Ključna razlika između povezivača i adaptera je u tome što povezivač nema kohezivne krajeve dok adapter ima jedan kohezivni kraj.
Ligacija DNK je proces spajanja dviju molekula DNK, tvoreći fosfodiesterske veze. Enzim nazvan DNA ligaza katalizira ovu reakciju. To je jedan od kritičnih koraka u modernim molekularno-biološkim poljima kao što su tehnologija rekombinantne DNK i kloniranje DNK. Učinkovitost ligacije ovisi o krajevima molekula DNA koje se ligiraju. Postoje dvije vrste DNK krajeva kao što su ljepljivi krajevi i tupi krajevi. Učinkovitost podvezivanja je visoka s ljepljivim krajevima nego s tupim krajevima. Ako ciljne molekule DNA imaju tupe krajeve, molekule koje se nazivaju adapteri ili povezivači bit će korisne. Adapteri i linkeri su kemijski sintetizirane oligonukleotidne molekule koje pomažu u vezivanju DNA. Imaju i interna restrikcijska mjesta. Adapter ima jedan ljepljivi i jedan tupi kraj, dok povezivač ima dva tupa kraja.
Što je Linker?
Linker je kemijski sintetizirana oligonukleotidna sekvenca koja je dvolančana. Linker ima dva tupa kraja. Linker se koristi za povezivanje molekula DNA koje imaju tupe krajeve s vektorima. Sadrži jedno ili više internih restrikcijskih mjesta. Ova restrikcijska mjesta rade kao mjesta prepoznavanja za restrikcijske enzime.
Slika 01: Linker
Nakon povezivanja, DNK se ponovno ograničava restrikcijskim enzimima kako bi se proizveli kohezivni krajevi. EcoRI-linkeri i sal-I linkeri su često korišteni linkeri.
Što je adapter?
Adapter je dvolančani slijed oligonukleotida koji se koristi za međusobno povezivanje dviju molekula DNK. To je kratka sekvenca s jednim tupim krajem i jednim ljepljivim ili kohezivnim krajem. Stoga se sastoji od jednolančanog repa na jednom kraju, što povećava učinkovitost povezivanja DNA.
Slika 02: Ligacija DNK pomoću adaptera
Štoviše, adapter ima unutarnja mjesta ograničenja. Stoga, nakon podvezivanja, DNA se može ograničiti odgovarajućim restrikcijskim enzimima kako bi se stvorio novi izbočeni kraj. Jedan nedostatak adaptera je da dva adaptera mogu formirati dimmere sparivanjem baza sa samim sobom. To se može izbjeći tretiranjem enzima koji se zove alkalna fosfataza.
Koje su sličnosti između povezivača i adaptera?
- I povezivač i adapter su dvolančani kratki oligonukleotidni nizovi.
- Oni imaju mjesta za interna ograničenja.
- Štoviše, oni su kemijski sintetizirane DNA molekule i sintetičke su molekule.
- Mogu povezati dvije molekule DNK zajedno.
- Nakon podvezivanja linkera i adaptora, DNA je ponovno ograničena restrikcijskim enzimima kako bi se proizveli ljepljivi krajevi.
Koja je razlika između povezivača i adaptera?
Povezivač je kemijski sintetizirani kratki oligonukleotidni dupleks s dva tupa kraja. Adapter je kemijski sintetizirani kratki oligonukleotidni dupleks s jednim ljepljivim i jednim tupim krajem. Dakle, ovo je ključna razlika između povezivača i adaptera. Štoviše, adapteri mogu tvoriti dimere, dok linkeri ne tvore dimere. Dakle, ovo je još jedna značajna razlika između povezivača i adaptera.
Ispod je sažetak razlika između povezivača i adaptera u tabelarnom obliku.
Sažetak – Linker vs Adaptor
Linker i adapter dvije su vrste kemijski sintetiziranih oligonukleotida koji su korisni u povezivanju DNA s tupim krajevima. Linker ima dva tupa kraja, dok adapter ima jedan tupi i jedan kohezivni kraj. Dakle, ovo je ključna razlika između povezivača i adaptera. To su dvolančane molekule koje imaju unutarnja restrikcijska mjesta. Naširoko se koriste u tehnologiji rekombinantne DNK i kloniranju DNK.
