Ključna razlika između snRNA i snoRNA je u tome što snRNA uključuje alternativno spajanje pre-mRNA dok snoRNA uključuje modificiranje rRNA i tRNA, uređivanje mRNA i utiskivanje genoma.
Male RNA su polimerne RNA molekule koje se sastoje od manje od 200 nukleotida. Obično nisu kodirani. Oni postoje među glasničkim RNA za prijenos signala. Male RNA potječu od savršene dvolančane RNA, koja nastaje djelovanjem RNA-ovisne RNA polimeraze. Male RNA igraju važnu ulogu u staničnoj diferencijaciji, rastu i proliferaciji, apoptozi, metabolizmu, migraciji i obrani. Stoga su male RNA važni i kritični regulatori razvoja i fiziologije. Mala nuklearna RNA i mala nukleolarna RNA dvije su klase malih molekula RNA.
Što je snRNA?
Mala nuklearna RNA ili snRNA je klasa malih RNA molekula koje se nalaze u jezgri eukariotskih stanica. Prosječna duljina snRNA je približno 150 nukleotida. RNA polimeraza II ili RNA polimeraza III prepisuju snRNA. Glavna funkcija snRNA je procesiranje pre-messenger RNA u jezgri. Oni također pomažu u regulaciji faktora transkripcije ili RNA polimeraze II i održavanju telomera.
Slika 01: Mehanizam djelovanja male RNA
Postoje dvije klase snRNA na temelju zajedničkih značajki sekvence i povezanih proteinskih čimbenika kao što je LSm protein koji veže RNA. Dvije klase su snRNA klase Sm i snRNA klase Lsm. SnRNA klase Sm sastoji se od visokog sadržaja uridina U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 i U12. RNA polimeraza II prepisuje snRNA SM klase. Nakon transkripcije pre-snRNA, obično dobivaju 7-metilgvanozin 5’ kapu u jezgri. Zatim se izvoze u citoplazmu kroz nuklearne pore na daljnju obradu. SnRNA klase Lsm ima visok sadržaj uridina U6 i U6atac. RNA polimeraza III transkribira snRNA klase Lsm i ne napušta jezgru. Najčešće ljudske komponente snRNA su U1 spliceosomalna RNA, U2 spliceosomalna RNA, U4 spliceosomalna RNA, U5 spliceosomalna RNA i U6 spliceosomalna RNA.
Što je snoRNA?
Mala nukleolarna RNA ili snoRNA je klasa malih RNA molekula koje vode kemijske modifikacije u drugim RNA kao što su ribosomalna RNA, prijenosna RNA i mala nuklearna RNA. Svaka molekula snoRNA povezana je s oko četiri jezgra proteina u kompleksu RNA/protein tijekom procesa modifikacije. SnoRNA sadrži antisense element koji ima oko 10-20 nukleotida. Ove su baze komplementarne sekvenci koja okružuje nukleotide koji ciljaju modifikaciju u pre-RNA molekuli.
Slika 02: Mala nukleolarna RNA
Postoje dvije klase snoRNA. To su C/D box snoRNA i H/ACA box snoRNA. C/D box snoRNA povezana je s metilacijom, a H/ACA box snoRNA povezana je s pseudo-uridilacijom. Svaka molekula snoRNA djeluje kao vodič za jednu ili dvije modifikacije u ciljnoj RNA. C/D kutija snoRNA sadrži dva kratka očuvana sekvencijska motiva C i D, u blizini 5’ odnosno 3’ kraja snoRNA. Kratke regije koje se sastoje od 5 nukleotida raspoređene su uzvodno od C kutije i nizvodno od D kutije i tvore strukturu matične kutije. Time se motivi C i D okvira približavaju. Struktura matične kutije važna je za ispravnu sintezu snoRNA i lokalizaciju nukleola. H/ACA box snoRNA ima sekundarnu strukturu koja se sastoji od dvije ukosnice i dvije jednolančane regije. Ovo je općenito poznato kao struktura ukosnica-šarke-ukosnica-rep. H/ACA box snoRNA također se sastoji od dva očuvana motiva H i ACA. Oba su smještena u jednolančanim regijama. H kutija je u zglobu, a ACA je u repnoj regiji. Tri nukleotida tvore 3’ kraj niza.
Koje su sličnosti između snRNA i snoRNA?
- snRNA i snoRNA su male RNA.
- Oboje je prisutno u eukariotskim stanicama.
- Oboje su nekodirajuće RNA molekule.
- Štoviše, oni sudjeluju u modificiranju RNK tijekom procesa transkripcije.
Koja je razlika između snRNA i snoRNA?
snRNA sudjeluje u alternativnom spajanju pre-mRNA dok snoRNA uglavnom modificira molekule RNA. Dakle, ovo je ključna razlika između snRNA i snoRNA. Nadalje, snRNA duge su oko 150 nukleotida i često se pronađu povezane sa skupinom proteina i kompleksa koji se nazivaju mali nuklearni ribonukleoproteini. snoRNA duge su oko 60-170 nukleotida i uglavnom se nalaze u jezgrici.
Štoviše, snRNA se prepisuju ili pomoću RNA polimeraze II ili RNA polimeraze III, dok se snoRNA prepisuje samo pomoću RNA polimeraze II.
Infografija u nastavku predstavlja razlike između snRNA i snoRNA u obliku tablice za usporedbu.
Sažetak – snRNA vs snoRNA
snRNA i snoRNA su klase malih molekula RNA. snRNA sudjeluje u alternativnom spajanju pre-mRNA dok snoRNA uglavnom modificira molekule RNA. Dakle, ovo je ključna razlika između snRNA i snoRNA. Male RNA su polimerne molekule RNA koje se sastoje od manje od 200 nukleotida i obično nisu kodirajuće. snRNA se nalaze u jezgri eukariota. snoRNA se nalaze u arhejama i eukariotima. Transkripcija snRNA odvija se preko RNA polimeraze II i II, dok je samo RNA polimeraza II uključena u prepisivanje snoRNA. Dakle, ovo sažima razliku između snRNA i snoRNA.
