Ključna razlika između ksilen cijanola i bromofenol plavog je u tome što u 1% agaroznom gelu ksilen cijanol migrira sporije, dok bromofenol plavo migrira brže.
Ksilen cijanol i bromofenol plavo važni su kao markeri boja koji se mogu koristiti u praćenju procesa elektroforeze u agaroznom gelu i elektroforeze u poliakrilamidnom gelu.
Što je Xylene Cyanol?
Ksilen cijanol je elektroforetski marker boja ili boja za praćenje. Koristan je u praćenju procesa elektroforeze u agaroznom gelu i elektroforeze u poliakrilamidnom gelu. Kada se ova tvar pomiješa s uzorkom, koncentracija te tvari obično postaje oko 0.005% do 0,03%. Neki sinonimi koje možemo koristiti za ksilen cijanol uključuju Acid Blue 147, ksilen cijanol, ksilen cijanol FF, ksilen cijanol FF, itd.
Kemijska formula ovog spoja je C25H27N2NaO 6S2 Molarna masa ksilen cijanola je 538,61 g/mol. Ova tvar može migrirati brzinom od oko 4 – 5 kilobaznih parova fragmenata DNA u 1% agaroznim gelovima. Međutim, to ovisi o međuspremniku koji koristimo. Tipično, ksilen cijanol na 6% poliakrilamidnom gelu može migrirati brzinom od oko 140 fragmenata DNK parova baza. S druge strane, može migrirati u elektroforezi na 20% denaturirajućem poliakrilamidnom gelu brzinom od 25 baza oligonukleotida.
Broj donora vodikove veze ksilen cijanola je 2m, a broj akceptora vodikove veze je 8. Broj rotirajućih veza ovog spoja može se dati kao 7. Složenost ksilen cijanola može se opisati kao 1120 stupnjeva. Ima definirani broj stereocentra veze od 1.
Što je Bromophenol Blue?
Bromfenol plavo je koristan pH indikator koji je koristan kao elektroforetski marker boje i boja. Ima kemijski naziv 3’, 3”, 5’, 5”-tetrabromfenolsulfonftalein, BPB. Kemijska formula ovog spoja je C19H10Br4O5 S. Molarna masa ovog spoja je 669,96 g/mol. Bez mirisa je, a gustoća mu se može dati kao 2,2 g/mL. Talište mu je 273 stupnja Celzijusa, a vrelište 279 stupnjeva Celzijusa. Možemo ga pripremiti polaganim dodavanjem viška broma u vruću otopinu fenolsulfonftaleina u ledenoj octenoj kiselini.
Bromfenol plavo je korisno kao acidobazni indikator u rasponu između pH 3,0 do 4,6. Može se promijeniti od žute na pH 3,0 do pH 4,6. Štoviše, to je reverzibilna reakcija. Strukturno, bromofenol plavo je slično fenolftaleinu.
Osim toga, možemo ga koristiti kao marker u boji za praćenje procesa elektroforeze u agaroznom gelu i elektroforeze u poliakrilamidnom gelu. Ova tvar može nositi negativan naboj pri umjerenom pH, gdje može migrirati u istom smjeru kao DNK ili protein u gelu. Brzina migracije može varirati ovisno o gustoći gela i sastavu pufera. Međutim, u tipičnom 1% agaroznom gelu u jednokratnom TAE puferu ili TBE puferu, ova tvar migrira istom brzinom kao fragment DNK od oko 300 parova baza.
Koja je razlika između ksilen cijanola i bromofenol plavog?
Ksilen cijanol i bromofenol plavo važni su markeri boja. Ključna razlika između ksilen cijanola i bromofenol plavog je u tome što u 1% agaroznom gelu ksilen cijanol migrira sporije, dok bromofenol plavo migrira brže.
U nastavku je sažetak razlika između ksilen cijanola i bromofenol plavog u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – ksilen cijanol naspram bromofenol plavog
Ksilen cijanol i bromofenol plavo važni su kao markeri boja koji se koriste u praćenju procesa elektroforeze u agaroznom gelu i elektroforeze u poliakrilamidnom gelu. Ključna razlika između ksilen cijanola i bromofenol plavog je ta što u 1% agaroznom gelu ksilen cijanol migrira sporije, dok bromofenol plavo migrira brže.
