Ključna razlika između CDS i cDNA je u tome što je CDS ili kodirajuća sekvenca dio transkripta koji se zapravo prevodi u protein dok je cDNA sekvenca DNA sekvenca izvedena iz mRNA obrnutom transkripcijom.
Gen je nukleotidna sekvenca koja kodira protein. Sastoji se od različitih regija kao što su promotorska regija, mjesto inicijacije transkripcije, egzoni, početni kodon, introni i stop kodon. Stoga gen ima i kodirajuće i nekodirajuće sekvence. Kodirajuće sekvence ili CDS odnose se na egzone i dva kodona, koji su početni kodon i stop kodon. To je sekvenca koja se zapravo prevodi u protein. Nasuprot tome, cDNA je DNA sekvenca izvedena iz mRNA obrnutom transkripcijom.
Što je CDS?
CDS ili kodirajuća sekvenca je dio gena koji se zapravo prevodi u protein. Sastoji se od egzona i dva kodona kao što su AUG kodon i stop kodon. Za razliku od cDNA, CDS ne sadrži dvije neprevedene regije: 5’ UTR i 3” UTR. Štoviše, introni nisu uključeni u CDS.
Slika 01: Redoslijed kodiranja
U usporedbi s cijelim genomom i pojedincem, kodirajuće sekvence su mali dio. Kodirajuća sekvenca sastoji se od potrebne sekvence nukleotida za izradu sekvence aminokiselina proteina.
Što je cDNA?
cDNA ili komplementarna DNA je sekvenca DNA nastala iz sekvence mRNA. Sintetizira se procesom koji se naziva reverzna transkripcija. Enzim reverzna transkriptaza katalizira sintezu cDNA, a mRNA sekvenca djeluje kao predložak za sintezu cDNA. U osnovi, mRNA eukariotskih stanica može se ekstrahirati i pročistiti kako bi se napravila cDNA. Nakon konstruiranja cDNA iz mRNA, oni se zatim mogu klonirati u bakterijsku stanicu kako bi se napravile cDNA biblioteke. cDNA biblioteke važne su za analizu kodirajućih regija, funkcija gena i ekspresije gena, itd.
Slika 02: cDNA
Za razliku od kodirajuće sekvence, cDNA sadrži dva UTR-a, a to su 3’ UTR i 5’ UTR. Slično kodirajućoj sekvenci, cDNA ne sadrži introne.
Koje su sličnosti između CDS-a i cDNA?
- CDS i cDNA su nukleinske kiseline.
- Napravljeni su od deoksiribonukleotida.
- I CDS i CDNA ne sadrže introne, koji su nekodirajuće regije.
- Oboje sadrže genetski kod ili informacije za proizvodnju proteina.
Koja je razlika između CDS i cDNA?
CDS ili kodirajuća sekvenca je dio gena koji se zapravo prevodi u protein. S druge strane, cDNA sekvenca je DNA sekvenca izvedena iz mRNA obrnutom transkripcijom. Dakle, ovo je ključna razlika između CDS i cDNA. Osim toga, CDS se sastoji od egzona i dva kodona, koji su startni i stop kodon. Nasuprot tome, cDNA se sastoji od kompletne mRNA sekvence i dva UTR-a.
Štoviše, sinteza cDNA izvodi se umjetno iz mRNA obrnutom transkripcijom dok se CDS nalaze u genomskoj DNA.
Infografika u nastavku prikazuje više usporedbi kako bi se uočila razlika između CDS-a i cDNA.
Sažetak – CDS vs cDNA
Kodirajuća sekvenca i cDNA dvije su vrste nukleotidnih sekvenci. Kodirajuća sekvenca leži unutar gena dok se cDNA sintetizira umjetno. Kodirajuća sekvenca ima egzone i dva kodona dok cDNA ima mRNA sekvencu i dva UTR-a. I CDS i cDNA imaju samo nukleotidne sekvence koje se zapravo prevode u protein. Ne sadrže introne. Za razliku od CDS-a, proces sinteze cDNA zahtijeva enzim reverzne transkriptaze. Također, cDNA se može pretvoriti u cDNA biblioteke. Dakle, ovo sažima razliku između CDS i cDNA.
