Ključna razlika između VNTR i sonde je u tome što je VNTR kratka nukleotidna sekvenca koja se pojavljuje kao tandemsko ponavljanje u genomu, dok je sonda umjetno sintetizirana kratka sekvenca DNA ili RNA koja se može radioaktivno obilježiti.
VNTR označava tandemsko ponavljanje promjenjivog broja. To je kratki nukleotidni niz organiziran u tandemskim ponavljanjima u genomu. VNTR se prirodno pojavljuju u našem genomu. Proba je umjetno sintetizirana kratka sekvenca DNA ili RNA. I sonda i VNTR su nukleinske kiseline ili kratke nukleotidne sekvence. Imaju golemu primjenu u različitim tehnikama molekularne biologije, uglavnom u forenzičkim studijama. VNTR i sonda imaju neke sličnosti, ali i razlike. Stoga članak pokušava istaknuti razliku između VNTR-a i sonde.
Što je VNTR?
VNTR je kratka nukleotidna sekvenca koja postoji kao tandemsko ponavljanje u našem genomu. VNTR su prisutni u mnogim kromosomima. Nadalje, VNTR-ovi se razlikuju među različitim pojedincima po duljini jer je broj ponavljanja različit u VNTR-ovima različitih ljudi. Uglavnom, to je zbog alela naslijeđenih od roditelja. Stoga VNTR-ove uglavnom koristimo za identifikaciju roditelja (nasljeđivanje) ili za osobne svrhe. Slično, također ih je moguće koristiti u genetici, forenzici, biološkim istraživanjima i DNK otiscima. Stoga je VNTR važan alat u molekularnoj biologiji.
Slika 01: VNTR
U nasljeđivanju analiziramo VNTR podatke pomoću dva osnovna principa: podudaranje nasljeđa i podudaranje identiteta. Tijekom usklađivanja nasljeđivanja, pojedinac mora imati alel koji odgovara onom od svakog roditelja. Tijekom podudaranja identiteta oba VNTR alela moraju biti prisutna na određenoj lokaciji genoma.
Što je sonda?
U kontekstu molekularne biologije, sonda je umjetno sintetiziran DNA ili RNA fragment duljine od 100 do 1000 baza. Možemo radioaktivno označiti ove sonde. Stoga ih koristimo u otkrivanju ciljnih nukleotidnih sekvenci koje su komplementarne sekvenci sonde. Kada uzorku dodamo sonde, hibridizacija se odvija s komplementarnim sekvencama ili ciljnim sekvencama i olakšava nam identifikaciju ciljnih sekvenci. Budući da sonde nose radioaktivnost, možemo ih lako otkriti.
Slika 02: Sonda
U forenzičkoj znanosti obično koristimo sonde u tehnikama profiliranja DNK kao što su detekcija kratkih tandemskih ponavljajućih regija, polimorfizam dužine restrikcijskih fragmenata i otisak prsta DNK.
Koje su sličnosti između VNTR-a i sonde?
- Nukleinske kiseline su građevni blokovi VNTR-a i sonde.
- Koristimo ih u procesima identifikacije gena.
- Također, obje njihove duljine su promjenjive.
- Oni su važni alati u forenzičkim studijama, DNK otiscima, genetici itd.
Koja je razlika između VNTR-a i sonde?
VNTR je regija genoma organizirana kao tandem ponavljanja dok je sonda kratka sekvenca DNA ili RNA sintetizirana umjetno kako bi se otkrile ciljne sekvence u uzorku. Dakle, ovo je ključna razlika između VNTR-a i sonde. Također, važna razlika između VNTR-a i sonde je da za razliku od VNTR-a, sonde možemo radioaktivno označiti.
Štoviše, VNTR uglavnom izvode roditeljske identifikacije dok sonde pomažu otkriti ciljne sekvence nukleotida u uzorcima DNK ili RNK koji su komplementarni sekvenciji sonde. Dakle, ovo je također značajna razlika između VNTR i sonde.
Sljedeća infografika predstavlja više informacija o razlici između VNTR-a i sonde.
Sažetak – VNTR protiv sonde
Uobičajena upotreba VNTR-a i sonde je u tehnikama molekularne analize kao što su forenzičke studije i DNK otisci. Oba se sastoje od promjenjivih duljina. Međutim, ključna razlika između VNTR i sonde je u tome što je VNTR regija genoma raspoređena s tandemskim ponavljanjima, dok je sonda fragment DNK ili RNK koji bi mogao biti radioaktivno obilježen. Štoviše, VNTR su prisutni u genomu. No, sonde su umjetno sintetizirane i mogu se obilježiti radioaktivno kako bi se otkrile ciljne sekvence nukleotida u uzorcima DNA ili RNA koje su komplementarne sekvenci u probi. Dakle, ovo je sažetak razlike između VNTR i sonde.
