Ključna razlika između EcoRI i HindIII restrikcijskih enzima je u tome što je EcoRI restrikcijski enzim tipa II koji je izoliran iz E. coli, dok je HindIII restrikcijski enzim tipa II koji je izoliran iz Haemophilus influenza.
Restrikcijski enzim ili restrikcijska endonukleaza je enzim koji cijepa DNA u fragmente na specifičnim mjestima prepoznavanja (restrikcijskim mjestima) unutar molekule DNA. Ovi restrikcijski enzimi nalaze se u bakterijama i arhejama. Oni pružaju obrambeni mehanizam protiv invazije virusa. Restrikcijski enzimi općenito se klasificiraju u pet različitih tipova: tip I, tip II, tip III, IV i tip V. EcoRI i HindIII dva su restrikcijska enzima koja pripadaju skupini restrikcijskih enzima tipa II.
Što su EcoRI restrikcijski enzimi?
EcoRI je restrikcijski enzim tipa II koji je izoliran iz vrste E.coli. To je restrikcijski enzim koji cijepa dvostruke spirale DNA u fragmente na određenim mjestima. EcoRI je također dio sustava ograničenja-modifikacije. EcoRI je bio prvi enzim koji je izvorno izoliran iz soja RY13 vrste E. coli. Koristi se kao restrikcijski enzim u molekularnoj biologiji. EcoRI stvara ljepljive krajeve od 4 nukleotida s 5' krajevima AATT-a. EcoRI reže DNK na specifičnoj sekvenci prepoznavanja G↓AATTC. Ima palindromsku komplementarnu sekvencu CTTAA↓G. Štoviše, ovaj restrikcijski enzim pripada podklasi tipa II P (palindromska specifičnost). U svojoj primarnoj strukturi, EcoRI sadrži PD. D/EXK motiv unutar svog aktivnog mjesta, poput mnogih drugih restrikcijskih enzima.
Slika 01: EcoRI
EcoRI restrikcijski enzim je homodimer od 31 kDa. Sadrži jednu globularnu domenu α/β arhitekture. Svaka podjedinica sadrži petlju koja strši iz globularne domene i omotava se oko DNK kada je vezana. Ovaj enzim se može kokristalizirati slijedom koji inače reže. Nadalje, restrikcijski enzim EcoRI koristi se u širokom spektru molekularno-genetičkih tehnika, uključujući kloniranje, DNK probir i brisanje dijelova DNK in vitro uvjetima.
Što su HindIII restrikcijski enzimi?
HindIII je restrikcijski enzim tipa II koji je izoliran iz vrste Haemophilus influenza. Hidrolizom cijepa palindromsku sekvencu DNA AACCTT u prisutnosti kofaktora Mg2+. Cijepanje ove određene sekvence između AA’S (5’A↓ACCTT3’ i 3’TTCGA↓A5’) rezultira 5’ prevjesima na molekuli DNK koji se nazivaju ljepljivi krajevi. Ovaj enzim se nalazi u prokariotskim organizmima poput bakterija. Bakterije koriste ovaj enzim kao obrambeni mehanizam protiv virusa kao što su bakteriofagi.
Slika 02: HindIII
Strukturalno, HindIII je homodimer. Sadrži zajedničku strukturnu jezgru koja se sastoji od četiri β lista i jedne α spirale, poput drugih vrsta II restrikcijskih enzima. Molekularna masa ovog enzima je 34,9 kDa. Nadalje, HindIII je vrlo koristan u modernim molekularno-biološkim znanstvenim eksperimentima kao što su DNA sekvencioniranje i mapiranje.
Koje su sličnosti između EcoRI i HindIII restrikcijskih enzima?
- EcoRI i HindIII dva su restrikcijska enzima koja pripadaju skupini restrikcijskih enzima tipa II.
- EcoRI i HindIII pronađeni su ranih 1970-ih.
- EcoRI i HindIII sadrže motiv aminokiselinske sekvence PD.. D/EXK.
- Oba restrikcijska enzima izvode vrlo specifično cijepanje DNK.
- Ovi restrikcijski enzimi trebaju Mg2+ kao kofaktor za svoju specifičnu aktivnost.
- Proizvode ljepljive krajeve nakon rezanja DNK.
- One su vrlo korisne komponente u modernim molekularno biološkim istraživanjima.
Koja je razlika između EcoRI i HindIII restrikcijskih enzima?
EcoRI je restrikcijski enzim tipa II koji je izoliran iz vrste E.coli, dok je HindIII restrikcijski enzim tipa II koji je izoliran iz vrste Haemophilus influenza. Dakle, ovo je ključna razlika između EcoRI i HindIII. Nadalje, EcoRI reže DNK na specifičnoj sekvenci prepoznavanja G↓AATTC, dok HindIII reže DNK na specifičnoj sekvenci prepoznavanja A↓ACCTT.
Infografika u nastavku predstavlja razlike između EcoRI i HindIII u obliku tablice za usporedbu.
Sažetak – EcoRI vs HindIII restrikcijski enzimi
EcoRI i HindIII dva su restrikcijska enzima koji pripadaju podklasi tipa II p. Oni izvode vrlo specifično cijepanje DNK. EcoRI je restrikcijski enzim tipa II koji je izoliran iz vrste E.coli, dok je HindIII restrikcijski enzim tipa II koji je izoliran iz vrste Haemophilus influenza. Dakle, ovo sažima razliku između EcoRI i HindIII.
