom od 70 kDa. Bakterije koriste različite sigma faktore u različitim uvjetima okoline. Primjeri različitih σ faktora uključuju; σ¹⁹, σ²⁴, σ¹⁸, σ³², σ³⁸, i σ⁵⁴

Koje su sličnosti između jezgre RNA polimeraze i holoenzima?

• Jezgra RNA polimeraze i holoenzim dva su oblika enzima bakterijske RNA polimeraze.
• Oba oblika sudjeluju u bakterijskoj transkripciji.
• Imaju podjedinice.
• One su proteinske molekule sastavljene od aminokiselina.

Koja je razlika između jezgre RNA polimeraze i holoenzima?

RNA polimeraza jezgra je enzim koji nema sigma faktor, dok je RNA polimeraza holoenzim enzim koji se sastoji od sigma faktora. Dakle, ovo je ključna razlika između jezgre RNA polimeraze i holoenzima. Nadalje, jezgra RNA polimeraze uglavnom sudjeluje u koraku elongacije transkripcije, dok holoenzim RNA polimeraze uglavnom katalizira u koraku inicijacije transkripcije.

Infografija u nastavku predstavlja razlike između jezgre RNA polimeraze i holoenzima u tabličnom obliku za usporedbu.

Sažetak – jezgra RNA polimeraze nasuprot holoenzima

Bakterijska RNA polimeraza je enzim ovisan o više podjedinica DNA. Sudjeluje u transkripciji bakterija. To je ključni enzim ekspresije gena i meta regulacije. Jezgra RNA polimeraze i holoenzim dva su oblika enzima bakterijske RNA polimeraze. Jezgra RNA polimeraze nema sigma faktor, dok se holoenzim RNA polimeraze sastoji od sigma faktora. Dakle, ovo sažima razliku između jezgre RNA polimeraze i holoenzima.