Ključna razlika između kvasca jedan hibrid i kvasca dva hibrida je u tome što je kvasac jedan hibrid in vitro test za analizu interakcija DNA-proteina, dok je kvasac dva hibrid in vitro test za analizu interakcija protein-protein.
Proučavanje interakcija između staničnih molekula može pomoći u definiranju mjesta prepoznavanja uključenih u ekspresiju gena i puteve proteina. Interakcije DNA i proteina sastavni su dio staničnih procesa kao što su modifikacije DNA i regulacija transkripcije, itd. S druge strane, interakcije proteina i proteina igraju vitalnu ulogu u staničnim procesima kao što su replikacija, transkripcija, translacija i prijenos signala. Stoga je kritično važno identificirati ove interakcije staničnih molekula kroz različite testove. Kvasac jedan hibrid i kvasac dva hibrida dva su in vitro testa za analizu interakcija DNA-protein i protein-protein.
Što je Yeast One Hybrid?
Yeast one hybrid (Y1H) in vitro je test za analizu unutarstaničnih interakcija DNA i proteina. Ovu su metodu prvi uspostavili Wang i Reed 1993. Od tada je pokazala veću moć u biološkim istraživanjima. U ovom testu postoje dvije glavne komponente: DNK mamac i proteinski plijen.
Slika 01: Yeast One Hybrid
U postupku se DNK sekvenca (DNK mamac) prvo klonira uzvodno od dva različita reportera (HIS3, LacZ). Ovi reporterski konstrukti integrirani su u genom soja kvasca. Transkripcijski faktori se uzimaju kao proteinski plijen. Transkripcijski faktori spojeni su s transkripcijskom aktivacijskom domenom (AD) transkripcijskog faktora Gal4 kvasca kako bi se stvorili hibridni proteini. Cijeli ovaj hibridni protein integriran je u plazmid prije nego što se uvede u soj kvasca. Nakon uvođenja rekombinantnog plazmida, kada transkripcijski čimbenik stupi u interakciju s fragmentom DNA, dio AD aktivira ekspresiju reporterskog gena (HIS3 ili LacZ). Sekvenciranje plazmida omogućuje identifikaciju transkripcijskog faktora koji se može vezati na fragment DNA. Nedavno je kvasac jedna hibridna metoda korištena za istraživanje dijagnoze bolesti. Stoga će se u budućnosti ovaj test sve više koristiti u znanstvenim istraživanjima i medicinskim tretmanima.
Što je Yeast Two Hybrid?
Yeast two hybrid (Y2H) in vitro je test za analizu unutarstaničnih proteina i interakcija proteina. Ovu su metodu izvorno otkrili Stanley Fields i Ok-Kyu Song 1989. Ova tehnika otkriva interakcije protein-protein pomoću Gal4 transkripcijskog faktora kvasca.
Slika 02: Kvasac dva hibrida
U ovoj metodi prvo se konstruiraju dvije fuzije (hibridi) korištenjem proteina od interesa: spajanjem jednog proteina s DNA veznom domenom (DBD) i spajanjem drugog proteina s aktivatorskom domenom (AD) transkripcijskog faktora Gal4. Protein spojen s DBD poznat je kao mamac, dok je protein spojen s AD poznat kao plijen. U soju kvasca, nakon interakcije mamca i plijena, DBD i AD se približavaju kako bi se stvorio funkcionalni faktor transkripcije Gal4 uzvodno od reporterskog gena. Funkcionalni transkripcijski faktor aktivira ekspresiju reporterskog gena. Nadalje, ova se metoda trenutno koristi za ispitivanje interakcija integralnih membranskih proteina u stanicama sisavaca.
Koje su sličnosti između kvasca jedan hibrid i kvasca dva hibrida?
- Kvasac jedan hibrid i kvasac dva hibrida dva su in vitro testa za analizu interakcija DNA-protein i protein-protein.
- Ovi testovi koriste sojeve kvasca.
- Oba testa koriste aktivacijsku domenu (AD) faktora transkripcije Gal4.
- Oni koriste ekspresiju reporterskog gena (HIS3 ili LacZ) za otkrivanje interakcija.
- Imaju mamac i plijen.
- Oba su testa vrlo korisna u modernim biološkim istraživanjima.
Koja je razlika između kvasca jedan hibrid i kvasca dva hibrida?
Yeast one hybrid in vitro je analiza za analizu interakcija DNK i proteina, dok je kvasac dva hibrida in vitro analiza za analizu proteina i interakcija proteina. Dakle, ovo je ključna razlika između kvasca jedan hibrid i kvasca dva hibrida. Nadalje, kod jednog hibrida kvasca mamac je fragment DNA, a plijen je molekula proteina. S druge strane, kod dva hibrida kvasca, i mamac i plijen su proteinske molekule.
Donja infografika navodi razlike između kvasca jedan hibrid i kvasca dva hibrida u obliku tablice za usporedbu.
Sažetak – Kvasac jedan hibrid protiv kvasca dva hibrida
Kvasac jedan hibrid i kvasac dva hibrida dva su važna in vitro testa. Kvasac jedan hibrid in vitro je test za analizu interakcija DNK i proteina, dok je kvasac dva hibrid in vitro test za analizu proteina i interakcija proteina. Dakle, ovo je ključna razlika između kvasca jedan hibrid i kvasca dva hibrida.
