Ključna razlika između ORF-a i egzona je u tome što je ORF ili otvoreni okvir za čitanje dio sekvence DNK koji počinje mjestom inicijacije translacije (start kodon) i završava mjestom završetka translacije (kodon stop), dok je egzon nukleotidna sekvenca unutar gena koja kodira aminokiseline.
Otvoreni okvir za čitanje je dio okvira za čitanje. Ribosomi čitaju okvire za čitanje kako bi proizveli proteine. ORF je kontinuirani niz kodona koji daje potpuno funkcionalan protein. Počinje start kodonom i završava stop kodonom. Unutar ORF-a ne postoji zaustavni kodon koji prekida slijed kodiranja. Translacija počinje na početnom kodonu i završava na stop kodonu. Exon je nukleotidna sekvenca gena. On kodira aminokiseline proteina. Stoga su egzoni kodirajuća područja gena.
Što je ORF?
Otvoreni okvir čitanja ili ORF kontinuirani je niz nukleotidnog niza koji počinje početnim kodonom i završava krajnjim kodonom. Jednostavnim riječima, ORF se odnosi na regiju nukleotidnog niza koja se nalazi između početnog i završnog kodona. Između, ne postoji stop kodon koji prekida ORF. Nukleotidni slijed između početnog i završnog kodona kodira aminokiseline. Općenito, početni kodon je ATG dok su stop kodoni TAG, TAA i TGA. ORF daje funkcionalni protein kada se transkribira i prevodi. Stoga ORF uključuje početni kodon, nekoliko kodona u srednjoj regiji i stop kodon. Zanimljivo, ORF ima duljinu koja se može podijeliti s tri.
Slika 01: ORF
Kod prokariota, budući da nema introna, ORF je kodirajuća regija gena koja se transkribira izravno u mRNA. U eukariota, budući da postoje introni, ORF je sekvenca kodona koja nastaje nakon obrade ili spajanja RNA. ORF je dokaz koji pomaže u predviđanju gena budući da su dugi ORF-ovi vjerojatno dio gena.
Što je Exon?
Egzoni su kodirajuće sekvence nukleotida gena koji se prevode u proteine. Nalaze se s obje strane introna. Nakon uklanjanja nekodirajućih sekvenci iz pre mRNA, zrela molekula mRNA sastoji se samo od sekvenci egzona. Tada se nukleotidna sekvenca konačne molekule RNA (zrela mRNA) pretvara u aminokiselinsku sekvencu specifičnog proteina.
Slika 02: Egzoni
Gotovo svi geni imaju početnu sekvencu nukleotida koja ih razlikuje kao gen od glavnog DNA ili RNA lanca, što je poznato kao otvoreni okvir za čitanje (ORF). U nekim genima dva ORF-a označavaju cijeli gen i egzone nalaze se unutar kodirajuće sekvence. Iako zvuči da su egzoni uvijek eksprimirani u genima, postoje slučajevi u kojima sekvence introna interveniraju s egzonom i uzrokuju mutacije, a taj je proces poznat kao egzonizacija.
Koje su sličnosti između ORF-a i Exona?
- I ORF i egzon su nukleotidne sekvence.
- Dugi ORF i egzoni su dijelovi gena.
- Oboje imaju sekvence kodiranja.
Koja je razlika između ORF-a i Exona?
ORF i egzon su nukleotidne sekvence. ORF se odnosi na bilo koju dionicu DNA sekvence koja se nalazi između početnog kodona i stop kodona. Nasuprot tome, egzon je kodirajući nukleotidni slijed gena koji kodira aminokiseline. Dakle, ovo je ključna razlika između ORF-a i egzona. Eksoni su dijelovi gena dok je dugi ORF vjerojatno dio gena. Štoviše, postoje introni na obje strane egzona dok ORF ne uključuje introne.
U nastavku infografika sažima razliku između ORF-a i egzona u tabličnom obliku.
Sažetak – ORF vs Exon
Otvoreni okvir za čitanje (ORF) je dio okvira za čitanje. To je kontinuirani niz DNA niza koji počinje početnim kodonom i završava stop kodonom. Exon je nukleotidna sekvenca gena. On kodira dio sekvence mRNA. Stoga su egzoni dijelovi sekvence gena koji se eksprimiraju u proteinu. Dakle, ovo sažima razliku između ORF-a i egzona.
