Ključna razlika – plazmid u odnosu na transpozon
Bakterije sadrže kromosomsku i nekromosomsku DNA. Kromosomska DNA igra važnu ulogu u rastu bakterija. Nekromosomska DNA ne kodira bitne gene za preživljavanje bakterija. Plazmid je vrsta prokariotske nekromosomske DNA. Oni su mala, kružna dvolančana DNK koja daje dodatne genetske prednosti bakterijama. Transpozon je sekvenca DNK koja se može pomicati na nove pozicije unutar genoma. Također su poznati kao mobilni genetski materijal bakterija. Ključna razlika između plazmida i transposona je u tome što je plazmid nekromosomska DNA koja se neovisno replicira unutar bakterije, dok je transpozon segment kromosomske DNA koji se translocira unutar genoma bakterija i mijenja genetski slijed kromosoma.
Što je plazmid?
Plazmid je ekstrakromosomska DNK prokariota. Može se replicirati neovisno o bakterijskom kromosomu. Jedna bakterija može imati nekoliko plazmida u sebi. Plazmidi su zatvoreni kružni komadići DNK i male su veličine. Plazmidna DNA nosi nekoliko gena koji nisu bitni za preživljavanje bakterije. Međutim, ti geni u plazmidima pružaju dodatne genetske prednosti bakterijama kao što su otpornost na antibiotike, otpornost na herbicide, otpornost na teške metale itd. Posebni plazmidi koji se nazivaju plazmidi faktora F uključeni su u bakterijsku konjugaciju, što je spolna metoda reprodukcije.
Plazmidi se koriste kao vektori u tehnologiji rekombinantne DNA i kloniranju gena. Plazmidi posjeduju posebna svojstva koja ih čine prikladnima za korištenje kao rekombinantni vektori u genetskom inženjeringu. Sadrže podrijetlo replikacije, markerske gene koji se mogu birati, dvolančanu prirodu, malu veličinu i više mjesta za kloniranje. Istraživači mogu lako otvoriti plazmidnu DNK i umetnuti željene DNK fragmente ili gene u plazmide kako bi napravili rekombinantnu DNK. Osim toga, transformacija rekombinantnog plazmida u bakteriju domaćina lakša je od ostalih vektora.
Slika 01: Plazmidi
Što je Transposon?
Transpozon je fragment ili sekvenca DNK koja se može translocirati unutar bakterijskog genoma. Oni su mobilni DNA slijedovi. Oni se sele na nova mjesta genoma. Ovi pokreti čine promjene u sekvenci bakterijskog genoma, uzrokujući značajne promjene u genetskim informacijama. Oni su prenosivi genetski elementi odgovorni za uspostavljanje novih genetskih sekvenci u bakterijama. Transpozone je prva otkrila Barbara McClintock 1940-ih kroz pokuse provedene s kukuruzom i za svoj je rad dobila Nobelovu nagradu.
Transpozoni se ponekad nazivaju skačući geni jer ti skačući slijedovi mogu blokirati transkripciju gena i preurediti genetski materijal bakterije. Oni su također odgovorni za kretanje gena otpornosti na lijekove, otpornosti na antibiotike između plazmida i kromosoma.
Postoje dvije vrste transpozona na temelju mehanizma koji koriste za pomicanje i umetanje. Oni su transpozon klase I (retrotranspozoni) i transpozon klase II (transpozoni DNA). Transpozoni klase I koriste mehanizam "kopiraj i zalijepi" dok transpozoni klase II koriste mehanizam "izreži i zalijepi".
Transpozon se može kretati od plazmida do kromosoma ili između dva plazmida. Zbog tih kretanja dolazi do miješanja gena među vrstama bakterija. Stoga se transpozoni koriste kao vektori u genetičkom inženjeringu za uklanjanje i integraciju genetskih sekvenci u organizme.
Slika 02: Bakterijski DNK transpozon
Koja je razlika između plazmida i transpozona?
Plazmid protiv transpozona |
|
| Plazmid je mala kružna dvolančana nekromosomska DNA bakterija. | Transpozon je segment DNK koji se može kretati na nova mjesta unutar genoma. |
| Samoreplikacija | |
| Plazmidi se mogu replicirati neovisno o kromosomskoj DNK. | Transpozoni se ne mogu neovisno replicirati. |
| Kodirane posebne karakteristike | |
| Plazmidi pružaju nekoliko značajki kao što su otpornost na antibiotike i virulencija. | Transpozoni ne kodiraju posebna svojstva. |
| Koristi kao vektor | |
| Plazmidi se koriste kao vektori u genetičkom inženjeringu za izradu rekombinantne DNA. | Transpozoni se također koriste kao vektori u genetičkom inženjeringu za insercijsku mutagenezu. |
| Mutacije i promjene u sekvenci | |
| Plazmidi ne mogu uzrokovati značajne mutacije i promijeniti sekvencu i veličinu genoma. | Transpozicija može stvoriti značajne mutacije i promijeniti sekvencu i veličinu genoma. |
Sažetak – plazmid protiv transpozona
Plazmid je ekstrakromosomska DNK koja se obično nalazi u bakterijama. Ima sposobnost repliciranja neovisno o bakterijskoj kromosomskoj DNA. Plazmidi sadrže gene koji dodaju genetske prednosti bakterijama. Međutim, plazmidna DNA nije neophodna za preživljavanje bakterija. Transpozoni su mobilni genetski elementi koji skaču s jednog mjesta na novo unutar genoma. Oni mogu izazvati mutacije i promijeniti veličinu i redoslijed genoma. Ovo je razlika između plazmida i transposona.
