Ključna razlika između proteinske podjedinice i domene je u tome što je proteinska podjedinica odvojeni polipeptidni lanac proteina koji se spaja s drugim polipeptidnim lancima u proteinski kompleks, dok je proteinska domena susjedna regija polipeptidnog lanca proteina koji se često neovisno savija u kompaktnu, lokalnu i polu-neovisnu jedinicu.
Proteinska podjedinica i domena vrlo su važni dijelovi multimernog proteina. Proteini su polimeri izgrađeni od polipeptida. Svaki polipeptidni lanac izgrađen je od monomera poznatog kao aminokiselina. Složeni protein sadrži različite strukturne jedinice kao što su podjedinice, domene, motiv i nabor. Ove strukturne jedinice složenog proteina izuzetno su važne za njegovu strukturu i konačno za njegovu funkciju.
Što je proteinska podjedinica?
Proteinska podjedinica je odvojeni polipeptidni lanac proteina koji se spaja s drugim polipeptidnim lancima u proteinski kompleks. U strukturnoj biologiji, proteinska podjedinica je jedna proteinska molekula koja se skuplja s drugim proteinskim molekulama kako bi formirala proteinski kompleks. Prirodni proteini imaju relativno mali broj podjedinica, kao što su hemoglobin i DNA polimeraza. Stoga se nazivaju oligomerni. Ostali proteini sastoje se od velikog broja podjedinica, pa se opisuju kao multimerni. Na primjer, mikrotubule i drugi proteini citoskeleta su multimerni. Podjedinice multimernog proteina mogu biti identične (homologne) ili potpuno različite (heterologne).
Slika 01: Podjedinica proteina
U nekim multimernim proteinima, jedna podjedinica može biti katalitička podjedinica. S druge strane, druga je regulatorna podjedinica. Funkcija katalitičke podjedinice je kataliziranje enzimske reakcije, dok je funkcija regulacijske podjedinice olakšavanje ili inhibiranje njezine aktivnosti. Enzim koji se sastoji i od katalitičke i regulatorne podjedinice kada se skupi obično se naziva holoenzim. Na primjer, fosfoinozitid 3-kinaza klase I enzima ima p110 katalitičku podjedinicu i p85 regulatornu podjedinicu. Štoviše, protein mora imati jedan gen za svaku podjedinicu. To je zato što se podjedinica sastoji od zasebnog polipeptidnog lanca koji ima jedan kodirajući gen.
Što je proteinska domena?
Proteinska domena je susjedna regija polipeptidnog lanca proteina koja se često neovisno savija u kompaktne, lokalne i polu-neovisne jedinice. Domena proteina također je poznata kao regija polipeptidnog lanca proteina koja se samostabilizira i savija neovisno o ostatku. Oni su posebna strukturna i funkcionalna jedinica u proteinu. Obično su domene odgovorne za određenu funkciju ili interakciju koja pridonosi ukupnoj ulozi proteina. Na primjer, SH3 domena sastoji se od oko 50 aminokiselinskih ostataka. Pojavljuju se u nizu različitih proteina, uključujući adapterske proteine, fosfatidilinozitol3-kinaze, fosfolipaze i miozine. Ove SH3 domene uključene su u interakcije protein-protein.
Slika 02: Domene proteina
Domene variraju u dužini od 50 aminokiselina do 250 aminokiselina. Najkraće domene, poput cinkovog prsta, stabilizirane su metalnim ionima i disulfidnim mostovima. Domena često proizvodi funkcionalne jedinice kao što je EF-ručna domena kalmodulina koja veže kalcij. Nadalje, genetskim inženjeringom se mogu mijenjati domene između jednog proteina u drugi kako bi se napravili himerni proteini.
Koje su sličnosti između podjedinice i domene proteina?
- Proteinska podjedinica i domena su strukturne jedinice multimernog proteina.
- Oboje se sastoji od aminokiselina.
- Oni su povezani s pojmom “polipeptidni lanac”.
- Štoviše, oboje su iznimno važni za cjelokupnu funkciju proteina.
Koja je razlika između podjedinice i domene proteina?
Proteinska podjedinica je odvojeni polipeptidni lanac proteina koji se spaja s drugim polipeptidnim lancima u proteinski kompleks. S druge strane, domena proteina je susjedna regija polipeptidnog lanca proteina koja se često neovisno savija u kompaktne, lokalne i polu-neovisne jedinice. Dakle, ovo je ključna razlika između proteinske podjedinice i domene. Štoviše, proteinska podjedinica je veće veličine od proteinske domene.
Sljedeća tablica sažima razliku između proteinske podjedinice i domene u tabličnom obliku.
Sažetak – Proteinska podjedinica u odnosu na domenu
Građevni blokovi proteina su aminokiseline. Proteini nastaju kondenzacijom aminokiselina. Proteinske strukture variraju u veličini od desetaka do nekoliko tisuća aminokiselina. Struktura proteina stabilizirana je nekovalentnim interakcijama kao što su vodikove veze, ionske veze, Van der Waalsove sile, hidrofobne veze i kovalentne interakcije kao što su disulfidne veze. Složeni protein sadrži različite strukturne jedinice kao što su podjedinice, domene, motiv i nabor. Proteinska podjedinica je odvojeni polipeptidni lanac proteina koji se spaja s drugim polipeptidnim lancima u proteinski kompleks. S druge strane, domena proteina je regija polipeptidnog lanca proteina koja se samostabilizira i savija neovisno o ostatku. Dakle, ovo je sažetak razlike između proteinske podjedinice i domene.
