Ključna razlika – YAC vs BAC vektori
Vektori se koriste u molekularnom kloniranju. Vektor se može definirati kao molekula DNK koja se ponaša kao sredstvo za prijenos stranog genetskog materijala u drugu stanicu. Vektor koji sadrži stranu DNK poznat je kao rekombinantna DNK i trebao bi imati sposobnost repliciranja i ekspresije unutar organizma domaćina. Umjetni kromosom kvasca (YAC) i bakterijski umjetni kromosom (BAC) dvije su vrste vektora uključenih u kloniranje. Ključna razlika između YAC i BAC je u tome što je YAC umjetno konstruiran vektorski sustav koji koristi određenu regiju kromosoma kvasca za umetanje velikih segmenata genetskog materijala u stanice kvasca, dok je BAC umjetno konstruiran vektorski sustav koji koristi specifičnu regiju E.coli kromosom za umetanje velikih segmenata DNK u stanice E. coli.
Što su YAC vektori?
YAC (Umjetni kromosom kvasca) je umjetno izgrađen kromosom koji ima sposobnost nositi veliki segment strane DNK i replicirati se unutar stanica kvasca. Ima centromeru, telomere kao i autonomno replicirajuće sekvence koje su ključne za replikaciju i stabilnost. YAC bi također trebao nositi selektivni marker ili markere i restrikcijska mjesta kako bi bio učinkovit vektor za kloniranje. Velika sekvenca u rasponu od 1000 kb do 2000 kb može se umetnuti u YAC i prenijeti u kvasac. Učinkovitost transformacije YAC-a je vrlo niska.
Slika 01: YAC vektor
Što su BAC vektori?
Bakterijski umjetni kromosom (BAC) je umjetno konstruiran kromosom za molekularno kloniranje. Ima specifične regije E. coli F plazmida i kružnog je oblika i super zamotan. BAC je razvijen za kloniranje fragmenata DNK u bakterije, posebno u E. coli. Može nositi fragmente DNK veličine do 300 kb. U usporedbi s YAC, BAC umetci za kloniranje su manjih veličina. BAC su razvijeni 1992. godine i još uvijek su popularni zbog svoje stabilnosti i jednostavne konstrukcije. BAC su također korisni u razvoju cjepiva.
Slika 02: BAC vektor u molekularnom kloniranju
Koja je razlika između YAC i BAC vektora?
YAC vs BAC Vektori |
|
| YAC je genetski modificiran kromosom uz korištenje DNA kvasca u svrhu kloniranja. | BAC je genetski modificirana DNK molekula koja koristi DNK E. coli u svrhu kloniranja. |
| Spol | |
| YACs su dizajnirani za kloniranje velikih fragmenata genomske DNA u kvasac. | BAC su razvijeni za kloniranje velikih genomskih fragmenata u Escherichiu coli. |
| Umetni duljinu | |
| YAC mogu sadržavati genomske umetke veličine megabaze. (1000 kb – 2000 kb). | BAC-ovi mogu nositi umetke od 200–300 kb ili manje. |
| Građevina | |
| YAC DNA je teško pročistiti netaknutu i zahtijeva visoku koncentraciju za generiranje YAC vektorskog sustava. | BAC se lako pročišćava netaknut i može se lako konstruirati. |
| Kimerizam | |
| YAC su često himerični. | BAC-ovi su rijetko himerni. |
| Stabilnost | |
| YAC je nestabilan. | BAC je stabilan. |
| Izmjene | |
| Rekombinacija kvasca vrlo je izvediva i uvijek ostaje aktivna. Stoga može generirati brisanja i druga preuređivanja u YAC-u. | E. coli je spriječena rekombinacija i uključuje se kada je potrebno. Stoga smanjuje neželjene preraspodjele u BAC-ovima. |
| Održavanje | |
| Manipulacija rekombinantnim YAC obično zahtijeva prijenos YAC u E. coli za naknadnu manipulaciju. Stoga je to naporan proces. | BAC modifikacija događa se izravno u E. coli. Dakle, nema potrebe za prijenosom DNK. Dakle, proces nije naporan. |
Sažetak – YAC vs BAC vektori
YAC je postao bitan istraživački alat u procesima kloniranja zbog svoje sposobnosti kloniranja velikih fragmenata DNK u organizam domaćina. Međutim, YAC imaju nekoliko nedostataka kao vektori kao što su poteškoće u konstrukciji, kimerizam, nestabilnost itd. Stoga su znanstvenici razvili BAC vektore kako bi prevladali te probleme. BAC je konstruiran korištenjem specifičnih regija kromosoma E. coli. To je stabilan vektor i lako se može konstruirati. Međutim, duljina DNK koju BAC može obraditi je do 20 puta manja od YAC-a. Ovo je razlika između YAC i BAC vektorskih sustava. Danas se u laboratorijima više preferira BAC nego YAC.
