Ključna razlika između konzervirane i konsenzusne sekvence je u tome što se konzervirana sekvenca odnosi na slične sekvence nukleinskih kiselina ili aminokiselina koje se pojavljuju u različitim ili istim vrstama tijekom generacija, dok je konsenzusna sekvenca uobičajeno pronađena sekvenca nukleotida ili sekvenca aminokiselina u visoko konzerviranoj regiji DNA ili RNA ili proteina.
Organizmi dijele slične kao i različite karakteristike. Kada se proučavaju odnosi između organizama i njihova klasifikacija, vrlo je važan genom ili genetski sastav organizama. Postoje neke sekvence nukleotida ili aminokiselina koje su zajedničke među različitim organizmima. Konzervirana sekvenca je sekvenca nukleinske kiseline ili aminokiseline koja je dosljedna među vrstama. Stoga su oni filogenetski važni pri stvaranju filogenetskih stabala. U konzerviranim sekvencama postoje specifične nukleotidne sekvence koje se češće nalaze. Poznate su kao konsenzusne sekvence.
Što je očuvana sekvenca?
Očuvana sekvenca je sekvenca nukleinske kiseline ili sekvenca aminokiseline koja je slična među vrstama. Stoga je dosljedan u svim vrstama tijekom evolucije. Općenito, ove se sekvence održavaju prirodnom selekcijom. Oni ostaju nepromijenjeni daleko unatrag u filogenetskom stablu. Stoga su očuvane sekvence važne u konstruiranju filogenetskih stabala. Vjeruje se da visoko očuvane sekvence često imaju važnu funkcionalnu vrijednost. Također su korisni u identificiranju genetskih bolesti. Međutim, konzervirane sekvence mogu biti kodirajuće ili nekodirajuće sekvence nukleinske kiseline. Osim toga, očuvane sekvence pokazuju sporije stope mutacije. Stoga pokazuju vrlo minimalne promjene u svom sastavu; ponekad ne pokazuju promjene kroz sve generacije.
Slika 01: Konzervirana sekvenca
RNA komponente ribosoma prisutne su u svim domenama života, homeobox sekvence u eukariotima i tmRNA u bakterijama nekoliko su primjera visoko očuvanih sekvenci. Identifikacija očuvanih sekvenci je jednostavna kada se koriste bioinformatički pristupi, posebno alat za usklađivanje sekvenci. Štoviše, višestruko poravnanje sekvenci olakšava vizualizaciju sačuvanih sekvenci.
Što je slijed konsenzusa?
Konsenzusna sekvenca je sekvenca koja se obično nalazi u određenoj konzerviranoj regiji DNK ili RNK. To je vrlo specifičan nukleotidni niz. Kao primjer, postoji konsenzusna sekvenca na -10 kao TATAAT (Pribnow okvir) u promotorima E. coli, koji su visoko očuvane sekvence. Slično, postoji još jedan konsenzusni niz: TTGACA u promotorima E. coli također na -35. Konsenzusni nizovi također su poznati kao "kutije".
Slika 02: Slijed konsenzusa
Osim DNA i RNA, proteini također imaju konsenzusne sekvence aminokiselina. Mjesta vezanja proteina često su predstavljena konsenzusnim sekvencama. Restrikcijski enzimi također imaju konsenzusne sekvence. Štoviše, mjesta spajanja također su konsenzusne sekvence. Slično konzerviranim sekvencama, konsenzusne sekvence mogu se izračunati i vizualizirati pomoću bioinformatičkih alata.
Koje su sličnosti između konzervirane i konsenzusne sekvence?
- Konzervirane i konsenzusne sekvence su sekvence nukleinskih kiselina ili aminokiselina koje su zajedničke svim vrstama.
- I očuvane i konsenzusne sekvence mogu se vizualizirati pomoću bioinformatičkih alata.
- Oni se široko koriste u molekularnoj biologiji.
Koja je razlika između konzervirane i konsenzusne sekvence?
Konzervirana sekvenca je sekvenca nukleinske kiseline ili aminokiseline koja je konzistentna među vrstama, dok su konsenzusne sekvence vrlo specifične i često se nalaze baze ili aminokiseline u određenoj očuvanoj regiji. Dakle, ovo je ključna razlika između očuvane i konsenzusne sekvence. Štoviše, još jedna razlika između konzervirane i konsenzusne sekvence je ta što su konzervirane sekvence filogenetski važne dok su konsenzusne sekvence često mjesta vezanja proteina, mjesta spajanja, mjesta rezanja restrikcijskih enzima, itd.
Sažetak – Konzervirani naspram konsenzusnog slijeda
Očuvane sekvence su sekvence nukleinskih kiselina ili proteina koje su slične među živim vrstama. Promotor, mjesto vezivanja ribosoma, ishodište replikacije i aminokiselinska sekvenca histonskog proteina nekoliko je primjera konzerviranih sekvenci. Nasuprot tome, konsenzusne sekvence su specifične baze ili aminokiseline koje se češće nalaze u određenoj konzerviranoj sekvenci. -10 kutija, -35 kutija promotora E. coli, mjesta vezanja proteina, mjesta spajanja i mjesta za prepoznavanje restrikcijskih enzima nekoliko su primjera konsenzusnih sekvenci. Dakle, ovo je sažetak razlike između konzervirane i konsenzusne sekvence.
