Ključna razlika – minisatelit naspram mikrosatelit
Ponavljajuća DNK su nukleotidne sekvence koje se uvijek iznova ponavljaju u genomu organizama. Ponavljajuća DNK čini značajan dio genomske DNK, a postoje tri glavne vrste nazvane tandem ponavljanja, terminalna ponavljanja i isprekidana ponavljanja. Tandemska ponavljanja su sekvence koje se često ponavljaju i koje leže jedna uz drugu bez prekida. Postoje tri glavne vrste tandemskih ponavljanja u genomu kralježnjaka. To su satelitska DNK, mikrosatelitna DNK i minisatelitna DNK. Minisatelit je dio DNK koji se često ponavlja i sastoji se od niza ponavljajućeg niza koji se sastoji od 10 do 100 parova baza. Mikrosatelit je dio ponavljajuće DNA koji se sastoji od kratkih ponavljajućih sekvenci sastavljenih od 1 do 9 parova baza. Stoga je ključna razlika između minisatelita i mikrosatelita veličina ili duljina sekvence koja se ponavlja.
Što je minisatelit?
Minisatelitna DNK je dio DNK koji se sastoji od niza kratkih ponavljajućih sekvenci DNK dužine od 10 do 60 parova baza. Minisateliti se također nazivaju tandem ponavljanja s promjenjivim brojem (VNTR). Minisateliti se često brkaju s mikrosatelitima. Međutim, znanstvenici sada razlikuju minisatelite i mikrosatelite na temelju veličine niza koji se ponavlja.
Minisateliti se mogu vidjeti na više od 1000 mjesta u ljudskom genomu. Ove kratke sekvence bogate su G i C. Broj ponavljanja u određenom minisatelitu uvelike varira među pojedincima.
Prvi ljudski minisatelit identificirali su A. R. Wyman i R. White 1980. godine. Kasnije je Alec Jeffreys otkrio ekstremni polimorfizam broja kopija minisatelita među organizmima. Ta su otkrića učinila minisatelite idealnim markerima za DNK otiske prstiju, analizu veza i populacijske studije. Minisateliti također doprinose regulaciji ekspresije gena, transkripcije, alternativnog spajanja, itd.
Što je mikrosatelit?
Mikrosatelit je dio DNK koji ima jednostavne sekvencije koje se ponavljaju od 1 do 10 parova baza. Mikrosateliti se također nazivaju ponavljanja kratke sekvence (SSR) ili jednostavna tandem ponavljanja (STR). Postoje dvije vrste mikrosatelita koji se nazivaju jednostavni mikrosateliti i kompozitni mikrosateliti. Jednostavni mikrosateliti sastoje se samo od jedne vrste ponavljajućih sekvenci. Kompozitni mikrosateliti sastoje se od više od jedne vrste ponavljanja. Mikrosateliti najčešće posjeduju poli A/T regije. Mikrosateliti su kodominantni i obilni su u eukariotskim genomima.
Slično minisatelitima, mikrosateliti također pokazuju polimorfizam među pojedincima. Broj ponavljanja za dati mikrosatelit razlikuje se među pojedincima. Stoga se mikrosateliti također mogu koristiti kao genetski markeri u DNK otiscima. Polimorfizam mikrosatelita može se lako identificirati PCR-om i elektroforezom u gelu. Bočno područje mikrosatelita visoko je očuvano kod srodnih vrsta.
Koje su sličnosti između minisatelita i mikrosatelita?
- Minisateliti i mikrosateliti su nekodirajuće sekvence DNK.
- Oboje su tandem ponavljanja.
- Obje se sastoje od sekvenci koje se često ponavljaju.
- Obje se mogu koristiti kao snažni genetski markeri za DNK otiske.
Koja je razlika između minisatelita i mikrosatelita?
Minisatelit protiv mikrosatelit |
|
| Minisateliti su tandem ponavljanja s duljinom ponavljanja monomera od 10 do 100 parova baza. | Mikrosateliti su kratka tandemska ponavljanja koja se sastoje od 1 do 9 monomernih parova baza koje se ponavljaju. |
| Veličina niza koji se ponavlja | |
| Minisatelit ima ponavljajuće nizove od 10 do 100 parova baza. | Mikrosatelit ima kratke sekvence od 1 do 9 parova baza. |
| Uobičajene baze | |
| Minisateliti su bogati G i C bazama. | Mikrosateliti su bogati A i T bazama. |
| Ostala imena | |
| Minisateliti su također poznati kao tandem ponavljanja promjenjivog broja (VNTR). | Mikrosateliti su također poznati kao ponavljanja kratke sekvence (SSR) ili jednostavna tandem ponavljanja (STR). |
Sažetak – Minisatelit naspram mikrosatelit
Minisatelit i mikrosatelit dvije su vrste tandemskih ponavljanja. Razlikuju se na temelju broja baza u nizu koji se ponavlja ili veličine niza. Minisatelit ima ponavljajući slijed duljine od 10 do 100 parova baza dok mikrosatelit ima ponavljajući niz duljine parova baza od 1 do 9. Ovo je glavna razlika između minisatelita i mikrosatelita. Broj kopija ponavljajuće sekvence u minisatelitima i mikrosatelitima jako varira među pojedincima. I minisateliti i mikrosateliti moćni su DNK markeri za analizu genetskih varijacija unutar i između populacija vrsta.
Preuzmi PDF verziju Minisatellite vs Microsatellite
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti ga za izvanmrežne svrhe prema bilješkama o citatima. PDF verziju preuzmite ovdje. Razlika između minisatelita i mikrosatelita.
