Ključna razlika između insercijskih i zamjenskih vektora je u tome što insercijski vektor ima sposobnost umetanja umjerene duljine strane DNA, dok zamjenski vektor ima sposobnost prilagodbe većih duljina strane DNA.
Fage vektori su bakteriofagi koji se koriste za kloniranje. Postoje dvije vrste vektora faga; oni su vektor umetanja i vektor zamjene. Također, svi fagni vektori sastoje se od neesencijalnih gena. Međutim, ti se geni moraju ukloniti iz faga kako bi se omogućilo umetanje novih stranih DNA.
Što je vektor umetanja?
Prije svega, vektor za umetanje je najjednostavniji oblik lambda vektora za kloniranje. Zapravo, to je tip fagnog vektora koji ima jedinstveno restrikcijsko mjesto uvedeno unutar vektorskog genoma na mjestu izborne DNA. Nadalje, DNA faga ostaje bez uklanjanja. Ovo neuklanjanje DNK faga smanjuje veličinu umetaka (strana DNK) koje treba klonirati unutar vektora. Štoviše, ovi vektori su korisni u cDNA kloniranju i ekspresiji. GT10, GT11 i Zap primjeri su ovog vektora.
Slika 01: Lambda fag
Vektor umetanja sastoji se od jednog mjesta prepoznavanja. Primarna funkcija ovog vektora je razviti cDNA biblioteke izvedene iz eukariotskih mRNA sekvenci. Štoviše, može primiti samo duljine strane DNK u rasponu između 05-11 kb. Također, posjeduje jedinstveno mjesto cijepanja za umetanje strane DNK.
Što su zamjenski vektori?
Zamjenski vektor ili supstitucijski vektor je vrsta vektora faga koji se razvija uklanjanjem srednjeg područja 'fragmenta punila' DNK faga. Željeni strani DNK umetak zamjenjuje DNK faga.
Slika 02: Zamjenski vektor
Zamjenski vektori važni su u stvaranju genomskih biblioteka kao što su EMBL4 i Charon40. Ovi vektori mogu primiti veću duljinu strane DNA u rasponu duljina između 08-24 kb. Regija punila također se sastoji od gena koji čini vektor faga neživim unutar bakterijskog domaćina.
Koje su sličnosti između vektora umetanja i zamjene?
- Vektori umetanja i zamjene su fagni vektori.
- Oba vektora prihvaćaju umetke strane DNK.
- Obojica su od pomoći u stvaranju DNK biblioteka.
Koja je razlika između vektora umetanja i zamjene?
Umetanje vs zamjenski vektori |
|
| Insercijski vektor je vrsta fagnog vektora koji ima restrikcijsko mjesto uvedeno unutar fagnog genoma na mjestu izborne DNA. | Zamjenski vektor je vrsta fagnog vektora koji se razvija uklanjanjem srednje regije 'fragmenta punila' DNK faga |
| Veličina fragmenata za umetanje | |
| 05-11 kb duljina | 08-24 kb duljina |
| Fragment punila | |
| Bez ispune fragmenta | Ulomak punila biva zamijenjen stranim umetkom |
| Funkcija | |
| Važno za stvaranje cDNA biblioteka | Važno u stvaranju biblioteka genoma |
| Primjeri | |
| GT10, GT11 i Zap su primjeri | EMBL4 i Charon40 su primjeri |
| Mjesto cijepanja | |
| Prisutno je jedinstveno mjesto cijepanja | Mjesto cijepanja sadrži gene koji nisu bitni za litički ciklus |
Sažetak – Umetanje vs zamjenski vektori
I insercijski i zamjenski vektori dvije su vrste fagnih vektora. Oba vektora imaju restrikcijska mjesta koja olakšavaju smještaj novih stranih DNA umetaka. Insercijski vektori su važni u stvaranju cDNA biblioteka dok su zamjenski vektori važni u stvaranju genomskih biblioteka. Nadalje, vektori za umetanje prilagođavaju umetke DNA umjerene duljine. Ali zamjenski vektori mogu primiti veće duljine stranih DNA umetaka. Općenito, ovo je ključna razlika između vektora umetanja i zamjene.
