Ključna razlika između T4 DNA ligaze i E. coli DNA ligaze je u tome što je T4 DNA ligaza enzim koji je izoliran iz bakteriofaga T4 dok je E. coli DNA ligaza enzim koji je izoliran iz bakterije E. coli.
DNA ligaza je specifična vrsta enzima koji olakšava spajanje DNA lanaca stvaranjem fosfodiesterske veze. Ima važnu ulogu popravljajući jednolančane lomove i dvolančane lomove u DNK živih organizama. Štoviše, DNA ligaza se koristi i za popravak DNA i za replikaciju DNA. Osim gore navedenih uporaba, DNA ligaza također ima široku primjenu u eksperimentima molekularne biologije kao što je tehnologija rekombinantne DNA. T4 DNA ligaza i E. coli DNA ligaza dvije su vrste enzima DNA ligaze.
Što je T4 DNA ligaza?
T4 ligaza je enzim za spajanje DNA koji je izoliran iz bakteriofaga T4. T4 bakteriofag je virus koji inficira Escherichiu coli. Enzim T4 ligaza je najčešće korištena DNA ligaza u molekularno biološkim laboratorijskim istraživanjima. Normalno, T4 ligaza katalizira spajanje dviju kohezivnih niti s tupim krajevima dvolančane DNA između 5’ fosfatne i 3’ hidroksilne skupine susjednih nukleotida. Također može katalizirati spajanje RNK na lanac DNK ili RNK u dupleksnoj molekuli. Međutim, ovaj enzim neće spajati jednolančane nukleinske kiseline. Štoviše, također može povezivati DNA s tupim krajevima s puno većom učinkovitošću od ligaze DNA E. coli.
Slika 01: T4 DNA ligaza
Ovaj enzim zahtijeva ATP kao kofaktor. Neki istraživački eksperimenti genetskog inženjeringa već su proizveli aktivnije enzime DNA ligaze od divljeg tipa T4 DNA ligaze. U jednom od pristupa, stvorili su molekulu fuzijskog enzima spajanjem T4 DNA ligaze na p50 ili NF-kB molekulu. Ovaj novi enzim T4 ligaza bio je 160% aktivniji u podvezivanju tupih krajeva u svrhu kloniranja od divljeg tipa T4 DNA ligaze. Nadalje, optimalna temperatura za T4 DNA ligazu da preciznije katalizira reakciju ligacije je 16 °C.
Što je E Coli DNK ligaza?
E. coli DNA ligaza je enzim koji je izoliran iz bakterije E. coli. Gen odgovoran za stvaranje DNA ligaze E. coli je lig gen. E. coli DNA, ligaza kao i većina prokariotske DNA ligaze, koriste energiju koju dobiva NAD (nikotinamid adenin dinukleotid) za stvaranje fosfodiesterske veze.
Slika 02: E. Coli DNK ligaza
E. coli DNA ligaza je ligacijski enzim koji može spajati fragmente DNA katalizirajući stvaranje fosfodiesterskih veza između dvolančanih fragmenata DNA koji sadrže 5’ fosfatne krajeve i 3’ hidroksilne krajeve. Štoviše, ne veže DNA s tupim krajevima osim pod posebnim uvjetima kao što je molekularna gužva s polietilen glikolom. Također ne može učinkovito spojiti RNA na DNA. Nadalje, aktivnost DNA ligaze E. coli može se pojačati prisutnošću DNA polimeraze 1 u pravoj koncentraciji. Međutim, kada je koncentracija enzima DNA polimeraze 1 veća, to ima negativne učinke na aktivnost DNA ligaze E. coli.
Koje su sličnosti između T4 DNA ligaze i E Coli DNA ligaze?
- T4 DNA ligaza i E-coli DNA ligaza dvije su vrste enzima DNA ligaze.
- Oba su proteini koji se sastoje od aminokiselina.
- Ovi enzimi kataliziraju stvaranje fosfodiesterske veze između jukstaponiranih 5’ fosfatnih i 3’ hidroksilnih završetaka u dupleksnoj DNA.
- Imaju široku primjenu u eksperimentima molekularne biologije kao što je tehnologija rekombinantne DNK.
Koja je razlika između T4 DNA ligaze i E Coli DNA ligaze?
T4 DNA ligaza je enzim koji je izoliran iz bakteriofaga T4 dok je E. coli DNA ligaza enzim koji je izoliran iz bakterije E. coli. Dakle, ovo je ključna razlika između T4 DNA ligaze i E. coli DNA ligaze. Nadalje, izvor energije za T4 DNA ligazu je ATP. S druge strane, izvor energije za E. coli DNA ligazu je NAD.
Infografika u nastavku predstavlja razlike između T4 DNA ligaze i E coli DNA ligaze u tabličnom obliku za usporedbu.
Sažetak – T4 DNA ligaza protiv E Coli DNA ligaze
T4 DNA ligaza i E. coli DNA ligaza dva su enzima koji kataliziraju stvaranje fosfodiesterske veze između postavljenih 5’ fosfatnih i 3’ hidroksilnih krajeva u dupleksnoj DNA. T4 ligaza je enzim koji je izoliran iz bakteriofaga T4 dok je DNA ligaza E. coli enzim koji je izoliran iz bakterije E. coli. Dakle, ovo je ključna razlika između T4 DNA ligaze i E coli DNA ligaze.
