Ključna razlika između CRISPR-a i CRISPR-a Cas9 je u tome što je CRISPR (skupljeno pravilno razmaknuto kratko palindromsko ponavljanje) prirodni obrambeni mehanizam prokariotske imunosti, dok je CRISPR cas9 RNA-vođena Cas9 nukleaza koja je dio CRISPR adaptivnog imunološki sustav.
CRISPR je antivirusni obrambeni imunološki sustav koji se nalazi u bakterijama i arhejama. To je obitelj DNA sekvenci pronađenih u bakterijskom genomu. Sastoji se od razmaknih sekvenci koje su izvedene iz fragmenata DNA bakteriofaga koji su ih prethodno zarazili. U kasnijim virusnim infekcijama, bakterije koriste ove sekvence za uništavanje virusne DNK. CRISPR sekvence imaju kratka palindromska ponavljanja i razmaknice. Štoviše, CRISPR ponovljene razmaknice često imaju povezane gene koji kodiraju Cas proteine. Cas9 je RNA vođena endonukleaza. Zajedno s CRISPR sekvencama, protein Cas9 djeluje kao adaptivni imunološki sustav u bakterijama protiv bakteriofaga.
Što je CRISPR?
CRISPR je kratica za Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. To je skup DNK sekvenci pronađenih u bakterijskom genomu. Djeluje kao prirodni obrambeni mehanizam kod bakterija, a prvi put je identificiran kod E. coli. U bakterijama djeluje kao adaptivna imunološka zaštita, osobito protiv bakteriofaga. Stoga je to mehanizam specifičan za niz.
Slika 01: CRISPR
CRISPR sustav sadrži nekoliko ponovljenih sekvenci DNK kratkih segmenta. Ova ponavljanja su palindromska, imaju isti osnovni niz kada se čita od 5’ do 3’, dok drugi daje isti niz kada se čita od 3’ do 5’. Štoviše, ponavljanja su identična. Nalaze se između kratkih "spacer" sekvenci DNA koje nisu identične. Ali ove razmaknice DNA sekvence slične su ili se podudaraju s DNK stranog bakteriofaga. Geni povezani s CRISPR-om poznati su kao geni povezani s CRISPR-om ili Cas geni. Cas geni kodiraju za Cas proteine koji su helikaze ili nukleaze. Helikaze odmotavaju DNK dok nukleaze režu DNK. Sveukupno, kada se uzme u obzir CRISPR, to je imunološki sustav bakterija koji djeluje protiv bakteriofaga (bakterije koje inficiraju viruse).
Što je CRISPR Cas9?
Cas9 ili CRISPR povezani protein 9 je bakterijska RNA-vođena endonukleaza. Dakle, to je enzim koji prepoznaje i reže ciljnu DNK (osobito DNK bakteriofaga) komplementarnu vodećoj RNK. Izvodi cijepanje specifično za nit. Protein Cas9 kodiran je genom povezanim s CRISPR. CRISPR cas9 je RNA-vođen sustav nukleaze CRISPR-Cas9 koji se može koristiti kao RNA-programabilna platforma za ciljanje i uređivanje DNK za uređivanje genoma, perturbaciju transkripcije, epigenetsku modulaciju i oslikavanje genoma. Ovaj CRISPR cas9 sustav vrlo je popularan u trenutnim sustavima za uređivanje genoma.
Slika 02: CRISPR Cas9
Trenutno se sustav CRISPR/Cas9 koristi za promjenu ili modificiranje genoma sisavaca potiskivanjem ili aktivacijom transkripcije. Stanice sisavaca mogu odgovoriti na lomove DNK posredovane CRISPR/Cas9 usvajanjem mehanizma popravka. To se može izvesti metodom nehomolognog spajanja krajeva (NHEJ) ili homologno usmjerenim popravkom (HDR). Oba ova mehanizma popravka odvijaju se uvođenjem dvolančanih prekida. To rezultira uređivanjem gena sisavaca. NHEJ može dovesti do ablacije genskih mutacija i može se koristiti za stvaranje učinaka gubitka funkcije. HDR se može koristiti za uvođenje specifičnih točkastih mutacija ili uvođenje segmenata DNA različite duljine. Trenutno se CRISPR/Cas sustav koristi u područjima terapeutske, biomedicinske, poljoprivredne i istraživačke primjene.
Koje su sličnosti između CRISPR-a i CRISPR Cas9?
- Cas9 je dio CRISPR Cas sustava.
- Crisper cas9 sustav je imunološki sustav koji se prirodno nalazi u bakterijama.
Koja je razlika između CRISPR-a i CRISPR Cas9?
CRISPR je skup DNK sekvenci pronađenih u bakterijskom genomu koji djeluje kao prirodni obrambeni sustav protiv bakteriofaga. Sastoji se od pravilno međusobno raspoređenih kratkih palindromskih ponavljanja, razmaknica i povezanih gena. Nasuprot tome, cas9 je protein 9 povezan s CRISPR-om, koji je RNA vođen enzim endonukleaza. Prepoznaje i cijepa DNA dvostruke niti virusa. Zapravo, to je dio obrambenog sustava CRISPR. Dakle, ovo je ključna razlika između CRISPR-a i CRISPR-a cas9.
Sažetak – CRISPR protiv CRISPR Cas9
CRISPR Cas sustav je mikrobni obrambeni sustav. CRISPR je skupina DNA sekvenci koja se sastoji od palindromskih kratkih ponavljanja, sekvenci razmaka i povezanih gena. Cas9 je jedan Cas protein koji je RNA vođena endonukleaza. CRISPR i Cas9 protein čine imunološki sustav koji djeluje protiv infekcija bakteriofaga u bakterijama. Protein Cas9 može cijepati stranu virusnu DNA i poremetiti ih. CrRNA vodi cas9 da prepozna virusnu DNK. Stoga je CRISPR cas9 sustav prirodni imunološki sustav koji se nalazi u bakterijama protiv virusa. Dakle, ovo je sažetak razlike između CRISPR-a i CRISPR-a cas9.
