Ključna razlika između fikocijanina i alofikocijanina je u tome što fikocijanin apsorbira i emitira na kraćim valnim duljinama od alofikocijanina.
Fikobiliproteini su obitelj proteina topivih u vodi koji su prisutni u cijanobakterijama i određenim vrstama algi. Fikocijanin i alofikocijanin dva su glavna člana ove obitelji.
Što je fikocijanin?
Fikocijanin je pigmentno-proteinski kompleks iz obitelji fikobiliproteina koji sakupljaju svjetlost. Drugi važni članovi ove obitelji uključuju alofikocijanin i fikoeritrin. Ovaj pigment je pomoćni pigment klorofilu. Općenito, svi fikobiliproteini su kompleksi topivi u vodi koji ne mogu postojati unutar membrana poput karotenoida. Umjesto da postoje u membranama, ovi pigmenti imaju tendenciju agregacije, tvoreći nakupine koje mogu prianjati na membrane poznate kao fikobilisomi.
Slika 01: Ekstrahirani pigmenti fikocijanina (iz cijanobakterija)
Možemo uočiti da fikocijanin ima karakterističnu svijetloplavu boju koja može apsorbirati narančasto i crveno svjetlo (blizu 620 nm) i može emitirati fluorescenciju (oko 650 nm). Ovaj pigment boje možemo pronaći u cijanobakterijama, a naziv "Phycocyanin" dolazi od grčkog značenja za "Phyco" što se odnosi na "alge" i sufiksa "cyanin" iz grčkog što znači "Kyanos" što se odnosi na "tamnoplavo".
Tipično, molekule fikocijanina dijele zajedničku strukturu sa svim fikobiliproteinima. Kada se uzme u obzir struktura ovog pigmenta, ona počinje slaganjem fikobiliproteinskih monomera. Ovi monomeri su heterodimeri koji se sastoje od alfa i beta podjedinica sa svojim odgovarajućim kromoforima. Kromofori i podjedinice povezani su tioeterskom kemijskom vezom.
Podjedinice strukture fikocijanina obično sadrže osam alfa-spirala. Monomerne strukture imaju tendenciju spontane agregacije, tvoreći trimere u obliku prstena koji imaju rotacijsku simetriju i središnji kanal. Štoviše, trimeri imaju tendenciju agregacije u parove, tvoreći heksamere kojima pomažu dodatni linker proteini. Stoga svaki fikobilizomski štapić sadrži dva ili više heksamera fikocijanina.
Što je alofikocijanin?
Alofikocijanin je proteinska molekula koja dolazi iz obitelji fikobiliproteina i pomoćni je pigment klorofilu. Ostali članovi ove obitelji fikobiliproteina koji sakupljaju svjetlost uključuju fikocijanin, fikoeritrin i fikoeritrocijanin. Pigmenti alofikocijanina mogu apsorbirati i emitirati crvenu svjetlost, a ovaj pigment lako možemo pronaći u cijanobakterijama i crvenim algama.
Slika 02: Izgled alofikocijanina u dijagramu
Alofikocijanin možemo izolirati iz raznih vrsta crvenih ili modrozelenih algi. Ove alge proizvode malo drugačije oblike molekule. Općenito, molekula alofikocijanina sadrži dvije različite podjedinice nazvane alfa i beta podjedinica. Svaka podjedinica ima jedan kromofor fikocijanobilina.
Postoje različite primjene alofikocijanina; mnogi instrumenti razvijeni su posebno za alofikocijanin. Na primjer, ova komponenta se obično koristi u imunotestovima, uključujući FACS, protočnu citometriju, itd.
Koje su sličnosti između fikocianina i alofikocijanina?
- Fikocijanin i alofikocijanin su proteini topljivi u vodi
- Obje su uključene u obitelj fikobiliproteina.
Koja je razlika između fikocianina i alofikocijanina?
Fikobiliproteini su obitelj proteina topivih u vodi koji su prisutni u cijanobakterijama i određenim vrstama algi. Fikocijanin i alofikocijanin dva su glavna člana ove obitelji. Ključna razlika između fikocijanina i alofikocijanina je u tome što fikocijanin apsorbira i emitira na kraćim valnim duljinama od alofikocijanina.
U nastavku infografika navodi više razlika između fikocijanina i alofikocijanina u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – Fikocijanin protiv alofikocijanina
Fikobiliproteini su obitelj proteina topivih u vodi koji su prisutni u cijanobakterijama i određenim vrstama algi. Fikocijanin i alofikocijanin dva su glavna člana ove obitelji. Ključna razlika između fikocijanina i alofikocijanina je u tome što fikocijanin apsorbira i emitira na kraćim valnim duljinama od alofikocijanina.
