Ključna razlika između DNA transpozona i retrotranspozona je u tome što su DNA transpozoni mobilni genetski elementi koji se pomiču s jednog mjesta na drugo u genomu pomoću mehanizma izreži i zalijepi, dok su retrotranspozoni mobilni genetski elementi koji se pomiču s jednog mjesta drugom u genomu pomoću mehanizma kopiranja i lijepljenja.
Mobilni genetski elementi (MGE) su segmenti DNK koji kodiraju specifične enzime i proteine koji posreduju u njihovom kretanju unutar genoma ili koji se mogu prenositi s jedne vrste na drugu. Također su poznati kao sebični genetski elementi. Transpozibilni elementi predstavljaju jedan od nekoliko tipova mobilnih genetskih elemenata. Postoje dvije glavne vrste prijenosnih elemenata: DNA transpozoni i retrotranspozoni. Stoga su DNA transpozoni i retrotranspozoni mobilni genetski elementi koji se mogu kretati s mjesta na mjesto u genomu.
Što su DNK transpozoni?
DNA transpozoni su mobilni genetski elementi koji se pomiču s jednog mjesta na drugo u genomu pomoću mehanizma izreži i zalijepi. Oni pripadaju prijenosnim elementima klase II koji se kreću kroz DNA intermedijer. Ovo je suprotno prijenosnim elementima klase I (retrotranspozoni) koji se kreću kroz RNA intermedijer. Obično se transpozoni DNA kreću u genomu koristeći metodu izreži i zalijepi. Ova metoda zahtijeva enzim transpozazu koji katalizira kretanje DNK s njezine trenutne lokacije u genomu i umetanje na novo mjesto.
Slika 01: DNA transpozoni
Ova transpozicija zahtijeva tri DNK mjesta na transpozonu (dva na svakom kraju transpozona koja se zovu terminalna invertirana ponavljanja i jedno na ciljnom mjestu). Enzim transpozaza će se vezati na završna invertirana ponavljanja transpozona i posreduje u sinapsi krajeva transpozona. Zatim enzim transpozaza odspaja element od bočne DNK izvornog donorskog mjesta i posreduje u spajanju transposona na novo mjesto umetanja u genom. Dodavanje transpozona na novo mjesto uzrokuje kratke praznine s obje strane umetnutog segmenta. Sustavi domaćini popravljaju te praznine, što rezultira udvostručenjem ciljne sekvence (TSD), što je karakteristično za transpoziciju.
Što su retrotranspozoni?
Retrotranspozoni su mobilni genetski elementi koji se pomiču s jednog mjesta na drugo u genomu pomoću mehanizma kopiranja i lijepljenja. Pripadaju prijenosnim elementima klase I. Prijenosni elementi klase I (retrotranspozoni) kreću se kroz RNA intermedijer u genomu. Oni su vrsta genetske komponente koja se kopira i lijepi na različite genomske lokacije.
Slika 02: Retrotranspozoni
Prvo se prepisuju s DNK na RNK. Zatim se proizvedena RNK obrnuto prepisuje u DNK. Ova kopirana DNK kasnije se umeće natrag u genom na novom mjestu. Reverznu transkripciju katalizira reverzna transkriptaza. Reverznu transkriptazu često kodira sam retrotranspozon. Integraciju provodi enzim koji se zove integraza. Nadalje, obično postoje tri tipa: duga terminalna ponavljanja (LTR), dugi isprekidani nuklearni elementi (LINE) i kratki isprekidani nuklearni elementi (SINE).
Koje su sličnosti između DNA transpozona i retrotranspozona?
- DNA transpozoni i retrotranspozoni su mobilni genetski elementi.
- Oboje se svrstava u prijenosne elemente.
- Oba su poznata kao geni za skakanje.
- Mogu se kretati s mjesta na mjesto u genomu.
- Oni su evolucijski vrlo važni.
Koja je razlika između DNA transpozona i retrotranspozona?
DNA transpozoni su mobilni genetski elementi koji se pomiču s jednog mjesta na drugo u genomu pomoću mehanizma izreži i zalijepi, dok su retrotranspozoni mobilni genetski elementi koji se pomiču s jednog mjesta na drugo u genomu pomoću kopiranja i mehanizam za lijepljenje. Dakle, ovo je ključna razlika između DNA transpozona i retrotranspozona. Nadalje, transpozoni DNA pripadaju prijenosnim elementima klase II, dok retrotranspozoni pripadaju prijenosnim elementima klase I.
Infografija u nastavku predstavlja razlike između DNA transpozona i retrotranspozona u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – DNK transpozoni vs retrotranspozoni
DNA transpozoni i retrotranspozoni su mobilni genetski elementi. Transpozoni DNK sele s jednog mjesta na drugo u genomu pomoću mehanizma rezanja. Retrotranspozoni se kreću s jednog mjesta na drugo u genomu pomoću mehanizma kopiranja i lijepljenja. Dakle, ovo sažima razliku između DNA transpozona i retrotranspozona.
