Ključna razlika između introna grupe I i grupe II je da u intronima grupe I reakciju spajanja pokreće kofaktor gvanozina, dok u intronima grupe II reakciju spajanja pokreće unutarnji adenozin.
Pre-mRNA je primarni transkript koji ima i introne i egzone. Pre-mRNA bi se trebala pretvoriti u mRNA prije translacije. RNA spajanje ili pre-mRNA spajanje jedna je takva posttranskripcijska modifikacija. U spajanju RNA, introni se uklanjaju iz molekule pre-mRNA, a egzoni se spajaju. Introni skupine I i skupine II su introni koji se sami spajaju. Oni se odvajaju od pre-mRNA molekule bez pomoći bilo kojeg drugog enzima. Stoga su oni RNA enzimi ili ribozimi koji kataliziraju vlastito spajanje iz pre-mRNA. Štoviše, imaju sposobnost funkcioniranja kao pokretni elementi. Tijekom spajanja odvija se niz reakcija trans-esterifikacije kako bi se izrezao intron i vezali egzoni. Ovi ribozimi prisutni su u sve tri domene, uključujući bakterije, arheje i eukariote.
Što su introni grupe I?
Introni grupe I vrsta su samospajajućih ribozima koji se nalaze u bakterijama, bakteriofagima i eukariotima (organelarni i nuklearni genomi). Nalaze se u bitnim genima. Oni su u stanju katalizirati vlastito spajanje iz molekule pre-mRNA. Introni skupine I mogu imati nekoliko stotina do tri tisuće nukleotida. Štoviše, pokazuju malu sličnost nizova među organizmima.
Slika 01: Introni grupe I
Sekundarne strukture su visoko očuvane u četiri kratke regije. Postoje dva koraka reakcije transesterifikacije spajanja. Introni skupine I pokreću mehanizam spajanja nukleofilnim napadom 3’ hidroksila kofaktora gvanozina na mjestu spajanja 5P.
Što su introni grupe II?
Introni grupe II vrsta su samospajajućih introna koji se nalaze u organizmima koji pripadaju svim trima domenama. Oni su ribozimi koji kataliziraju vlastite reakcije spajanja iz pre-mRNA. Nalaze se u rRNA, tRNA i genima koji kodiraju proteine. Ali oni se ne nalaze u nuklearnim genomima, za razliku od introna grupe I.
Slika 02: Introni grupe II
Introni skupine II kataliziraju spajanje putem dva koraka transesterifikacije slično intronima skupine I. Ovi enzimi pokreću reakciju spajanja nukleofilnim napadom 2' OH adenozina na mjestu grananja na 5' spoju spajanja. Tijekom reakcija spajanja, introni grupe II formiraju strukturu sličnu larijatu. Štoviše, spajanje introna odvija se u odsutnosti GTP-a.
Koje su sličnosti između introna Grupe I i Grupe II?
- Introni skupine I i skupine II dvije su vrste RNA enzima, ribozima koji kataliziraju vlastito spajanje različitim mehanizmima.
- Oni su veliki ribozimi.
- Oboje se nalazi u sve tri domene.
- Oni su mobilni elementi.
- Štoviše, nalaze se u rRNA, tRNA i genima za kodiranje proteina.
- Oba se enzima koriste kao alati u biotehnologiji i molekularnoj medicini za ciljano uništavanje/ukidanje gena, isporuku gena ili sustave genske terapije.
Koja je razlika između introna Grupe I i Grupe II?
Introni grupe I su ribozimi koji se nalaze u bakterijama, bakteriofazima i eukariotskim organelarnim i nuklearnim genomima. Introni skupine II su ribozimi koji se nalaze u bakterijama, arhejama i eukariotskim organelama. Štoviše, introni skupine I pokreću reakciju spajanja nukleofilnim napadom 3' hidroksila kofaktora gvanozina na mjestu spajanja 5P, dok introni skupine II pokreću reakciju spajanja nukleofilnim napadom 2' OH adenozina mjesta grananja na mjestu grananja. 5′ spojni spoj. Dakle, ovo je ključna razlika između introna grupe I i grupe II.
Nadalje, introni grupe II tvore strukturu sličnu larijatu tijekom spajanja dok se introni grupe I ne formiraju. Dakle, ovo je još jedna značajna razlika između introna skupine I i skupine II. Osim toga, introni skupine I nalaze se u eukariotskim nuklearnim genomima, dok se introni skupine II ne nalaze u eukariotskim nuklearnim genomima.
U nastavku infografika navodi razlike između introna grupe I i grupe II u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – Introni Grupe I protiv Grupe II
Introni Grupe I i II veliki su ribozimi koji kataliziraju reakciju transesterifikacije za izdvajanje introna iz primarnog transkripta. Nalaze se u sve tri domene. Oboje su mobilni genetski elementi. Štoviše, koriste se kao alati u biotehnologiji i molekularnoj medicini. Međutim, introni skupine I započinju reakciju spajanja nukleofilnim napadom 3′ OH gvanozinskog kofaktora na mjestu spajanja 5P. No, introni grupe II započinju reakciju spajanja nukleofilnim napadom 2' OH adenozina na mjestu grananja na 5' spoju spajanja. Štoviše, introni skupine II tvore strukturu sličnu larijatu tijekom spajanja, dok introni skupine I ne tvore strukturu sličnu larijatu. Dakle, ovo je sažetak razlika između introna grupe I i grupe II.
