Ključna razlika između motiva i domene je da motiv nije neovisno stabilan dok je domena neovisno stabilna.
Proteini su važne biološke makromolekule prisutne u našem tijelu. S druge strane, genetski kod gena će odlučiti o sekvenci aminokiselina proteina. Štoviše, proteini imaju primarnu, sekundarnu i tercijarnu strukturu. Primarna struktura je aminokiselinska sekvenca polipeptidnog lanca. Kada se polipeptidni lanci savijaju jedan s drugim, formira se sekundarna struktura proteina. U sekundarne strukture spadaju alfa spirale, beta listovi i supersekundarne strukture. Određene skupine super-sekundarnih elemenata poznate su kao proteinski motivi. Tercijarna struktura proteina odnosi se na njegovu trodimenzionalnu strukturu koja odlučuje o funkciji proteina. Domena je presavijeni dio proteinske molekule, koji je globularan i ima diskretnu funkciju. To je temeljna funkcionalna i trodimenzionalna struktura proteina.
Što je Motiv?
Motiv je određeno grupiranje super sekundarnih elemenata proteina kao što su alfa spirale i beta strukture. Oni su neka vrsta uzoraka prisutnih u različitim proteinima. Motivi opisuju obrasce preklapanja sekundarnih strukturnih elemenata i njihove interakcije. Ovi obrasci savijanja stabiliziraju se sličnim vezama koje su prisutne u tercijarnim strukturama. Međutim, one nisu tako složene kao tercijarne strukture.
Slika 01: Motiv
Oni su jednostavne kombinacije sekundarnih struktura proteina. Motiv sam po sebi nije stabilan. Nadalje, motivi objašnjavaju strukturu proteina, ali ne predviđaju funkciju proteina. Primjeri proteinskih motiva su beta-alfa-beta motiv, motiv grčkog ključa, Beta bačva, Beta-motiv meandra, itd.
Što je domena?
Domena je temeljna, funkcionalna i trodimenzionalna jedinica proteina. Obavlja određenu funkciju. Jedan protein može imati nekoliko različitih domena. Svaka domena je neovisna jedinica. To je kuglasta struktura. Odgovoran je za određenu funkciju ili interakciju. Domene se mogu koristiti za hipotezu funkcije neokarakteriziranog proteina. Prilikom analize proteina bitno je uzeti u obzir jer su domene funkcionalne jedinice proteina.
Slika 02: Tri različite domene piruvat kinaze
Domene su vrlo stabilne i kompaktne strukture. Mogu se lako razlikovati od drugih regija. Piruvat kinaza ima tri različite domene kao što je prikazano na slici 02. Duljina domene može varirati, a prosječna duljina je 100 aminokiselina. Svaka domena sadrži hidrofobnu jezgru izgrađenu od sekundarnih strukturnih jedinica. Nekoliko domena zajednički čini tercijarnu strukturu proteina.
Koje su sličnosti između motiva i domene?
- Motiv i domena jedinice su prisutne u samim proteinskim molekulama.
- Korisni su pri klasifikaciji obitelji proteina.
Koja je razlika između motiva i domene?
Motiv je određeno grupiranje super sekundarnih elemenata proteina kao što su alfa spirale i beta strukture dok je domena funkcionalna jedinica proteina. Nadalje, motiv je sekundarna struktura dok je domena odgovorna za tercijarnu strukturu proteina. Štoviše, domena je samostalna jedinica, za razliku od motiva. Također, domena prikazuje funkciju proteina dok motiv nije. Ovo su glavne razlike između motiva i domene. Donja infografika prikazuje razliku između motiva i domene u obliku tablice.
Sažetak – motiv naspram domene
Motiv je raspored sekundarnih struktura proteinske molekule. Obično nije stabilan sam po sebi, za razliku od domene. Domena je neovisno stabilna struktura proteina. Stoga može biti dio ili cijela proteinska molekula. To je trodimenzionalna temeljna funkcionalna jedinica proteina. Štoviše, ima funkciju i neovisna je jedinica. Motiv može biti dio domene. Ali domena ne može biti dio motiva. Ovo je razlika između motiva i domene.
