Ključna razlika između DNK bez stanica i cirkulirajuće DNK tumora je u tome što su DNK bez stanica različiti oblici DNK koji slobodno cirkuliraju krvlju, dok je cirkulirajuća tumorska DNK fragmentirana DNK tumora koja cirkulira krvlju.
DNA bez stanica i cirkulirajuća tumorska DNA dvije su vrste cirkulirajućih nukleinskih kiselina. Cirkulirajuće nukleinske kiseline otkrili su Mandel i Metal 1948. godine. Kasnije je otkriveno da je količina cirkulirajućih nukleinskih kiselina kod bolesnih pacijenata značajno visoka. Ovo je otkriće prvi put učinjeno u vezi s pacijentima s lupusom. Štoviše, cirkulirajuće nukleinske kiseline imaju veću prognostičku vrijednost i mogu se koristiti kao biomarker za otkrivanje raznih bolesti.
Što je Cell Free DNA?
DNK bez stanica (Cf DNK) odnosi se na različite oblike DNK kao što je cirkulirajuća tumorska DNK, mitohondrijska DNK bez stanica i fetalna DNK bez stanica, itd., koji slobodno cirkuliraju u krvi. Povišene razine bezstanične DNA opažene su u uznapredovalim bolestima kao što su rak, trauma, sepsa, infarkt miokarda, dijabetes, moždani udar, anemija srpastih stanica itd. Uz rak i fetalnu medicinu, bezstanična DNK koristan je biomarker za mnoštvo bolesti. Ova se DNK također može koristiti za otkrivanje odbacivanja presatka. Također se koriste u određivanju običnog stresa, prenatalnom razlikovanju spola i u testiranju očinstva.
Slika 01: DNK bez stanica
DNA bez stanica obično je dvolančana izvanstanična molekula DNA. Sastoji se od malih fragmenata (50 do 200 bp) i većih fragmenata (21 kb). Nadalje, već je prepoznat kao pouzdan biomarker za dijagnozu raka prostate i dojke. DNA bez stanica uglavnom cirkulira u krvotoku kao nukleosomi. Nukleosomi su nuklearni kompleksi histona i DNA. Cf DNA može se kvantificirati korištenjem različitih tehnika kao što su PCR, masivno paralelno sekvenciranje, ultraljubičasta spektrometrija, PicoGreen bojenje i ELISA. Budući da je detekcija Cf DNA u krvotoku brza, laka, neinvazivna metoda koja se ponavlja, u budućnosti će biti potencijalni biomarker za dijagnosticiranje brojnih bolesti poput autoimunih reumatskih bolesti i tumora.
Što je DNK cirkulirajućeg tumora?
Cirkulirajuća tumorska DNA (Ct DNA) je fragmentirana tumorska DNA koja cirkulira u krvi. Ima tumorsko podrijetlo. Kako cirkulirajući tumor može odražavati cijeli tumorski genom, stekao je veliku privlačnost zbog svoje potencijalne korisnosti u kliničkim postavkama. Tekuće biopsije, koje izvlače krv, mogu se koristiti za testiranje cirkulirajućih tumora.
Slika 02: DNK cirkulirajućeg tumora
Biološki procesi koji su vjerojatno uključeni u otpuštanje Ct DNA uključuju apoptozu i nekrozu iz umirućih stanica ili aktivno oslobađanje iz tumorskih stanica. U zdravim tkivima infiltrirani fagociti mogu očistiti Ct DNA. Nadalje, različite tehnike se mogu koristiti u analizi cirkulirajuće tumorske DNK kao što su digitalni PCR s kapljicama, BEAMing, CAPP-Seq (duboko sekvenciranje), sigurno sekvenciranje i dupleks sekvenciranje.
Koje su sličnosti između DNK bez stanica i DNK cirkulirajućeg tumora?
- DNA bez stanica i cirkulirajuća tumorska DNA dvije su vrste cirkulirajućih nukleinskih kiselina.
- Sastoje se od nukleotida.
- Obje vrste mogu se koristiti kao potencijalni markeri za dijagnosticiranje raznih bolesti u kliničkim postavkama.
- Nalaze se u krvotoku.
- Oboje su izvanstanični oblici molekula DNK.
- Oboje se uklanjaju infiltracijom fagocita.
Koja je razlika između DNK bez stanica i DNK cirkulirajućeg tumora?
DNK bez stanica su različiti oblici DNK kao što je cirkulirajuća tumorska DNK, mitohondrijska DNK bez stanica i fetalna DNK bez stanica, itd., koji slobodno cirkuliraju u krvi, dok je cirkulirajuća DNK tumora fragmentirana DNK nastala iz tumora koji cirkulira u krvi. Dakle, ovo je ključna razlika između DNK bez stanica i DNK tumora u cirkulaciji. Nadalje, DNA bez stanica cirkulira u fragmentima u rasponu od 50-220 bp dok cirkulirajuća tumorska DNA cirkulira u fragmentima u rasponu od 134-144 bp.
Sljedeća infografika predstavlja razliku između DNK bez stanica i DNK tumora u cirkulaciji u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – DNK bez stanica naspram DNK cirkulirajućeg tumora
Cirkulirajuće nukleinske kiseline izbacuju se u krvotok reguliranim ili slučajnim mehanizmima. Slobodna DNA stanica i cirkulirajuća tumorska DNA dvije su vrste cirkulirajućih nukleinskih kiselina. DNK bez stanica su različiti oblici DNK kao što je cirkulirajuća tumorska DNK, mitohondrijska DNK bez stanica, fetalna DNK bez stanica koje slobodno cirkuliraju u krvi dok je cirkulirajuća tumorska DNK fragmentirana DNK tumora koja cirkulira u krvi. Dakle, ovo sažima razliku između DNK bez stanica i DNK tumora u cirkulaciji.
