Ključna razlika – eukariotski naspram prokariotski promotori
Transkripcija je proces pretvaranja genetske informacije pohranjene u kodirajućoj sekvenci DNK u sekvencu mRNA. Specifična regija DNK koja se nalazi na 5’ kraju transkripcijske jedinice inicira ovaj proces. Ta je regija poznata kao promotorska regija. Ti se promotori obično nalaze u blizini mjesta početka transkripcije. Duljina promotora varira od 100 bp do 1000 bp. Promotori se razlikuju prema vrsti organizma. Eukariotski i prokariotski promotori međusobno se razlikuju. U prokariota su pronađena samo tri tipa promotorskih sekvenci, -10 promotori, -35 promotori i uzvodni elementi. Kod eukariota postoji mnogo različitih promotorskih elemenata kao što su TATA box, inicijatorski elementi, GC box, CAAT box, itd. Ovo je ključna razlika između eukariotskih i prokariotskih promotora.
Što su eukariotski promotori?
Tri glavne porcije; središnji promotor, proksimalni promotor i distalni promotor zajedno čine promotor. U kontekstu eukariota postoji veliki broj promotorskih elemenata koji su vrlo sofisticirani i raznolikiji od promotora. Utvrđeno je da, zbog ove složenosti eukariotskih promotora, DNK ima sposobnost samosavijanja. Ovo također objašnjava činjenicu da se učinak mnogih regulacijskih sekvenci odvija iako su smještene mnogo kilobaza dalje od mjesta transkripcije. Ovi eukariotski promotori imaju sposobnost prolaska kroz širok raspon DNK sekvenci.
Slika 01: Eukariotski promotor
Primjeri za neke eukariotske promotore su Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box itd. U kontekstu TATA box-a, to je niz od 5' – TATAA -3' koji je prisutan u jezgri regija promotora. Za TATA kutiju vezani su proteini faktora transkripcije i proteini histona. Vezanje proteina faktora transkripcije na TATA kutiju pomaže u vezanju RNA polimeraze, što zatim rezultira stvaranjem transkripcijskog kompleksa. Jednostavno rečeno, vezanje ovih proteina će pokrenuti proces transkripcije. Ovaj proces će biti inhibiran kada se histonski proteini vežu za TATA kutiju. Stoga je TATA kutija važan promotorski element koji uključuje regulaciju brzine eukariotske transkripcije.
Što su prokariotski promotori?
U prokariotskim organizmima, promotor koji je uključen u transkripciju identificiran je pridruženim faktorom koji se naziva sigma faktor. Sigma faktori su jedinstveni za različite promotorske sekvence. Stoga se kaže da bi svaki pojedini sigma faktor prepoznao jednu jezgru promotorske sekvence. Ovo je jedinstvena karakteristika koja je prisutna u prokariotskom procesu transkripcije. I RNA polimeraza i sigma faktor zajednički identificiraju ispravnu promotorsku regiju i tvore transkripcijski kompleks.
Prokariotski promotor sadrži samo tri vrste promotorskih elemenata. Manja uključenost promotorskih elemenata u prokariota glavni je razlog zašto je njihov proces transkripcije manje sofisticiran u usporedbi s eukariotskom transkripcijom koja uključuje veći broj promotorskih sekvenci. Od tri promotorska elementa prokariota, postoje dva glavna važna dva kratka niza DNA. Ovi nizovi su klasificirani prema njihovom položaju. Oni su -10 promotori ili element (koji je prisutan 10 bp uzvodno od mjesta početka transkripcije), -35 promotori ili element (koji je prisutan 35 bp uzvodno od mjesta početka transkripcije).
Slika 02: Prokariotski promotor
Promotor -10 ekvivalentan je eukariotskom TATA boksu ili Pribnow boksu i bitna je komponenta za početak transkripcije u prokariota. Promotor -35 sastoji se od sekvence koja je TTGACA koja aktivno sudjeluje u regulaciji brzine prokariotske transkripcije.
Koje su sličnosti između eukariotskih i prokariotskih promotora?
- U obje vrste, promotori su kontrolirani različitim regulatornim sekvencama DNK koje uključuju pojačivače, prigušivače, izolatore i granične elemente.
- Promotori su sekvencije koje započinju transkripciju kod prokariota i eukariota.
- Promotori su sekvence DNK.
Koja je razlika između eukariotskih i prokariotskih promotora?
Eukariotski vs prokariotski promotori |
|
| Eukariotski promotori su regulatorne sekvence koje iniciraju transkripciju eukariotskih organizama. | Prokariotski promotori su regulatorne sekvence koje započinju transkripciju prokariotskih gena. |
| Elementi | |
| Prokariotski promotor sastoji se od uzvodnih elemenata, -10 elementa i -35 elemenata. | Eukariotski promotor sastoji se od Pribnow box-a (TATA box-a), CAAT box-a, GC box-a i elemenata inicijatora. |
Sažetak – Eukariotski vs prokariotski promotori
Promotor je regija DNK koja uključuje inicijaciju procesa koji se naziva transkripcija. Ti se promotori obično nalaze uzvodno od mjesta početka transkripcije. Tri glavna dijela koji tvore promotor su središnji promotor, proksimalni promotor i distalni promotor. U kontekstu eukariota, postoji veliki broj promotivnih elemenata u promotorskoj regiji koji su vrlo sofisticirani i raznolikiji od prokariota. Primjeri nekih eukariotskih promotorskih elemenata su Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box itd. U prokariotima postoje dva glavna važna promotorska elementa, naime -10 element (koji je prisutan 10bp uzvodno od mjesta početka transkripcije), -35 element (koji je prisutan 35 bp uzvodno od mjesta početka transkripcije). -10 promotor inicira transkripciju, a -35 promotor regulira transkripciju. Obje vrste promotora kontroliraju različite regulacijske sekvence DNA koje uključuju pojačivače, prigušivače, izolatore i granične elemente. Ovo je razlika između eukariotskih i prokariotskih promotora.
Preuzmite PDF eukariotski vs prokariotski promotori
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti ga za izvanmrežne svrhe prema napomeni o citatu. Ovdje preuzmite PDF verziju: Razlika između eukariotskog i prokariotskog promotora
