Ključna razlika između molekularnog spajanja i bodovanja je u tome što je spajanje tehnika koja se koristi za određivanje afiniteta vezanja između dviju molekula, dok je bodovanje proces evaluacije određene poze brojanjem broja povoljnih međumolekularnih interakcija.
Pojmovi molekularno spajanje i bodovanje koriste se u području molekularnog modeliranja. Molekularno modeliranje je tehnika koja se koristi za određivanje mogućih rasporeda različitih molekula u određenoj tvari. Ova tehnika je važna u stvaranju novih stabilnih spojeva.
Što je molekularno spajanje?
Molekularno spajanje je računalna simulacija vezanja kandidata za ligand na receptor. Ova metoda predviđa poželjnu orijentaciju jedne molekule prema drugoj molekuli kada se međusobno vežu u stabilan kompleks. Rezultati dobiveni ovom tehnikom mogu se koristiti za predviđanje snage asocijacije ili afiniteta vezanja između dviju molekula. Ovdje je također važna funkcija molekularnog bodovanja.
Slika 01: Jednostavan dijagram koji prikazuje proces molekularnih interakcija u biološkim sustavima
Općenito, ova tehnika razmatra biološki relevantne molekule kao što su proteini, peptidi, nukleinske kiseline, ugljikohidrati i lipidi. Te su molekule vrlo važne i igraju važnu ulogu u mehanizmima prijenosa signala u našem tijelu. Stoga, orijentacija dviju molekula koje će se vezati za ovaj proces transdukcije signala utječe na vrstu signala koji se ovdje proizvodi. To znaci; molekularno spajanje važno je u određivanju i snage i vrste signala proizvedenog tijekom transdukcije signala u biološkim sustavima.
Štoviše, tehnike molekularnog spajanja važne su u dizajniranju strukturno utemeljenih lijekova. To je zbog njegove predvidljivosti konformacije vezanja malih molekula kao što su ligandi na odgovarajuće mjesto vezivanja.
Što je molekularno bodovanje?
Molekularno bodovanje je vrsta matematičke funkcije koja je korisna u procjeni napretka molekularnog spajanja. U području računalne kemije, funkcije bodovanja koriste se za predviđanje afiniteta vezanja između dviju molekula nakon procesa spajanja. Na primjer, ako imamo malu molekulu čestičnog lijeka i postoji biološka meta kao što je protein, možemo procijeniti afinitet lijeka prema veznom mjestu. Štoviše, molekularno bodovanje može se koristiti za predviđanje međumolekularnih interakcija između dva proteina ili između proteina i molekula DNA.
Slika 02: Funkcija bodovanja ukratko
Glavna primjena molekularnog bodovanja je u procesima dizajniranja lijekova - na primjer, virtualni probir, de novo dizajniranje, optimizacija olova itd.
Koja je razlika između molekularnog spajanja i bodovanja?
Molekularno spajanje i bodovanje važni su u molekularnom modeliranju. Ključna razlika između molekularnog spajanja i bodovanja je u tome što je spajanje tehnika koja se koristi za određivanje afiniteta vezanja između dviju molekula, dok je bodovanje proces evaluacije određene poze brojanjem broja povoljnih međumolekularnih interakcija.
Sljedeća infografika sažima razliku između molekularnog spajanja i bodovanja.
Sažetak – Molekularno spajanje nasuprot bodovanju
Molekularno spajanje i bodovanje važni su u molekularnom modeliranju. Ključna razlika između molekularnog spajanja i bodovanja je u tome što je spajanje tehnika koja se koristi za određivanje afiniteta vezanja između dviju molekula, dok je bodovanje proces evaluacije određene poze brojanjem broja povoljnih međumolekularnih interakcija.
