Ključna razlika između TATA i CAAT box-a je u tome što je TATA box konzervirana nukleotidna regija koja ima konsenzusnu sekvencu TATAWAW dok je CAAT box konzervirana nukleotidna regija s konsenzusnom sekvencom GGCCAATCT.
TATA box i CAAT box su dvije regije nukleotida koje utječu na transkripciju eukariotskih gena. Oni su nekodirajuće DNA sekvence koje se nalaze uzvodno do mjesta inicijacije transkripcije. Zapravo, nalaze se u regulacijskoj regiji, koja je poznata kao promotor. I TATA box i CAAT box odgovorni su za učinkovitost transkripcije. To su konsenzusni nizovi koji se nisu mijenjali tijekom evolucijskog procesa.
Što je TATA Box?
TATA kutija ili Goldberg-Hognessova kutija je konsenzusna sekvenca pronađena u promotorskoj regiji eukariotskih gena. TATA box je temeljni element promotora. Nalazi se 25 parova baza uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije. Sačuvano je tijekom evolucijskog procesa. Konsenzusna sekvenca TATA kutije je TATAWAW, gdje je W ili A ili T. To je nekodirajuća sekvenca DNK. Međutim, TATA box je važan za transkripciju gena. To je mjesto vezivanja TATA-vezujućeg proteina (TBP) i drugih faktora transkripcije. Nakon što se vežu u TATA okvir, regrutiranje RNA polimeraze II i pravilna regulacija transkripcije odvija se u eukariotskim genima.
Slika 01: TATA Box
Budući da je TATA box uključen u regulaciju transkripcije, mutacije TATA box-a mogu rezultirati fenotipskim promjenama koje dovode do bolesti kao što su rak želuca, spinocerebelarna ataksija, Huntingtonova bolest, sljepoća, β-talasemija, imunosupresija, Gilbertov sindrom, i HIV-1, itd.
Što je CAAT Box?
CAAT okvir je regija nukleotida s konsenzusnom sekvencom GGCCAATCT. Slično TATA kutiji, CAAT kutija se također nalazi u promotorskoj regiji gena. Stoga se nalazi oko 75-80 parova baza uzvodno od mjesta transkripcije.
Slika 02: CAAT Box
Specifični faktori transkripcije vežu se za CAAT okvir. Ovo vezanje stabilizira preinicijacijski kompleks radi lakšeg vezanja enzima RNA polimeraze. Isto tako, CAAT okvir radi kao regulatorni niz. Mutacije u CAAT box regiji jako utječu na odgovor promotora i regulaciju transkripcije.
Koje su sličnosti između TATA i CAAT Boxa?
- TATA i CAAT su dvije regije nukleotida koje se nalaze u regulacijskoj sekvenci eukariotskih gena.
- Nalaze se uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije.
- Oboje su konsenzusne sekvence DNK.
- Oni su bitni za regulaciju transkripcije, stoga su regulatorne sekvence.
Koja je razlika između TATA i CAAT Box-a?
TATA kutija je očuvana regija nukleotida koja se nalazi oko 25-30 parova baza uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije. S druge strane, CAAT kutija je očuvana regija nukleotida koja se nalazi oko 75-80 parova baza uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije. Dakle, ovo je ključna razlika između TATA i CAAT kutije. Osim toga, TATA okvir ima konsenzusnu sekvencu TATAWAW dok je GGCCAATCT konsenzus sekvencu CAAT kutije.
Štoviše, još jedna značajna razlika između TATA i CAAT box-a je u tome što TATA box pruža vezno mjesto za TBP i transkripcijske faktore i sudjeluje u regulaciji transkripcije, dok CAAT box signalizira vezno mjesto za RNA transkripcijski faktor.
U nastavku infografika sažima razlike između TATA i CAAT kutije.
Sažetak – TATA vs CAAT Box
TATA box i CAAT box dva su dijela očuvane regije promotora eukariotskog gena. Nalaze se uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije. Oba utječu na transkripciju gena osiguravajući mjesta za vezanje TATA-vezujućih proteina i faktora inicijacije transkripcije. TATA kutija se nalazi 25-35 parova baza uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije, dok je CAAT kutija smještena 75-80 parova baza uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije. Konsenzusni niz TATA okvira je TATAWAW dok je konsenzusni niz CAAT okvira GGCCAATCT. Dakle, ovo je sažetak razlika između TATA i CAAT kutije.
