Ključna razlika između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze je ta što je restrikcijska endonukleaza enzim nukleaza koji prepoznaje specifičnu sekvencu DNK i cijepa DNK unutar ili uz tu sekvencu, dok je egzonukleaza enzim nukleaza koji cijepa nukleotide u polinukleotid s 5' kraja ili 3' kraja jedan po jedan.
Nukleaze su enzimi koji cijepaju fosfodiesterske veze između nukleotida nukleinskih kiselina. U živim organizmima oni su ključni alati za mnoge aspekte popravka DNK u stanici. Defekti ovih enzima mogu uzrokovati genetsku nestabilnost i imunodeficijenciju. Restrikcijske nukleaze su specifične nukleaze čije funkcioniranje ovisi o specifičnoj sekvenci nukleotida. Primjer je restrikcijska endonukleaza. Postoji osnovna klasifikacija nukleaza na temelju mjesta aktivnosti, kao što su endonukleaza i egzonukleaza. Endonukleaza probavlja regije u sredini ciljne DNA molekule. Egzonukleaza probavlja nukleinske kiseline s krajeva. Stoga su restrikcijska endonukleaza i egzonukleaza dvije vrste enzima nukleaza.
Što je restrikcijska endonukleaza?
Restrikcijska endonukleaza je enzim nukleaza koji prepoznaje specifičnu DNK sekvencu i cijepa DNK unutar ili uz tu sekvencu. Specifična sekvenca DNK poznata je kao restrikcijsko mjesto. Također se naziva restrikcijski enzim ili restriktaza. Restrikcijska endonukleaza je vrlo specifičan enzim. To je jedna klasa šire skupine endonukleaza enzima. Restrikcijske endonukleaze obično se klasificiraju u pet tipova, koji se razlikuju po svojoj strukturi i sposobnosti rezanja DNA supstrata na mjestu prepoznavanja. Pet tipova su tip I, tip II, tip III, tip IV i tip V.
Slika 01: Restrikcijska endonukleaza
Restrikcijske endonukleaze obično se nalaze u bakterijama i arhejama. Oni pružaju obrambeni mehanizam bakterija protiv virusa. Postoji više od 3600 poznatih restrikcijskih endonukleaza. Oni predstavljaju preko 250 različitih specifičnosti. Više od 3000 njih je detaljno proučeno. Nadalje, više od 800 njih dostupno je komercijalno.
Što je Exonuclease?
Egzonukleaza je enzim nukleaza koji cijepa nukleotide u polinukleotidu s 5’ kraja ili 3’ kraja jedan po jedan. To se događa reakcijom hidrolize koja prekida fosfodiesterske veze između nukleotida na kraju. Eukarioti i prokarioti imaju tri vrste egzonukleaza. Ove egzonukleaze sudjeluju u normalnom prometu mRNA. To su 5’ do 3’ egzonukleaza (Xrn1), 3’ do 5’ egzonukleaza i poli-A specifična 3’ do 5’ egzonukleaza. 5’ do 3’ egzonukleaza je ovisan dekapirajući protein. 3’ do 5’ egzonukleaza je neovisni protein. Poli A specifična 3’ do 5’ egzonukleaza također je poznata kao poli-A specifična ribonukleaza uključena u egzonukleolitičku razgradnju poli-A repa.
Slika 02: Egzonukleaza
I kod arheja i kod eukariota, razgradnju RNA izvodi višeproteinski egzosomski kompleks koji se sastoji od 3’ do 5’ egzoribonukleaza.
Koje su sličnosti između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze?
- Restrikcijska endonukleaza i egzonukleaza dvije su vrste enzima nukleaza.
- Oba enzima režu molekule DNK.
- Ovi enzimi se nalaze u prokariotima.
- Oni su proteini.
Koja je razlika između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze?
Restrikcijska endonukleaza je enzim nukleaza koji prepoznaje specifičnu sekvencu DNA i cijepa DNA unutar ili uz tu sekvencu, dok je egzonukleaza enzim nukleaza koji cijepa nukleotide u polinukleotidu s 5' ili 3' kraja jedan po jedan. Dakle, ovo je ključna razlika između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze. Štoviše, restrikcijska endonukleaza nalazi se samo kod prokariota, dok se egzonukleaza nalazi i kod prokariota i kod eukariota.
Sljedeća infografika navodi razlike između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – Restrikcijska endonukleaza vs egzonukleaza
Nukleaze su enzimi koji razbijaju fosfodiesterske veze između nukleotida nukleinskih kiselina. Restrikcijska endonukleaza i egzonukleaza dvije su vrste enzima nukleaza. Restrikcijska endonukleaza je enzim nukleaza koji prepoznaje specifičnu sekvencu DNA i cijepa DNA unutar ili uz tu sekvencu. Egzonukleaza je enzim nukleaza koji cijepa nukleotide u polinukleotidu s njihovog 5' kraja ili 3' kraja jedan po jedan. Dakle, ovo sažima razliku između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze.
