Ključna razlika između replikativne transpozicije i izreži i zalijepi transpozicije je da se u replikativnoj transpoziciji transpozon kopira na novu lokaciju, dok se u izreži i zalijepi transpozon premješta na novu lokaciju.
Transposabilni elementi ili skačući geni su sekvence DNK koje mogu promijeniti svoj položaj unutar genoma. To se naziva transpozicija. Transpozicija ponekad može stvoriti ili poništiti mutacije i promijeniti genetski identitet stanice i veličinu genoma. Transpoziciju je otkrila Barbara McClintock 1983. Transpozicija se može odvijati kroz dvije tehnike kao što su dupliciranje i izrezivanje i lijepljenje.
Što je replikativna transpozicija?
Replikativna transpozicija je vrsta transpozicijskog mehanizma koji pomaže eksciziju transpozona s izvorne lokacije na drugu tehnikom repliciranja ili dupliciranja. Taj je mehanizam prvi pronašao James A. Shapiro 1979. U ovom mehanizmu, prijenosni element se duplicira tijekom reakcije transpozicije tako da je transponirajući entitet kopija izvornog elementa. Štoviše, u ovom mehanizmu, DNA sekvence donora i receptora tvore karakterističnu intermedijarnu "theta" konfiguraciju nazvanu Shapiro intermedijer (kointegrirati). Replikativna transpozicija je karakterističan retrotranspozon. Ovaj mehanizam se obično javlja u transpozonima klase I.
Slika 01: Replikativna transpozicija
Dobar primjer replikativne transpozicije može se uočiti u transpozonu E. coli TN3. Transpozon TN3 može se premjestiti s izvornog plazmida na drugi ciljani plazmid putem replicirane ili duplicirane tehnike. Cijeli ovaj događaj je posredovan s dva važna enzima koji se nazivaju transpozaza i resolvaza. Nadalje, replikativna transpozicija može se uočiti i u DNA transpozonima i u retropozonima. Najbolje proučeni prijenosni bakterijski virus je bakteriofag Mu.
Što je transpozicija Izreži i zalijepi?
Transpozicija izreži i zalijepi je vrsta mehanizma transpozicije koji pomaže eksciziju transpozona s izvorne lokacije na drugu putem tehnike izreži i zalijepi. Ovaj mehanizam je također poznat kao konzervativni model transpozicije. U ovoj nereplikativnoj transpoziciji odvija se izrezivanje i integracija transpozona s jedne genomske lokacije na drugu bez ostavljanja kopije.
Slika 02: Izreži i zalijepi transpoziciju
U ovom mehanizmu, enzim transpozaza prvo se veže na terminalna ponavljanja koja su obično prisutna na oba kraja transpozona, a zatim formira strukturu koja se naziva sinaptički kompleks (transpososom). Sinaptički kompleks cijepa transpozon s njegovog izvornog genomskog mjesta i integrira ga u novo ciljno mjesto. Nakon toga, transpozaze odlaze s oba kraja transpozona. Nakon što enzim transpozaza napusti transpozon, praznine popunjava enzim polimeraza domaćina. To omogućuje potpuno spajanje transpozona s novom genomskom lokacijom. Ovaj mehanizam se normalno javlja u transpozonima klase II. Nadalje, bakterijski transpozoni TN5 dobro su poznati primjer koji pokazuje konzervativni ili izreži i zalijepi mehanizam transpozicije.
Koje su sličnosti između replikativne transpozicije i izreži i zalijepi transpozicije?
- Replikativna transpozicija i transpozicija izreži i zalijepi dvije su vrste mehanizama transpozicije.
- U oba mehanizma, prijenosni elementi sele s jedne genomske lokacije na drugu novu genomsku lokaciju.
- Oba mehanizma mogu stvoriti ili poništiti mutacije i promijeniti genetski identitet stanice.
- Bakterijski transpozoni pokazuju oba mehanizma.
- Oni su izuzetno važni događaji za evoluciju.
Koja je razlika između replikativne transpozicije i izreži i zalijepi transpozicije?
Replikativna transpozicija je vrsta mehanizma transpozicije gdje se transpozon kopira na novu lokaciju, dok je transpozicija rezanja i lijepljenja vrsta mehanizma transpozicije gdje se transpozon premješta na novu lokaciju. Dakle, ovo je ključna razlika između replikativne transpozicije i cut and paste transpozicije. Nadalje, replikativna transpozicija normalno se događa u transpozonima klase I, dok se transpozicija cut and paste normalno događa u transpozonima klase II.
Infografika u nastavku predstavlja razlike između replikativne transpozicije i izreži i zalijepi transpoziciju u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – Replikativni prijenos u odnosu na prijenos Izreži i zalijepi
Replikativna transpozicija i transpozicija izreži i zalijepi dvije su vrste mehanizama transpozicije. Replikativna transpozicija je vrsta mehanizma transpozicije gdje se transpozon kopira na novu lokaciju, dok je transpozicija rezanja i lijepljenja vrsta mehanizma transpozicije gdje se transpozon premješta na novu lokaciju. Dakle, ovo sažima razliku između replikativne transpozicije i izreži i zalijepi transpozicije.
