Ključna razlika između Cosmida i Phagemida je u vrsti sekvenci koje sadrži. Kozmid sadrži cos mjesto i plazmid. Stoga je to hibridni vektor dok je Phagemid plazmid koji sadrži F1 ishodište replikacije F1 faga.
Kozmidi i fagemidi koriste se u svrhe kloniranja, posebno za kloniranje većih fragmenata DNK. Oni se naširoko koriste, posebno u kloniranju gena odgovornih za proizvodnju različitih proteina. Kozmidi i fagemidi se ili repliciraju sami kao plazmidi ili se pakiraju u virusne čestice i potom repliciraju.
Što je kozmid?
A Kozmid, koji se naziva hibridni plazmid, sastoji se od cos mjesta ekstrahiranih iz čestica Lambda faga i plazmida. Ova cos mjesta su dugi fragmenti DNK sa 200 parova baza. Stoga imaju kohezivne ili ljepljive krajeve koji omogućuju plazmidu da stane u virusnu DNA. Stoga su cos mjesta vitalna za pakiranje DNK.
Postoje tri stranice cos;
- cosN mjesto – uključeno u presjecanje lanca DNK djelovanjem terminaze
- cosB stranica – uključena u držanje terminase.
- cosQ mjesto – uključeno u sprječavanje degradacije DNK pomoću DNK-aza.
Slika 01: Kozmid
Također, kozmidi mogu replicirati jednolančanu DNA ili dvolančanu DNA koristeći odgovarajuće ishodište replikacije. Kozmidi obično sadrže gene otpornosti na antibiotike kao markere za odabir transformanata. Dakle, upotreba kozmida kao vektora može olakšati kloniranje, a probava vektora restrikcijskim enzimom može zatim izdvojiti te fragmente.
Što je Phagemid (Phasmid)?
Phagemid, također nazvan Phasmid, također je vrsta hibridnog vektora. Phagemid sadrži posebno ishodište replikacije koje se naziva f1 ishodište replikacije. Izvor f1 replikacije izdvaja se iz f1 faga.
Phagemid može replicirati i jednolančanu i dvolančanu DNA. Replikacija se može odvijati ili kao plazmid dok prolazi neovisnu replikaciju ili se može zapakirati u čestice faga i na kraju inficirati bakterijski domaćin E coli. Kod inficiranja stanica E coli fag f1 zahtijeva prisutnost pilusa. Stoga su spolni pili važni tijekom in vitro pakiranja Phagemida.
Koje su sličnosti između Cosmida i Phagemida?
- I Cosmid i Phagemid su vektori za kloniranje koji se koriste u tehnologiji rekombinantne DNK.
- Cosmid i Phagemid mogu replicirati jednolančanu i dvolančanu DNA.
- Oboje se može podvrgnuti neovisnoj replikaciji slično plazmidima.
- Cosmid i Phagemid mogu proći in vitro pakiranje i zaraziti bakterijske stanice.
- I Cosmid i Phagemid zahtijevaju odgovarajuće podrijetlo replikacije za kloniranje.
Koja je razlika između Cosmida i Phagemida?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Kozmid je hibridni vektor koji sadrži cos mjesto i plazmid. | Fagemid je plazmid koji sadrži F1 ishodište replikacije F1 faga. |
| Prisutnost Cos stranica | |
| Zato što su mjesta prisutna u kozmidu i neophodna su za in vitro pakiranje. | Zato što web-mjesta nisu prisutna u phagemidu. |
| Prisutnost F1 podrijetla replikacije | |
| U kozmidu, fi ishodište replikacije može ali ne mora biti prisutno. | F1 ishodište replikacije prisutno je u fagemidu. |
| Prisutnost gena otpornih na antibiotike | |
| Geni otporni na antibiotike prisutni su u kozmidima za identifikaciju transformanata od netransformanata. | Geni otporni na antibiotike nedostaju u fagemidima. |
| Zahtjevi za in vitro pakiranje | |
| Zahtijeva cos stranicu. | Potreban je sex pilus. |
Sažetak – Cosmid vs Phagemid
Cosmid i Phagemid su vektori za kloniranje koji se koriste u tehnologiji rekombinantne DNA. Kozmidi su hibridni vektori koji sadrže posebne ljepljive krajeve poznate kao cos mjesta. In-vitro pakiranja zahtijevaju ova cos mjesta. Dok su fagemidi plazmidi koji sadrže f1 ishodište replikacije ekstrahirano iz f1 faga. I kozmid i fagemid mogu proći neovisnu replikaciju ili in vitro pakiranje u bakterijske stanice. Ovo su važne razlike između kozmida i fagemida.
